More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0571 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0571  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  100 
 
 
163 aa  337  5e-92  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1161  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  62.99 
 
 
157 aa  183  9e-46  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0765  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  46.15 
 
 
170 aa  124  7e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000473938  hitchhiker  1.49827e-16 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1018  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45.62 
 
 
161 aa  124  8.000000000000001e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1548  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  69.77 
 
 
167 aa  122  2e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  hitchhiker  0.00000000000000294624 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  46.25 
 
 
169 aa  122  2e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0617  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.03 
 
 
158 aa  116  9.999999999999999e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.217435 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0668  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  63.44 
 
 
155 aa  115  1.9999999999999998e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000136734 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  78.87 
 
 
168 aa  115  3e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1261  hypothetical protein  44.51 
 
 
168 aa  115  3e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1387  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.51 
 
 
175 aa  112  2.0000000000000002e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0475  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.24 
 
 
171 aa  111  3e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0606  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45.22 
 
 
156 aa  108  2.0000000000000002e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000101189  hitchhiker  0.000000768083 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0807  hypothetical protein  57.14 
 
 
182 aa  108  2.0000000000000002e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000505152 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0567  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  48.05 
 
 
147 aa  109  2.0000000000000002e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0096  hypothetical protein  75.68 
 
 
163 aa  107  6e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.062594 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0802  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.42 
 
 
152 aa  107  9.000000000000001e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.964553  normal  0.826959 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0345  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  69.33 
 
 
156 aa  105  2e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996245  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0651  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.26 
 
 
165 aa  106  2e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0340  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  52.73 
 
 
165 aa  105  4e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1421  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  40.65 
 
 
172 aa  104  6e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1487  fimbrial protein EcpC precursor  40 
 
 
164 aa  104  7e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0651614  normal  0.606044 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0216  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  47.9 
 
 
163 aa  103  7e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0379234 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0482  general secretion pathway protein G  53.4 
 
 
171 aa  103  8e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00144077  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0015  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  54 
 
 
193 aa  103  9e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.170754  normal  0.192574 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0093  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  67.57 
 
 
169 aa  102  2e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0563183 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  61.8 
 
 
163 aa  102  2e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.253002  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1495  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  69.33 
 
 
167 aa  102  2e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.70798  normal  0.112729 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1097  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  70.83 
 
 
151 aa  101  5e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.282151  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1371  hypothetical protein  65.75 
 
 
174 aa  97.1  9e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1442  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  66.67 
 
 
155 aa  97.1  1e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.102563  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0449  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.04 
 
 
167 aa  95.9  2e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000146857  hitchhiker  0.0000000193676 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0265  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.6 
 
 
166 aa  95.1  3e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.319115  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0779  hypothetical protein  49.15 
 
 
136 aa  95.1  3e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0210  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40 
 
 
154 aa  95.1  3e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103934  normal  0.61486 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.25 
 
 
157 aa  95.1  4e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0788  putative pilus assembly protein major pilin PilA  66.22 
 
 
79 aa  94.7  4e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0173637  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0613  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  45.74 
 
 
165 aa  93.6  1e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0934015 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0059  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40 
 
 
151 aa  93.6  1e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.230525 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0526  hypothetical protein  39.19 
 
 
158 aa  92.4  2e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000137512  normal  0.350549 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1436  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  51.38 
 
 
171 aa  92.8  2e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1524  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  67.57 
 
 
159 aa  91.7  4e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000584644  unclonable  2.6975300000000003e-19 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0392  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  64.38 
 
 
175 aa  91.7  4e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000336485  hitchhiker  0.0000000727713 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0204  type IV pilus assembly protein PilE  41.09 
 
 
155 aa  91.3  5e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0800  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  57.65 
 
 
167 aa  88.2  4e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.346386  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1488  hypothetical protein  39.61 
 
 
158 aa  87.4  8e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.109192  normal  0.403243 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0331  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  60.81 
 
 
172 aa  87.4  8e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0612  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.6 
 
 
161 aa  85.9  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0349  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.89 
 
 
179 aa  86.3  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875622  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  60.53 
 
 
152 aa  85.5  3e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0495  fimbrial protein EcpC precursor  54.88 
 
 
172 aa  83.6  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.014346  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0548  hypothetical protein  38.24 
 
