More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0800 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0800  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  100 
 
 
167 aa  347  6e-95  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.346386  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0204  type IV pilus assembly protein PilE  41.88 
 
 
155 aa  104  5e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0210  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.59 
 
 
154 aa  102  3e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103934  normal  0.61486 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0345  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.97 
 
 
156 aa  101  4e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996245  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1487  fimbrial protein EcpC precursor  43.42 
 
 
164 aa  100  7e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0651614  normal  0.606044 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1387  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.36 
 
 
175 aa  98.6  4e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1018  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.22 
 
 
161 aa  97.4  8e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1161  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.11 
 
 
157 aa  95.5  3e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0015  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40 
 
 
193 aa  95.1  4e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.170754  normal  0.192574 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0617  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  60.81 
 
 
158 aa  94  9e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.217435 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0668  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.25 
 
 
155 aa  93.6  1e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000136734 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0567  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.61 
 
 
147 aa  93.2  1e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0216  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  58.14 
 
 
163 aa  92.8  2e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0379234 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  65.33 
 
 
169 aa  92.8  2e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.29 
 
 
163 aa  90.9  7e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.253002  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0331  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  62.67 
 
 
172 aa  90.9  8e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0765  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.8 
 
 
170 aa  90.5  1e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000473938  hitchhiker  1.49827e-16 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0340  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.04 
 
 
165 aa  89  3e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0093  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  57.33 
 
 
169 aa  89  3e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0563183 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1097  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  48.54 
 
 
151 aa  88.2  4e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.282151  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0571  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  57.65 
 
 
163 aa  88.2  5e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0096  hypothetical protein  40.99 
 
 
163 aa  87  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.062594 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0802  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.67 
 
 
152 aa  86.7  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.964553  normal  0.826959 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1524  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.7 
 
 
159 aa  84.7  5e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000584644  unclonable  2.6975300000000003e-19 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0612  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.11 
 
 
161 aa  84.7  6e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0606  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  50.53 
 
 
156 aa  83.2  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000101189  hitchhiker  0.000000768083 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0807  hypothetical protein  56.1 
 
 
182 aa  83.6  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000505152 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0651  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.61 
 
 
165 aa  84  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  43.67 
 
 
152 aa  82.4  0.000000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0059  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  58.11 
 
 
151 aa  82.8  0.000000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.230525 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.84 
 
 
157 aa  82.4  0.000000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0788  putative pilus assembly protein major pilin PilA  58.11 
 
 
79 aa  82.4  0.000000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0173637  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0682  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  63.77 
 
 
165 aa  81.6  0.000000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0723462  hitchhiker  0.000000000174273 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1261  hypothetical protein  58.11 
 
 
168 aa  81.3  0.000000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0482  general secretion pathway protein G  57.14 
 
 
171 aa  81.3  0.000000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00144077  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1371  hypothetical protein  58.9 
 
 
174 aa  81.3  0.000000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1436  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  56.16 
 
 
171 aa  80.5  0.00000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1548  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  58.11 
 
 
167 aa  80.5  0.00000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  hitchhiker  0.00000000000000294624 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  51.22 
 
 
168 aa  80.5  0.00000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0265  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  49.02 
 
 
166 aa  79.7  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.319115  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1495  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  58.44 
 
 
167 aa  78.2  0.00000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.70798  normal  0.112729 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0475  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  55.41 
 
 
171 aa  78.2  0.00000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0779  hypothetical protein  57.53 
 
 
136 aa  77.4  0.00000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0449  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  58.67 
 
 
167 aa  77.4  0.00000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000146857  hitchhiker  0.0000000193676 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0495  fimbrial protein EcpC precursor  56 
 
 
172 aa  77  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.014346  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0349  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  57.75 
 
 
179 aa  76.6  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875622  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0526  hypothetical protein  54.05 
 
 
158 aa  76.3  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000137512  normal  0.350549 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1442  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  56.34 
 
 
155 aa  75.5  0.0000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.102563  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1488  hypothetical protein  38.96 
 
 
158 aa  75.1  0.0000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.109192  normal  0.403243 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0613  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  63.79 
 
 
165 aa  75.1  0.0000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0934015 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0392  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.66 
 
 
175 aa  74.7  0.0000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000336485  hitchhiker  0.0000000727713 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1421  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  57.14 
 
 
172 aa  73.6  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1058  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  45.61 
 
