More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1018 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_1018  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  100 
 
 
161 aa  335  9.999999999999999e-92  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1261  hypothetical protein  49.12 
 
 
168 aa  138  3.9999999999999997e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0526  hypothetical protein  46.58 
 
 
158 aa  135  2e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000137512  normal  0.350549 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0571  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45.62 
 
 
163 aa  124  7e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0345  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  47.3 
 
 
156 aa  121  5e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996245  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45.78 
 
 
169 aa  118  3e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0482  general secretion pathway protein G  44.08 
 
 
171 aa  118  3.9999999999999996e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00144077  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0210  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.04 
 
 
154 aa  116  9.999999999999999e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103934  normal  0.61486 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0015  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.5 
 
 
193 aa  111  4.0000000000000004e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.170754  normal  0.192574 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1487  fimbrial protein EcpC precursor  42.6 
 
 
164 aa  110  8.000000000000001e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0651614  normal  0.606044 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0802  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.42 
 
 
152 aa  110  1.0000000000000001e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.964553  normal  0.826959 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0567  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.72 
 
 
147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0059  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.14 
 
 
151 aa  109  2.0000000000000002e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.230525 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0096  hypothetical protein  47.02 
 
 
163 aa  107  9.000000000000001e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.062594 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1161  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.33 
 
 
157 aa  106  1e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0617  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.62 
 
 
158 aa  106  1e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.217435 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1097  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.75 
 
 
151 aa  105  4e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.282151  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1387  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.24 
 
 
175 aa  105  4e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0807  hypothetical protein  61.9 
 
 
182 aa  104  6e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000505152 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0606  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.71 
 
 
156 aa  104  7e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000101189  hitchhiker  0.000000768083 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1436  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  56.25 
 
 
171 aa  103  9e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0475  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.74 
 
 
171 aa  103  1e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1548  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.72 
 
 
167 aa  101  5e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  hitchhiker  0.00000000000000294624 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1488  hypothetical protein  46.36 
 
 
158 aa  101  5e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.109192  normal  0.403243 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0765  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.1 
 
 
170 aa  100  1e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000473938  hitchhiker  1.49827e-16 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.87 
 
 
168 aa  99  2e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0265  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.74 
 
 
166 aa  99  2e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.319115  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.14 
 
 
163 aa  98.2  4e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.253002  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0204  type IV pilus assembly protein PilE  36.25 
 
 
155 aa  98.6  4e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0668  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.52 
 
 
155 aa  97.8  5e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000136734 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0800  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.22 
 
 
167 aa  97.4  7e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.346386  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0612  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.88 
 
 
161 aa  97.1  9e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0651  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  62.67 
 
 
165 aa  94.7  4e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1524  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.48 
 
 
159 aa  94.7  5e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000584644  unclonable  2.6975300000000003e-19 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1371  hypothetical protein  38.46 
 
 
174 aa  94.7  5e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1495  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.37 
 
 
167 aa  93.6  1e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.70798  normal  0.112729 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0093  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  47.66 
 
 
169 aa  92.4  2e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0563183 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1421  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  34.97 
 
 
172 aa  92  3e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0788  putative pilus assembly protein major pilin PilA  60 
 
 
79 aa  91.7  4e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0173637  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1442  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  65.28 
 
 
155 aa  91.3  5e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.102563  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0340  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  60 
 
 
165 aa  90.5  8e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.82 
 
 
157 aa  90.5  8e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0349  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  34.81 
 
 
179 aa  89  3e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875622  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0682  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  35.06 
 
 
165 aa  88.2  4e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0723462  hitchhiker  0.000000000174273 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0392  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  47.96 
 
 
175 aa  86.7  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000336485  hitchhiker  0.0000000727713 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0216  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  53.76 
 
 
163 aa  86.3  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0379234 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0779  hypothetical protein  56.79 
 
 
136 aa  86.3  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0331  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  58.11 
 
 
172 aa  86.3  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0613  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  39.39 
 
 
165 aa  84.7  5e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0934015 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  61.64 
 
 
152 aa  83.2  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0495  fimbrial protein EcpC precursor  57.83 
 
 
172 aa  82.8  0.000000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.014346  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0449  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  56.76 
 
