More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0612 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_0612  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  100 
 
 		 161 aa  332  2e-90  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1018  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.88 
 
 		 161 aa  97.1  9e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0668  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  59.49 
 
 		 155 aa  90.9  7e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000136734 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0210  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.27 
 
 		 154 aa  88.6  3e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103934  normal  0.61486 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0682  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.74 
 
 		 165 aa  88.6  3e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0723462  hitchhiker  0.000000000174273 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0567  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  60.56 
 
 		 147 aa  87  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.29 
 
 		 169 aa  86.7  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0765  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.05 
 
 		 170 aa  85.9  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000473938  hitchhiker  1.49827e-16 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0571  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.6 
 
 		 163 aa  85.9  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.89 
 
 		 163 aa  85.1  3e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.253002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0926  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  34.91 
 
 		 171 aa  85.1  3e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000619994  hitchhiker  8.71814e-18 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0093  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  49.43 
 
 		 169 aa  85.5  3e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0563183 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.92 
 
 		 157 aa  85.1  4e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0800  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.11 
 
 		 167 aa  84.7  5e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.346386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0216  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.39 
 
 		 163 aa  84.7  5e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0379234 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1371  hypothetical protein  56.34 
 
 		 174 aa  84.3  6e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0807  hypothetical protein  58.9 
 
 		 182 aa  84.3  7e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000505152 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0015  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.44 
 
 		 193 aa  84.3  7e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.170754  normal  0.192574 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0345  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.75 
 
 		 156 aa  84  8e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1261  hypothetical protein  38.18 
 
 		 168 aa  84  9e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1387  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.51 
 
 		 175 aa  84  9e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0802  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  59.15 
 
 		 152 aa  83.6  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.964553  normal  0.826959 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0204  type IV pilus assembly protein PilE  59.21 
 
 		 155 aa  83.2  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1161  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  35.8 
 
 		 157 aa  82.4  0.000000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0340  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.64 
 
 		 165 aa  82.4  0.000000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1097  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  57.75 
 
 		 151 aa  82.4  0.000000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.282151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1524  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  35.58 
 
 		 159 aa  81.6  0.000000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000584644  unclonable  2.6975300000000003e-19 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1442  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  54.05 
 
 		 155 aa  81.3  0.000000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.102563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0475  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  33.14 
 
 		 171 aa  80.1  0.00000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0617  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  59.15 
 
 		 158 aa  80.1  0.00000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.217435 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0482  general secretion pathway protein G  36.65 
 
 		 171 aa  79.3  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00144077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0606  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  58.57 
 
 		 156 aa  78.2  0.00000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000101189  hitchhiker  0.000000768083 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0265  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.65 
 
 		 166 aa  78.2  0.00000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.319115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0449  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  58.9 
 
 		 167 aa  77.8  0.00000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000146857  hitchhiker  0.0000000193676 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0096  hypothetical protein  60 
 
 		 163 aa  77.8  0.00000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.062594 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0331  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.2 
 
 		 172 aa  77.4  0.00000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0059  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  56.25 
 
 		 151 aa  77  0.00000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.230525 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1548  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  56.34 
 
 		 167 aa  77  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  hitchhiker  0.00000000000000294624 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0651  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  56.34 
 
 		 165 aa  76.3  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0779  hypothetical protein  52.56 
 
 		 136 aa  74.3  0.0000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1488  hypothetical protein  34.78 
 
 		 158 aa  72.4  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.109192  normal  0.403243 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1436  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  47.62 
 
 		 171 aa  72.8  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0392  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  48.24 
 
 		 175 aa  73.2  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000336485  hitchhiker  0.0000000727713 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0349  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  53.33 
 
 		 179 aa  72  0.000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0613  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  64.29 
 
 		 165 aa  71.6  0.000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0934015 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  51.85 
 
 		 168 aa  71.2  0.000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0495  fimbrial protein EcpC precursor  38.6 
 
 		 172 aa  71.2  0.000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.014346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1495  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  56.34 
 
