More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0204 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0204  type IV pilus assembly protein PilE  100 
 
 
155 aa  320  7e-87  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0210  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  55.84 
 
 
154 aa  179  8.000000000000001e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103934  normal  0.61486 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0475  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.11 
 
 
171 aa  129  1.0000000000000001e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0668  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.21 
 
 
155 aa  112  1.0000000000000001e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000136734 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0567  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.81 
 
 
147 aa  110  8.000000000000001e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0617  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.68 
 
 
158 aa  108  4.0000000000000004e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.217435 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0059  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.74 
 
 
151 aa  107  8.000000000000001e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.230525 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0800  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.88 
 
 
167 aa  104  4e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.346386  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0606  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  53.27 
 
 
156 aa  103  9e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000101189  hitchhiker  0.000000768083 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.97 
 
 
157 aa  102  2e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1018  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.25 
 
 
161 aa  98.6  3e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1097  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.33 
 
 
151 aa  98.6  3e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.282151  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1387  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  67.12 
 
 
175 aa  97.1  9e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0765  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  65.79 
 
 
170 aa  96.7  1e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000473938  hitchhiker  1.49827e-16 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.5 
 
 
169 aa  95.5  2e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0345  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45.71 
 
 
156 aa  96.3  2e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996245  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0807  hypothetical protein  64.38 
 
 
182 aa  94.4  5e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000505152 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1161  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.79 
 
 
157 aa  93.6  1e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.99 
 
 
163 aa  92.4  2e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.253002  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0802  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  56.96 
 
 
152 aa  91.3  4e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.964553  normal  0.826959 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0571  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.09 
 
 
163 aa  91.3  4e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0216  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  60 
 
 
163 aa  91.3  5e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0379234 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1371  hypothetical protein  39.16 
 
 
174 aa  90.9  6e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0093  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  54.32 
 
 
169 aa  90.5  8e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0563183 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0651  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.13 
 
 
165 aa  90.5  9e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0613  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  35.85 
 
 
165 aa  90.1  9e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0934015 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0682  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.72 
 
 
165 aa  90.1  1e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0723462  hitchhiker  0.000000000174273 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1261  hypothetical protein  42.07 
 
 
168 aa  89.4  2e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0482  general secretion pathway protein G  58.75 
 
 
171 aa  88.2  4e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00144077  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0096  hypothetical protein  42.26 
 
 
163 aa  88.2  4e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.062594 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0015  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.52 
 
 
193 aa  86.7  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.170754  normal  0.192574 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  59.49 
 
 
152 aa  85.9  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1487  fimbrial protein EcpC precursor  38.18 
 
 
164 aa  85.5  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0651614  normal  0.606044 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1548  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.93 
 
 
167 aa  84.7  4e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  hitchhiker  0.00000000000000294624 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0340  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  46.32 
 
 
165 aa  84.7  5e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0788  putative pilus assembly protein major pilin PilA  61.33 
 
 
79 aa  83.2  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0173637  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0612  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  59.21 
 
 
161 aa  83.2  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1524  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  35.62 
 
 
159 aa  83.6  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000584644  unclonable  2.6975300000000003e-19 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.51 
 
 
168 aa  83.2  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0495  fimbrial protein EcpC precursor  44.09 
 
 
172 aa  82.8  0.000000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.014346  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1436  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  53.95 
 
 
171 aa  82.4  0.000000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0449  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  57.95 
 
 
167 aa  82.8  0.000000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000146857  hitchhiker  0.0000000193676 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1442  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  36.08 
 
 
155 aa  80.5  0.000000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.102563  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1495  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  58.44 
 
 
167 aa  79.7  0.00000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.70798  normal  0.112729 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1421  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  46.39 
 
 
172 aa  79.7  0.00000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0331  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  55.41 
 
 
172 aa  79.3  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0265  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.36 
 
 
166 aa  77  0.00000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.319115  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0392  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.2 
 
 
175 aa  75.9  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000336485  hitchhiker  0.0000000727713 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0349  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  53.42 
 
 
179 aa  74.7  0.0000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875622  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0526  hypothetical protein  54.55 
 
 
158 aa  73.9  0.0000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000137512  normal  0.350549 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0779  hypothetical protein  37.78 
 
