More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_2564 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_2564  hypothetical protein  100 
 
 
177 aa  367  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.569226 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3549  type 4 prepilin-like protein  98.87 
 
 
177 aa  362  1e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5269  general secretory pathway protein  44.1 
 
 
192 aa  130  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0263  pilin polypeptide  41.94 
 
 
178 aa  69.3  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3584  fimbrial protein PilA  43.75 
 
 
176 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.194411  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2522  pilin  43.75 
 
 
176 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  48.61 
 
 
157 aa  65.9  0.0000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0933  hypothetical protein  43.75 
 
 
186 aa  65.5  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0960  hypothetical protein  43.75 
 
 
186 aa  65.5  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0936  general secretion pathway protein  36.36 
 
 
155 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.898049 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0567  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.42 
 
 
147 aa  61.2  0.000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0613  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  33.33 
 
 
165 aa  61.2  0.000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0934015 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0802  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45.45 
 
 
152 aa  61.2  0.000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.964553  normal  0.826959 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0449  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45.57 
 
 
167 aa  60.1  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000146857  hitchhiker  0.0000000193676 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1432  type II secretion systen protein G  31.3 
 
 
209 aa  60.1  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.412586  normal  0.909605 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0345  general secretion pathway protein H  31.19 
 
 
176 aa  60.1  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177644  normal  0.0749297 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1442  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  40.58 
 
 
155 aa  58.9  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.102563  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0495  fimbrial protein EcpC precursor  43.75 
 
 
172 aa  58.9  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.014346  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.08 
 
 
168 aa  59.3  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0617  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.91 
 
 
158 aa  58.5  0.00000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.217435 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0260  pilin polypeptide  43.06 
 
 
187 aa  58.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  42.67 
 
 
141 aa  58.5  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0265  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.44 
 
 
166 aa  58.5  0.00000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.319115  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0210  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  29.32 
 
 
154 aa  58.2  0.00000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103934  normal  0.61486 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1548  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.65 
 
 
167 aa  58.2  0.00000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  hitchhiker  0.00000000000000294624 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1343  general secretion pathway protein G  33.06 
 
 
160 aa  57.8  0.00000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.657967  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1199  hypothetical protein  39.06 
 
 
221 aa  57.8  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.789092  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0392  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.06 
 
 
175 aa  57.8  0.00000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000336485  hitchhiker  0.0000000727713 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1488  hypothetical protein  47.27 
 
 
158 aa  57.4  0.00000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.109192  normal  0.403243 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3030  general secretion pathway protein G  29.17 
 
 
139 aa  57.8  0.00000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.187173  hitchhiker  0.00937307 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1161  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.67 
 
 
157 aa  57.4  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3179  general secretion pathway protein G  36.36 
 
 
152 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.223664  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1524  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.24 
 
 
159 aa  57.4  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000584644  unclonable  2.6975300000000003e-19 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1096  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  48.28 
 
 
157 aa  56.6  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.292656  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1073  general secretion pathway protein G  26.54 
 
 
155 aa  57  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.56277  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2886  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  33.71 
 
 
170 aa  57  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.308484  normal  0.94282 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3391  general secretion pathway protein G  36.11 
 
 
156 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0093  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.08 
 
 
169 aa  56.2  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0563183 
 
 
-
 
NC_003296  RS00346  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  30 
 
 
144 aa  55.8  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.887338  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0253  general secretion pathway protein G  31.25 
 
 
150 aa  55.8  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45.9 
 
 
169 aa  55.8  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0096  hypothetical protein  32.73 
 
 
163 aa  55.8  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.062594 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16150  General secretion pathway protein G  28.57 
 
 
145 aa  56.2  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.853983  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0482  general secretion pathway protein G  35.48 
 
 
171 aa  55.8  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00144077  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1081  general secretion pathway protein G  26.32 
 
 
146 aa  55.5  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464773  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2449  Fimbrial protein pilin  31.4 
 
 
162 aa  55.1  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000426279  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0606  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  29.61 
 
 
156 aa  55.1  0.0000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000101189  hitchhiker  0.000000768083 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3736  hypothetical protein  43.84 
 
 
219 aa  55.1  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  37.33 
 
 
142 aa  55.1  0.0000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3074  general secretion pathway protein G  28.87 
 