 
176 aa  72.4  0.000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.110537  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0926  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  44.21 
 
 
171 aa  70.5  0.000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000619994  hitchhiker  8.71814e-18 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0669  fimbrial protein EcpC precursor  73.91 
 
 
48 aa  68.2  0.00000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0148  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  29.59 
 
 
174 aa  64.3  0.0000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1067  methylation site containing protein  46.58 
 
 
130 aa  62.8  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1096  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  76.19 
 
 
157 aa  62.8  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.292656  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0681  hypothetical protein  36.36 
 
 
567 aa  61.6  0.000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000227256 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0376  hypothetical protein  52.73 
 
 
174 aa  61.6  0.000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000272235  hitchhiker  0.0000000000782624 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0535  hypothetical protein  38.18 
 
 
634 aa  61.6  0.000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000025366  normal  0.911782 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0057  hypothetical protein  42.22 
 
 
169 aa  61.6  0.000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.266791 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0274  general secretion pathway protein H  62.5 
 
 
174 aa  61.6  0.000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.560285  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1299  Type IV pilus biogenesis protein PilE  43.06 
 
 
128 aa  61.2  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.799661 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2522  pilin  48.65 
 
 
176 aa  61.2  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3584  fimbrial protein PilA  48.65 
 
 
176 aa  61.2  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.194411  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0548  hypothetical protein  45.33 
 
 
169 aa  61.2  0.000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0933  hypothetical protein  36.11 
 
 
527 aa  60.8  0.000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000356044  hitchhiker  0.000000000476431 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0345  general secretion pathway protein H  40.22 
 
 
176 aa  59.7  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177644  normal  0.0749297 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58730  type IV pilin structural subunit  66.67 
 
 
179 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.279942  normal  0.457351 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0933  hypothetical protein  46.48 
 
 
186 aa  58.9  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2949  methylation site containing protein  44.12 
 
 
147 aa  58.9  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0811797  normal  0.399462 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0960  hypothetical protein  46.48 
 
 
186 aa  58.9  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4782  Tfp pilus assembly protein  36.08 
 
 
179 aa  57.8  0.00000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3031  methylation site containing protein  41.43 
 
 
133 aa  57.8  0.00000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0065  pilin  61.7 
 
 
170 aa  57.8  0.00000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.154072 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0692  hypothetical protein  48.39 
 
 
548 aa  57.4  0.00000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000140435  unclonable  7.26108e-19 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0478  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  60.98 
 
 
169 aa  57  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.322644  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1107  methylation site containing protein  43.84 
 
 
130 aa  56.6  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.963603 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0558  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  58.54 
 
 
168 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5185  protein involved in methylation  64.1 
 
 
174 aa  56.2  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101493  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3387  fgenesh4_pg.C_scaffold_2883000002  50 
 
 
196 aa  56.6  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.437334  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0505  fimbrial protein pilin  38.81 
 
 
159 aa  56.2  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3128  methylation site containing protein  42.65 
 
 
132 aa  56.6  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.932633 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0463  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  40 
 
 
167 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1164  type IV pilus biogenesis protein PilE  43.66 
 
 
130 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.536283 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1129  type IV pilus biogenesis protein PilE  43.66 
 
 
130 aa  55.8  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03468  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  39.13 
 
 
141 aa  55.8  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2680  fimbrial protein pilin  46.67 
 
 
169 aa  55.8  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0726827  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0263  pilin polypeptide  30.15 
 
 
178 aa  55.1  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3356  fimbrial protein pilin: general secretion pathway protein H  63.41 
 
 
137 aa  55.5  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.669833  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5180  fimbrial protein pilin  49.15 
 
 
169 aa  55.5  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0088813  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1865  pilus assembly protein  44.44 
 
 
134 aa  55.1  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1062  type IV pilus biogenesis protein PilE  42.11 
 
 
130 aa  55.1  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3227  type IV pilus biogenesis protein PilE  42.11 
 
 
130 aa  55.1  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2629  type IV pilus subunit PilA  46.55 
 
 
138 aa  55.5  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4040  fimbrial protein pilin  54.35 
 
 
178 aa  55.1  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736529  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0557  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  66.67 
 
 
173 aa  55.1  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0477  putative type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  62.5 
 
 
173 aa  55.1  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0748911  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3255  hypothetical protein  38.2 
 
 
140 aa  55.1  0.0000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>