 
136 aa  73.2  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0376  hypothetical protein  30.06 
 
 
174 aa  72.8  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000272235  hitchhiker  0.0000000000782624 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0926  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  50 
 
 
171 aa  70.1  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000619994  hitchhiker  8.71814e-18 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1058  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  62.07 
 
 
176 aa  70.1  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.110537  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1230  hypothetical protein  44.3 
 
 
178 aa  68.6  0.00000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1488  hypothetical protein  53.16 
 
 
158 aa  67.4  0.00000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.109192  normal  0.403243 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1202  type IV pilus biogenesis protein PilE  28.67 
 
 
130 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2522  pilin  43.75 
 
 
176 aa  64.7  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3584  fimbrial protein PilA  43.75 
 
 
176 aa  64.7  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.194411  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0669  fimbrial protein EcpC precursor  71.74 
 
 
48 aa  64.3  0.0000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0274  general secretion pathway protein H  60.34 
 
 
174 aa  63.9  0.0000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.560285  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0548  hypothetical protein  47.37 
 
 
169 aa  63.9  0.0000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60320  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  45.45 
 
 
141 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000362369 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1096  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  71.43 
 
 
157 aa  63.5  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.292656  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0057  hypothetical protein  56.6 
 
 
169 aa  62.4  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.266791 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0505  fimbrial protein pilin  36.96 
 
 
159 aa  62.8  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0936  general secretion pathway protein  37.66 
 
 
155 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.898049 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1067  methylation site containing protein  30 
 
 
130 aa  60.8  0.000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0345  general secretion pathway protein H  43.42 
 
 
176 aa  60.8  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177644  normal  0.0749297 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2886  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44 
 
 
170 aa  60.8  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.308484  normal  0.94282 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1107  methylation site containing protein  33.6 
 
 
130 aa  60.5  0.000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.963603 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0872  general secretion pathway protein H  53.23 
 
 
152 aa  60.1  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.854476  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0933  hypothetical protein  42.68 
 
 
186 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2154  Tfp pilus assembly protein PilE  45.71 
 
 
138 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0463  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  34.44 
 
 
167 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0960  hypothetical protein  42.68 
 
 
186 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0723  type-4 fimbrial pilin-like transmembrane protein  41.79 
 
 
161 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1129  type IV pilus biogenesis protein PilE  45.45 
 
 
130 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3031  methylation site containing protein  38.57 
 
 
133 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3128  methylation site containing protein  28.76 
 
 
132 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.932633 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5185  protein involved in methylation  46.15 
 
 
174 aa  58.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101493  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1164  type IV pilus biogenesis protein PilE  45.45 
 
 
130 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.536283 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5196  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  45.61 
 
 
141 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  37.5 
 
 
141 aa  58.2  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2949  methylation site containing protein  29.33 
 
 
147 aa  58.5  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0811797  normal  0.399462 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1091  methylation site containing protein  39.36 
 
 
130 aa  57.8  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1510  fimbrial protein  35.96 
 
 
138 aa  57.8  0.00000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.0000000690325  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2275  general secretion pathway protein H  46.67 
 
 
164 aa  57.4  0.00000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5180  fimbrial protein pilin  30.33 
 
 
169 aa  57.4  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0088813  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3550  Tfp pilus assembly protein PilE  40.68 
 
 
164 aa  57  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.844187  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0477  putative type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  42.7 
 
 
173 aa  57  0.00000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0748911  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2680  type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  35.71 
 
 
146 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0580057 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1062  type IV pilus biogenesis protein PilE  40.26 
 
 
130 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3227  type IV pilus biogenesis protein PilE  40.26 
 
 
130 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4155  fimbiral protein PilA  41.1 
 
 
188 aa  55.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.614605  normal  0.158719 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4040  fimbrial protein pilin  38.36 
 
 
178 aa  56.2  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736529  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0933  hypothetical protein  45.83 
 
 
527 aa  56.2  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000356044  hitchhiker  0.000000000476431 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0260  pilin polypeptide  49.3 
 
 
187 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1507  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.28 
 
 
121 aa  55.8  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000010883  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1383  type IV pilin PilE  47.46 
 
 
135 aa  55.8  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.140998  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>