 
167 aa  82  0.000000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000146857  hitchhiker  0.0000000193676 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0926  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  37.66 
 
 
171 aa  78.2  0.00000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000619994  hitchhiker  8.71814e-18 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1058  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  59.38 
 
 
176 aa  73.2  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.110537  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0548  hypothetical protein  34.19 
 
 
169 aa  71.6  0.000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1230  hypothetical protein  31.03 
 
 
178 aa  69.3  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1096  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  46.39 
 
 
157 aa  68.6  0.00000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.292656  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0933  hypothetical protein  47.13 
 
 
527 aa  68.2  0.00000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000356044  hitchhiker  0.000000000476431 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0535  hypothetical protein  47.13 
 
 
634 aa  67.8  0.00000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000025366  normal  0.911782 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0274  general secretion pathway protein H  58.33 
 
 
174 aa  67.4  0.00000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.560285  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1300  hypothetical protein  31.71 
 
 
158 aa  67  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0057  hypothetical protein  43.9 
 
 
169 aa  67  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.266791 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0669  fimbrial protein EcpC precursor  73.91 
 
 
48 aa  67  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0681  hypothetical protein  46.51 
 
 
567 aa  65.5  0.0000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000227256 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1201  Tfp pilus assembly protein PilE-like  36.96 
 
 
189 aa  65.1  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3584  fimbrial protein PilA  47.06 
 
 
176 aa  64.3  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.194411  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2522  pilin  47.06 
 
 
176 aa  64.3  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2629  type IV pilus subunit PilA  46.27 
 
 
138 aa  63.5  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0692  hypothetical protein  44.71 
 
 
548 aa  63.2  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000140435  unclonable  7.26108e-19 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3550  Tfp pilus assembly protein PilE  49.15 
 
 
164 aa  63.5  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.844187  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0872  general secretion pathway protein H  50.85 
 
 
152 aa  63.9  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.854476  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0936  general secretion pathway protein  42.86 
 
 
155 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.898049 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3031  methylation site containing protein  37.97 
 
 
133 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1067  methylation site containing protein  40.23 
 
 
130 aa  62.4  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0376  hypothetical protein  31.25 
 
 
174 aa  62  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000272235  hitchhiker  0.0000000000782624 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0345  general secretion pathway protein H  43.66 
 
 
176 aa  60.5  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177644  normal  0.0749297 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0583  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.74 
 
 
166 aa  60.1  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000427106 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0463  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  47.46 
 
 
167 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0148  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  56.86 
 
 
174 aa  60.1  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2916  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  45.45 
 
 
145 aa  60.5  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1299  Type IV pilus biogenesis protein PilE  41.43 
 
 
128 aa  60.1  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.799661 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3128  methylation site containing protein  38.46 
 
 
132 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.932633 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0723  type-4 fimbrial pilin-like transmembrane protein  38.82 
 
 
161 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2275  general secretion pathway protein H  48.33 
 
 
164 aa  59.7  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2886  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.79 
 
 
170 aa  59.3  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.308484  normal  0.94282 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1108  hypothetical protein  32.82 
 
 
123 aa  59.7  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0933  hypothetical protein  42.86 
 
 
186 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1107  methylation site containing protein  40 
 
 
130 aa  58.5  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.963603 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0960  hypothetical protein  42.86 
 
 
186 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2413  type II secretion system protein G  44.78 
 
 
149 aa  58.9  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330838  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2310  putative GSPG-related transmembrane protein  43.94 
 
 
155 aa  58.5  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.164905  normal  0.125662 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1999  fimbrial protein  40.23 
 
 
153 aa  58.5  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0260  pilin polypeptide  49.3 
 
 
187 aa  58.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1460  type II secretion system protein G  40.3 
 
 
153 aa  58.5  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52288  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2680  type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  43.94 
 
 
146 aa  58.2  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0580057 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1091  methylation site containing protein  33.33 
 
 
130 aa  58.2  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1857  N-terminal methylation  40.91 
 
 
140 aa  58.2  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0477  prepilin-type cleavage/methylation  28.89 
 
 
148 aa  57.8  0.00000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.695821  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2949  methylation site containing protein  39.13 
 
 
147 aa  57.8  0.00000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0811797  normal  0.399462 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0558  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  38.64 
 
 
168 aa  57.4  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>