 
158 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000016497 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3940  general secretion pathway protein G  27.14 
 
 
154 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.18178 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07011  hypothetical protein  36.36 
 
 
208 aa  54.7  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.212398  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3221  general secretion pathway protein G  28.57 
 
 
163 aa  54.7  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0476  methylation site containing protein  50 
 
 
141 aa  54.7  0.0000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.991113  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02970  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  31.4 
 
 
144 aa  54.3  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0455058  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3218  general secretion pathway protein G  32.81 
 
 
126 aa  54.7  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.427151 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0668  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  32.32 
 
 
155 aa  54.3  0.0000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000136734 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3221  general secretion pathway protein G  38.36 
 
 
156 aa  54.3  0.0000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.287852 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1387  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  46.55 
 
 
175 aa  54.3  0.0000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02835  hypothetical type II secretion protein GspG  31.82 
 
 
151 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000370073  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1097  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.86 
 
 
151 aa  53.9  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.282151  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0682  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.03 
 
 
165 aa  53.9  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0723462  hitchhiker  0.000000000174273 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4497  general secretion pathway protein G  27.78 
 
 
154 aa  53.9  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.13255 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02785  hypothetical protein  31.82 
 
 
151 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000404727  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3135  general secretion pathway protein G  31.82 
 
 
151 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3244  general secretion pathway protein GspG  31.82 
 
 
151 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.948956  normal  0.749494 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3424  general secretion pathway protein G  31.82 
 
 
151 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0216  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.86 
 
 
163 aa  53.9  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0379234 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  30.47 
 
 
152 aa  53.9  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1565  N-terminal methylation domain-containing protein  39.71 
 
 
191 aa  53.9  0.000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3182  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  44 
 
 
194 aa  53.5  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0779  hypothetical protein  34.62 
 
 
136 aa  53.1  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2590  general secretion pathway protein G  40.98 
 
 
154 aa  53.1  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0345  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  28.48 
 
 
156 aa  53.5  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996245  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3044  general secretion pathway protein G  36 
 
 
159 aa  53.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.21279  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3409  general secretion pathway protein GspG  32.53 
 
 
151 aa  52.8  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  36 
 
 
142 aa  53.1  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0102  general secretion pathway protein G  35.71 
 
 
149 aa  52.8  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.573705  normal  0.0126574 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1278  general secretion pathway protein G  36.92 
 
 
147 aa  53.1  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3106  putative general secretion pathway G transmembrane protein  29.55 
 
 
156 aa  52.8  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.590033  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0964  pilin, putative  28.43 
 
 
187 aa  52.4  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0885526  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1316  type II secretory pathway protein LspG  29.25 
 
 
140 aa  52.8  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1313  type II secretory pathway protein LspG  29.25 
 
 
140 aa  52.8  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0788  putative pilus assembly protein major pilin PilA  39.39 
 
 
79 aa  52.8  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0173637  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0788  fimbrial protein pilin  36.56 
 
 
163 aa  52.4  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.684386  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5689  general secretion pathway protein G  28.35 
 
 
158 aa  52.4  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128164  normal  0.128064 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0224  general secretion pathway protein G  28.17 
 
 
150 aa  52.4  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0011  general secretion pathway protein G  28.17 
 
 
150 aa  52.4  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3384  general secretion pathway protein G  28.1 
 
 
154 aa  52.8  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4713  general secretion pathway protein G  42.37 
 
 
166 aa  52.4  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0012  general secretion pathway protein G  38.98 
 
 
150 aa  52.4  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0059  general secretion pathway protein G  38.98 
 
 
150 aa  52.4  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3326  pilin, putative  28.43 
 
 
187 aa  52.4  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0266287  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0058  general secretion pathway protein G  38.98 
 
 
150 aa  52.4  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109015  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1066  pilin, putative  28.43 
 
 
187 aa  52.4  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00196226  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0012  general secretion pathway protein G  28.17 
 
 
150 aa  52.4  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0100  general secretion pathway protein G  30.21 
 
 
144 aa  52.4  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0077  general secretion pathway protein G  38.98 
 
 
150 aa  52.4  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1033  pilin, putative  28.43 
 
 
187 aa  52.4  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0234716  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3514  general secretion pathway protein G  28.17 
 
 
150 aa  52.4  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.957184  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>