More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0059 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0059  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  100 
 
 
151 aa  305  2.0000000000000002e-82  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.230525 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0567  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  47.3 
 
 
147 aa  131  3e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0210  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.87 
 
 
154 aa  124  4.0000000000000003e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103934  normal  0.61486 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0617  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  50 
 
 
158 aa  116  9.999999999999999e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.217435 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0606  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  47.52 
 
 
156 aa  115  1.9999999999999998e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000101189  hitchhiker  0.000000768083 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0802  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45.62 
 
 
152 aa  115  3e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.964553  normal  0.826959 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1018  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.14 
 
 
161 aa  109  2.0000000000000002e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0204  type IV pilus assembly protein PilE  39.74 
 
 
155 aa  107  7.000000000000001e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.2 
 
 
168 aa  105  3e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1548  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.67 
 
 
167 aa  103  6e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  hitchhiker  0.00000000000000294624 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.61 
 
 
169 aa  103  7e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0668  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.77 
 
 
155 aa  103  9e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000136734 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1097  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  46.31 
 
 
151 aa  103  1e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.282151  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.75 
 
 
163 aa  102  2e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.253002  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0482  general secretion pathway protein G  68.06 
 
 
171 aa  100  6e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00144077  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40 
 
 
157 aa  99.4  1e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0651  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.38 
 
 
165 aa  98.2  4e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0216  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  65.79 
 
 
163 aa  95.5  2e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0379234 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0765  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  68.42 
 
 
170 aa  95.1  3e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000473938  hitchhiker  1.49827e-16 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0613  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  41.22 
 
 
165 aa  94.4  5e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0934015 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0571  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40 
 
 
163 aa  93.6  8e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0015  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  65.38 
 
 
193 aa  93.6  8e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.170754  normal  0.192574 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0096  hypothetical protein  67.57 
 
 
163 aa  92.8  1e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.062594 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0345  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  47.2 
 
 
156 aa  92.8  1e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996245  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1487  fimbrial protein EcpC precursor  44 
 
 
164 aa  93.2  1e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0651614  normal  0.606044 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1387  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  66.67 
 
 
175 aa  93.2  1e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1371  hypothetical protein  39.88 
 
 
174 aa  93.2  1e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0807  hypothetical protein  67.12 
 
 
182 aa  92.4  2e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000505152 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1442  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  58.23 
 
 
155 aa  90.5  7e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.102563  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0349  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  62.86 
 
 
179 aa  89.7  1e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875622  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1261  hypothetical protein  61.84 
 
 
168 aa  89.7  1e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0093  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  60.53 
 
 
169 aa  89.7  1e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0563183 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1161  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.94 
 
 
157 aa  88.6  3e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1524  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  67.57 
 
 
159 aa  88.6  3e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000584644  unclonable  2.6975300000000003e-19 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0331  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  62.16 
 
 
172 aa  86.7  9e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0788  putative pilus assembly protein major pilin PilA  64.38 
 
 
79 aa  86.7  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0173637  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  59.49 
 
 
152 aa  85.5  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0057  hypothetical protein  38.46 
 
 
169 aa  83.2  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.266791 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0475  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.31 
 
 
171 aa  83.2  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1436  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  56.58 
 
 
171 aa  83.2  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1421  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  38.73 
 
 
172 aa  82.8  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0779  hypothetical protein  61.64 
 
 
136 aa  83.2  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0800  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  58.11 
 
 
167 aa  82.8  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.346386  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0265  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  60.53 
 
 
166 aa  83.6  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.319115  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0340  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  56.67 
 
 
165 aa  83.2  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1495  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  67.14 
 
 
167 aa  82  0.000000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.70798  normal  0.112729 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0449  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  58.23 
 
 
167 aa  82  0.000000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000146857  hitchhiker  0.0000000193676 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0682  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40 
 
 
165 aa  81.3  0.000000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0723462  hitchhiker  0.000000000174273 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1488  hypothetical protein  41.1 
 
 
158 aa  79  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.109192  normal  0.403243 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0495  fimbrial protein EcpC precursor  66.67 
 
 
172 aa  77.8  0.00000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.014346  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0612  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  56.25 
 