 
169 aa  82.8  0.000000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0274  general secretion pathway protein H  70.18 
 
 
174 aa  80.9  0.000000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.560285  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0926  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  39.29 
 
 
171 aa  79  0.00000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000619994  hitchhiker  8.71814e-18 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1058  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  35.47 
 
 
176 aa  78.6  0.00000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.110537  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0057  hypothetical protein  52.44 
 
 
169 aa  78.6  0.00000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.266791 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0376  hypothetical protein  50.68 
 
 
174 aa  75.5  0.0000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000272235  hitchhiker  0.0000000000782624 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0669  fimbrial protein EcpC precursor  84.44 
 
 
48 aa  75.1  0.0000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1096  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.32 
 
 
157 aa  73.9  0.0000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.292656  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0682  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  53.62 
 
 
165 aa  68.2  0.00000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0723462  hitchhiker  0.000000000174273 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0148  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  67.35 
 
 
174 aa  67.8  0.00000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0345  general secretion pathway protein H  41.67 
 
 
176 aa  67  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177644  normal  0.0749297 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0535  hypothetical protein  43.75 
 
 
634 aa  67  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000025366  normal  0.911782 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1230  hypothetical protein  45 
 
 
178 aa  67  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0933  hypothetical protein  43.75 
 
 
527 aa  67  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000356044  hitchhiker  0.000000000476431 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2522  pilin  50.65 
 
 
176 aa  65.1  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3584  fimbrial protein PilA  50.65 
 
 
176 aa  65.1  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.194411  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0681  hypothetical protein  43.16 
 
 
567 aa  64.7  0.0000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000227256 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0463  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  40.59 
 
 
167 aa  63.9  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0692  hypothetical protein  41.49 
 
 
548 aa  62.8  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000140435  unclonable  7.26108e-19 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1507  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.82 
 
 
121 aa  62.4  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000010883  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1024  hypothetical protein  42.42 
 
 
162 aa  61.6  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1300  hypothetical protein  26.79 
 
 
158 aa  61.2  0.000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2664  methylation  46.67 
 
 
160 aa  60.5  0.000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0872  general secretion pathway protein H  49.15 
 
 
152 aa  60.5  0.000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.854476  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0723  type-4 fimbrial pilin-like transmembrane protein  35.48 
 
 
161 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1199  hypothetical protein  40.91 
 
 
221 aa  60.5  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.789092  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3031  methylation site containing protein  36.59 
 
 
133 aa  60.5  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07011  hypothetical protein  42.86 
 
 
208 aa  60.1  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.212398  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2904  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  41.54 
 
 
168 aa  59.3  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.3004 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1201  Tfp pilus assembly protein PilE-like  43.28 
 
 
189 aa  59.7  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3476  type II secretion system protein G  46.38 
 
 
128 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0390478  normal  0.854758 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2301  putative GSPG-related protein  41.43 
 
 
130 aa  58.9  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.152629  normal  0.0321295 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4674  methylation  54.35 
 
 
169 aa  58.9  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1067  methylation site containing protein  35.96 
 
 
130 aa  58.5  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2461  type II secretion system protein G  46.38 
 
 
124 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.508549  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2295  type II secretion system protein G  46.38 
 
 
124 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.478951  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0816  type IV pilus biogenesis protein  47.46 
 
 
133 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3227  type IV pilus biogenesis protein PilE  43.66 
 
 
130 aa  58.2  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1062  type IV pilus biogenesis protein PilE  43.66 
 
 
130 aa  58.2  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2470  type II secretion system protein G  44.93 
 
 
124 aa  58.2  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.335351  normal  0.427711 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2882  methylation site containing protein  32.99 
 
 
138 aa  58.2  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0933  hypothetical protein  44.3 
 
 
186 aa  58.2  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0960  hypothetical protein  44.3 
 
 
186 aa  58.2  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03468  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  34.15 
 
 
141 aa  57.4  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1510  fimbrial protein  51.06 
 
 
138 aa  57  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.0000000690325  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1129  type IV pilus biogenesis protein PilE  43.94 
 
 
130 aa  57  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0472  fimbrial protein pilin  34.52 
 
 
182 aa  56.6  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.877435  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5161  type IV pilin structural subunit  40.62 
 
 
179 aa  57  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1164  type IV pilus biogenesis protein PilE  43.94 
 
 
130 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.536283 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>