More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0376 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0376  hypothetical protein  100 
 
 
174 aa  357  4e-98  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000272235  hitchhiker  0.0000000000782624 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0617  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  34.71 
 
 
158 aa  89.7  2e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.217435 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0651  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.04 
 
 
165 aa  83.2  0.000000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0093  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.26 
 
 
169 aa  81.6  0.000000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0563183 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  33.14 
 
 
157 aa  80.9  0.000000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0345  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  32.76 
 
 
156 aa  80.1  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996245  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0567  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  32 
 
 
147 aa  77.4  0.00000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1097  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  33.76 
 
 
151 aa  76.6  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.282151  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1487  fimbrial protein EcpC precursor  36.2 
 
 
164 aa  75.9  0.0000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0651614  normal  0.606044 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1548  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.78 
 
 
167 aa  75.9  0.0000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  hitchhiker  0.00000000000000294624 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0571  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  50.68 
 
 
163 aa  75.5  0.0000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  33.53 
 
 
168 aa  74.3  0.0000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  32.37 
 
 
163 aa  73.9  0.0000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.253002  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0204  type IV pilus assembly protein PilE  30.06 
 
 
155 aa  72.8  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0926  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  41.49 
 
 
171 aa  72.4  0.000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000619994  hitchhiker  8.71814e-18 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1436  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  30.77 
 
 
171 aa  72  0.000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0449  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  33.13 
 
 
167 aa  72  0.000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000146857  hitchhiker  0.0000000193676 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1371  hypothetical protein  30.64 
 
 
174 aa  72  0.000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1421  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  48.61 
 
 
172 aa  71.6  0.000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1442  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  42.35 
 
 
155 aa  71.2  0.000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.102563  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  46.58 
 
 
169 aa  70.5  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0802  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  49.32 
 
 
152 aa  70.1  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.964553  normal  0.826959 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0057  hypothetical protein  45.36 
 
 
169 aa  70.9  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.266791 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0096  hypothetical protein  42.71 
 
 
163 aa  70.1  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.062594 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0475  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  32.91 
 
 
171 aa  69.3  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0340  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  34.62 
 
 
165 aa  69.7  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1230  hypothetical protein  35.83 
 
 
178 aa  68.9  0.00000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0613  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  59.26 
 
 
165 aa  69.3  0.00000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0934015 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0216  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.02 
 
 
163 aa  68.6  0.00000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0379234 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0548  hypothetical protein  43.75 
 
 
169 aa  68.9  0.00000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1387  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.11 
 
 
175 aa  68.2  0.00000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0274  general secretion pathway protein H  48.33 
 
 
174 aa  68.6  0.00000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.560285  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1524  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.4 
 
 
159 aa  67.8  0.00000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000584644  unclonable  2.6975300000000003e-19 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1488  hypothetical protein  43.3 
 
 
158 aa  67.8  0.00000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.109192  normal  0.403243 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1161  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  46.58 
 
 
157 aa  67.8  0.00000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  47.56 
 
 
152 aa  67.4  0.00000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0765  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  31.95 
 
 
170 aa  67  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000473938  hitchhiker  1.49827e-16 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0535  hypothetical protein  54.72 
 
 
634 aa  66.2  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000025366  normal  0.911782 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0933  hypothetical protein  65.12 
 
 
527 aa  65.9  0.0000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000356044  hitchhiker  0.000000000476431 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0331  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.04 
 
 
172 aa  65.5  0.0000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0265  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  34.71 
 
 
166 aa  64.3  0.0000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.319115  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0681  hypothetical protein  62.79 
 
 
567 aa  63.9  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000227256 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0692  hypothetical protein  54.9 
 
 
548 aa  62.8  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000140435  unclonable  7.26108e-19 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0606  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  29.34 
 
 
156 aa  62.8  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000101189  hitchhiker  0.000000768083 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1096  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  59.18 
 
 
157 aa  63.2  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.292656  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0779  hypothetical protein  59.26 
 
 
136 aa  63.2  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0788  putative pilus assembly protein major pilin PilA  43.84 
 
 
79 aa  62.8  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0173637  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0668  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  50.91 
 
 
155 aa  62.8  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000136734 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1018  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  31.25 
 
 
161 aa  62  0.000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0392  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  53.7 
 