 		 167 aa  70.9  0.000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.70798  normal  0.112729 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0548  hypothetical protein  50 
 
 		 169 aa  70.9  0.000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0788  putative pilus assembly protein major pilin PilA  54.93 
 
 		 79 aa  70.1  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0173637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1421  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  52.86 
 
 		 172 aa  69.7  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1487  fimbrial protein EcpC precursor  33.72 
 
 		 164 aa  67.4  0.00000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0651614  normal  0.606044 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1201  Tfp pilus assembly protein PilE-like  35.85 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1058  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  47.44 
 
 		 176 aa  64.7  0.0000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.110537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  45.98 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1507  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.24 
 
 		 121 aa  63.9  0.0000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000010883  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1096  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  56.06 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.292656  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2449  Fimbrial protein pilin  30.63 
 
 		 162 aa  62.8  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000426279  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0526  hypothetical protein  52.46 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000137512  normal  0.350549 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0376  hypothetical protein  38.46 
 
 		 174 aa  61.6  0.000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000272235  hitchhiker  0.0000000000782624 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2522  pilin  44 
 
 		 176 aa  60.8  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3584  fimbrial protein PilA  44 
 
 		 176 aa  60.8  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.194411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0669  fimbrial protein EcpC precursor  83.33 
 
 		 48 aa  60.1  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4674  methylation  46.15 
 
 		 169 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0933  hypothetical protein  45.71 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0933  hypothetical protein  53.85 
 
 		 527 aa  59.3  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000356044  hitchhiker  0.000000000476431 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0535  hypothetical protein  53.85 
 
 		 634 aa  59.3  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000025366  normal  0.911782 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0960  hypothetical protein  45.71 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0463  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  45 
 
 		 167 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3031  methylation site containing protein  41.43 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2629  type IV pilus subunit PilA  40.3 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3356  fimbrial protein pilin: general secretion pathway protein H  29.41 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.669833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0345  general secretion pathway protein H  43.06 
 
 		 176 aa  57.8  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177644  normal  0.0749297 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0057  hypothetical protein  49.12 
 
 		 169 aa  57.8  0.00000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.266791 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1999  fimbrial protein  48.39 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0681  hypothetical protein  51.92 
 
 		 567 aa  57.8  0.00000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000227256 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1265  methylation  52 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00964428  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5185  protein involved in methylation  56.25 
 
 		 174 aa  57.4  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101493  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0274  general secretion pathway protein H  53.45 
 
 		 174 aa  56.6  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.560285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0065  pilin  41.1 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.154072 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4679  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  50.85 
 
 		 168 aa  57  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1230  hypothetical protein  36.27 
 
 		 178 aa  56.6  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5161  type IV pilin structural subunit  37.5 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0260  pilin polypeptide  51.72 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0692  hypothetical protein  50 
 
 		 548 aa  55.8  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000140435  unclonable  7.26108e-19 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0872  general secretion pathway protein H  45 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.854476  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1107  methylation site containing protein  43.48 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.963603 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0936  general secretion pathway protein  34.78 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.898049 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0475  fimbrial protein pilin  63.41 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.665132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3944  fimbrial protein pilin  47.92 
 
 		 166 aa  54.7  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.736158  hitchhiker  0.00123211 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0480  pilin subfamily protein  55.81 
 
 		 174 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58730  type IV pilin structural subunit  51.06 
 
 		 179 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.279942  normal  0.457351 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2680  fimbrial protein pilin  46.94 
 
 		 169 aa  54.7  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0726827  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0927  type IV pilus biogenesis protein  46.03 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2949  methylation site containing protein  40.58 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0811797  normal  0.399462 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1036  hypothetical protein  34.62 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  38.46 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1510  fimbrial protein  56.1 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.0000000690325  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3945  fimbrial protein pilin  50 
 
 		 166 aa  53.9  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.373423  hitchhiker  0.00130999 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1067  methylation site containing protein  40.85 
 
 		 130 aa  54.3  0.0000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>