 
161 aa  77  0.00000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0926  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  60 
 
 
171 aa  74.3  0.0000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000619994  hitchhiker  8.71814e-18 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0392  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  60.29 
 
 
175 aa  73.2  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000336485  hitchhiker  0.0000000727713 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0548  hypothetical protein  54.17 
 
 
169 aa  72  0.000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1058  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  68.52 
 
 
176 aa  70.9  0.000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.110537  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1217  type IV pilus biogenesis protein PilE  38.61 
 
 
141 aa  68.6  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1096  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  78.57 
 
 
157 aa  66.2  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.292656  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  46.34 
 
 
141 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0345  general secretion pathway protein H  44.87 
 
 
176 aa  65.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177644  normal  0.0749297 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0933  hypothetical protein  57.63 
 
 
527 aa  65.1  0.0000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000356044  hitchhiker  0.000000000476431 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0535  hypothetical protein  57.63 
 
 
634 aa  64.7  0.0000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000025366  normal  0.911782 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0274  general secretion pathway protein H  64.81 
 
 
174 aa  64.7  0.0000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.560285  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0872  general secretion pathway protein H  52.46 
 
 
152 aa  64.7  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.854476  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0526  hypothetical protein  34.42 
 
 
158 aa  64.7  0.0000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000137512  normal  0.350549 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0148  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  62.75 
 
 
174 aa  64.3  0.0000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1299  Type IV pilus biogenesis protein PilE  45.07 
 
 
128 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.799661 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58730  type IV pilin structural subunit  39.42 
 
 
179 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.279942  normal  0.457351 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3031  methylation site containing protein  33.64 
 
 
133 aa  61.6  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1507  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.18 
 
 
121 aa  61.2  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000010883  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0669  fimbrial protein EcpC precursor  76.19 
 
 
48 aa  60.8  0.000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3227  type IV pilus biogenesis protein PilE  50 
 
 
130 aa  60.5  0.000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1062  type IV pilus biogenesis protein PilE  50 
 
 
130 aa  60.5  0.000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2413  type II secretion system protein G  58.82 
 
 
149 aa  60.5  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330838  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0681  hypothetical protein  53.85 
 
 
567 aa  60.1  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000227256 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1078  pilin  44.19 
 
 
162 aa  60.1  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.18456 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1164  type IV pilus biogenesis protein PilE  48.39 
 
 
130 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.536283 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1129  type IV pilus biogenesis protein PilE  46.97 
 
 
130 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0692  hypothetical protein  51.56 
 
 
548 aa  59.3  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000140435  unclonable  7.26108e-19 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1067  methylation site containing protein  37.21 
 
 
130 aa  58.9  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0260  pilin polypeptide  55 
 
 
187 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3584  fimbrial protein PilA  43.3 
 
 
176 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.194411  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2522  pilin  43.3 
 
 
176 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3128  methylation site containing protein  37.8 
 
 
132 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.932633 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0263  pilin polypeptide  46.27 
 
 
178 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1091  methylation site containing protein  45.45 
 
 
130 aa  58.5  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1230  hypothetical protein  52.05 
 
 
178 aa  58.5  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2882  methylation site containing protein  35.56 
 
 
138 aa  58.2  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1202  type IV pilus biogenesis protein PilE  40.28 
 
 
130 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0852  methylation site containing protein  38.96 
 
 
131 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3170  methylation site containing protein  38.96 
 
 
131 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2663  type IV pilus biogenesis protein PilE  38.46 
 
 
142 aa  57.8  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1265  methylation  56.52 
 
 
160 aa  57.4  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00964428  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2916  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  41.89 
 
 
145 aa  57  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0480  pilin subfamily protein  41.25 
 
 
174 aa  57.4  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2680  type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  41.25 
 
 
146 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0580057 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0376  hypothetical protein  63.41 
 
 
174 aa  56.2  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000272235  hitchhiker  0.0000000000782624 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3356  fimbrial protein pilin: general secretion pathway protein H  38.64 
 
 
137 aa  56.6  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.669833  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2612  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 
153 aa  56.6  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.688921 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4674  methylation  61.9 
 
 
169 aa  57  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0463  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  35.63 
 
 
167 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>