 
175 aa  62  0.000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000336485  hitchhiker  0.0000000727713 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0260  pilin polypeptide  30.28 
 
 
187 aa  62  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1261  hypothetical protein  28.12 
 
 
168 aa  62  0.000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  53.85 
 
 
141 aa  61.6  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0800  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  52.73 
 
 
167 aa  61.6  0.000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.346386  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0612  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.46 
 
 
161 aa  61.6  0.000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0210  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.1 
 
 
154 aa  61.6  0.000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103934  normal  0.61486 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0669  fimbrial protein EcpC precursor  72.5 
 
 
48 aa  60.5  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3584  fimbrial protein PilA  40.58 
 
 
176 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.194411  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1199  hypothetical protein  40.3 
 
 
221 aa  60.1  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.789092  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2522  pilin  40.58 
 
 
176 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0349  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  56.6 
 
 
179 aa  60.1  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875622  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20891  pilin  33.33 
 
 
170 aa  60.8  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1495  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  32.5 
 
 
167 aa  60.1  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.70798  normal  0.112729 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0933  hypothetical protein  41.43 
 
 
186 aa  59.3  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0960  hypothetical protein  41.43 
 
 
186 aa  59.3  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0148  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  58.14 
 
 
174 aa  58.5  0.00000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  48.44 
 
 
142 aa  58.2  0.00000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0345  general secretion pathway protein H  36.62 
 
 
176 aa  57.8  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177644  normal  0.0749297 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07011  hypothetical protein  43.86 
 
 
208 aa  57.8  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.212398  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  48.44 
 
 
142 aa  57.8  0.00000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1201  Tfp pilus assembly protein PilE-like  45.61 
 
 
189 aa  57.4  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1722  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  48.28 
 
 
143 aa  57.4  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1058  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  53.06 
 
 
176 aa  57.4  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.110537  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0059  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  63.41 
 
 
151 aa  56.2  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.230525 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0723  type-4 fimbrial pilin-like transmembrane protein  40.3 
 
 
161 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2663  type IV pilus biogenesis protein PilE  49.06 
 
 
142 aa  56.6  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0482  general secretion pathway protein G  50.91 
 
 
171 aa  56.2  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00144077  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3944  fimbrial protein pilin  59.09 
 
 
166 aa  55.8  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.736158  hitchhiker  0.00123211 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0495  fimbrial protein EcpC precursor  48.15 
 
 
172 aa  55.8  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.014346  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0682  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  35.35 
 
 
165 aa  55.5  0.0000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0723462  hitchhiker  0.000000000174273 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20881  pilin  35.05 
 
 
159 aa  55.5  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4155  fimbiral protein PilA  44.44 
 
 
188 aa  55.1  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.614605  normal  0.158719 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2629  type IV pilus subunit PilA  31.86 
 
 
138 aa  55.1  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2449  Fimbrial protein pilin  40.54 
 
 
162 aa  55.1  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000426279  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3945  fimbrial protein pilin  59.09 
 
 
166 aa  55.1  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.373423  hitchhiker  0.00130999 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07091  hypothetical protein  29.53 
 
 
263 aa  55.1  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1078  pilin  42.62 
 
 
162 aa  54.7  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.18456 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0015  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45.28 
 
 
193 aa  54.7  0.0000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.170754  normal  0.192574 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5161  type IV pilin structural subunit  46.43 
 
 
179 aa  54.3  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5180  fimbrial protein pilin  50 
 
 
169 aa  54.3  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0088813  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2275  general secretion pathway protein H  38.46 
 
 
164 aa  53.5  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4674  methylation  60.98 
 
 
169 aa  53.9  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3946  fimbrial protein pilin  59.09 
 
 
169 aa  53.9  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00129399 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4040  fimbrial protein pilin  33.61 
 
 
178 aa  53.9  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736529  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0807  hypothetical protein  46.3 
 
 
182 aa  53.5  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000505152 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0250  fimbrial subunit  44.26 
 
 
152 aa  52.8  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0333044  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0728  hypothetical protein  30.47 
 
 
174 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58730  type IV pilin structural subunit  57.78 
 
 
179 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.279942  normal  0.457351 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3248  hypothetical protein  48.21 
 
 
132 aa  53.5  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3189  fimbrial protein pilin  33.91 
 
 
162 aa  53.1  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.208  normal  0.535395 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>