More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0613 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0613  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  100 
 
 
165 aa  343  5e-94  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0934015 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  50.65 
 
 
168 aa  140  9e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0617  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45.45 
 
 
158 aa  121  4e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.217435 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0096  hypothetical protein  45.24 
 
 
163 aa  117  7e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.062594 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.46 
 
 
169 aa  116  9.999999999999999e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1548  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  46.53 
 
 
167 aa  114  6.9999999999999995e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  hitchhiker  0.00000000000000294624 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0668  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.99 
 
 
155 aa  108  3e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000136734 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0571  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45.74 
 
 
163 aa  107  8.000000000000001e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0606  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.48 
 
 
156 aa  105  3e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000101189  hitchhiker  0.000000768083 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0059  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.59 
 
 
151 aa  105  3e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.230525 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0651  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  69.44 
 
 
165 aa  104  6e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0567  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.66 
 
 
147 aa  104  7e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0210  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.99 
 
 
154 aa  103  7e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103934  normal  0.61486 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0475  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.25 
 
 
171 aa  103  1e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1387  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.51 
 
 
175 aa  103  1e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0204  type IV pilus assembly protein PilE  38.99 
 
 
155 aa  102  2e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.76 
 
 
157 aa  102  3e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1524  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.48 
 
 
159 aa  101  4e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000584644  unclonable  2.6975300000000003e-19 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0765  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  69.44 
 
 
170 aa  101  5e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000473938  hitchhiker  1.49827e-16 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0779  hypothetical protein  64.56 
 
 
136 aa  100  7e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1018  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.39 
 
 
161 aa  100  8e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.99 
 
 
163 aa  99.8  2e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.253002  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0482  general secretion pathway protein G  55.56 
 
 
171 aa  98.6  3e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00144077  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1442  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  40.97 
 
 
155 aa  98.6  3e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.102563  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0802  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.58 
 
 
152 aa  97.4  8e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.964553  normal  0.826959 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0345  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  54.26 
 
 
156 aa  95.5  3e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996245  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1436  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  61.11 
 
 
171 aa  95.1  4e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0788  putative pilus assembly protein major pilin PilA  65.28 
 
 
79 aa  95.1  4e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0173637  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1421  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  63.01 
 
 
172 aa  93.6  1e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0015  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  60.56 
 
 
193 aa  92.4  2e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.170754  normal  0.192574 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1487  fimbrial protein EcpC precursor  37.72 
 
 
164 aa  92.4  3e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0651614  normal  0.606044 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0265  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.93 
 
 
166 aa  91.7  4e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.319115  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0093  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  60.27 
 
 
169 aa  91.7  4e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0563183 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1371  hypothetical protein  39.05 
 
 
174 aa  91.3  5e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0449  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40 
 
 
167 aa  91.3  6e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000146857  hitchhiker  0.0000000193676 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1161  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  52.81 
 
 
157 aa  90.1  1e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0807  hypothetical protein  57.14 
 
 
182 aa  89.7  2e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000505152 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1261  hypothetical protein  61.11 
 
 
168 aa  89.4  2e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0495  fimbrial protein EcpC precursor  54.76 
 
 
172 aa  88.6  3e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.014346  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0216  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  48.51 
 
 
163 aa  88.6  3e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0379234 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1488  hypothetical protein  54.08 
 
 
158 aa  88.6  3e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.109192  normal  0.403243 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  39.22 
 
 
152 aa  88.2  4e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1097  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  59.72 
 
 
151 aa  88.2  5e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.282151  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0349  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.82 
 
 
179 aa  88.2  5e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875622  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1495  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.42 
 
 
167 aa  87.8  6e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.70798  normal  0.112729 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0340  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  58.33 
 
 
165 aa  87  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1096  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.5 
 
 
157 aa  84  9e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.292656  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1058  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  59.7 
 
 
176 aa  80.5  0.000000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.110537  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0331  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  54.93 
 
 
172 aa  79.7  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0057  hypothetical protein  47.83 
 
 
169 aa  79  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.266791 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0800  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  57.75 
 
 
167 aa  79  0.00000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.346386  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0926  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  47.87 
 
 
171 aa  78.2  0.00000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000619994  hitchhiker  8.71814e-18 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0612  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  53.85 
 
 
161 aa  77  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0392  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  55.88 
 
 
175 aa  75.9  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000336485  hitchhiker  0.0000000727713 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1230  hypothetical protein  48.75 
 
 
178 aa  75.5  0.0000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0548  hypothetical protein  55.56 
 
 
169 aa  75.5  0.0000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0535  hypothetical protein  57.14 
 
 
634 aa  72.8  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000025366  normal  0.911782 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0274  general secretion pathway protein H  60.34 
 
 
174 aa  72.4  0.000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.560285  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0526  hypothetical protein  44.71 
 
 
158 aa  72.4  0.000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000137512  normal  0.350549 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0681  hypothetical protein  55.36 
 
 
567 aa  71.6  0.000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000227256 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0148  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  67.35 
 
 
174 aa  70.5  0.000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0376  hypothetical protein  48.61 
 
 
174 aa  70.5  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000272235  hitchhiker  0.0000000000782624 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0669  fimbrial protein EcpC precursor  73.91 
 
 
48 aa  69.3  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0260  pilin polypeptide  45.74 
 
 
187 aa  68.2  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2564  hypothetical protein  33.33 
 
 
177 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.569226 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3549  type 4 prepilin-like protein  33.33 
 
 
177 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0345  general secretion pathway protein H  40.43 
 
 
176 aa  66.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177644  normal  0.0749297 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0682  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  50.72 
 
 
165 aa  65.9  0.0000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0723462  hitchhiker  0.000000000174273 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2522  pilin  48.53 
 
 
176 aa  64.7  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3584  fimbrial protein PilA  48.53 
 
 
176 aa  64.7  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.194411  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4674  methylation  58.33 
 
 
169 aa  64.3  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1024  hypothetical protein  42.42 
 
 
162 aa  62.4  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  44.32 
 
 
141 aa  62.8  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0933  hypothetical protein  57.14 
 
 
527 aa  63.2  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000356044  hitchhiker  0.000000000476431 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5185  protein involved in methylation  60.42 
 
 
174 aa  62.8  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101493  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2391  general secretion pathway protein G  44.12 
 
 
144 aa  61.6  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000271033 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4444  type IV pilin  53.85 
 
 
160 aa  61.2  0.000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4155  fimbiral protein PilA  49.06 
 
 
188 aa  61.2  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.614605  normal  0.158719 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5161  type IV pilin structural subunit  33.87 
 
 
179 aa  61.2  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4040  fimbrial protein pilin  36.47 
 
 
178 aa  60.8  0.000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736529  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1265  methylation  61.9 
 
 
160 aa  60.8  0.000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00964428  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4679  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  56.25 
 
 
168 aa  60.8  0.000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2301  putative GSPG-related protein  44.78 
 
 
130 aa  60.5  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.152629  normal  0.0321295 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0253  general secretion pathway protein G  47.06 
 
 
150 aa  60.5  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2923  general secretion pathway protein G  43.06 
 
 
141 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.370501  normal  0.274003 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0480  pilin subfamily protein  57.45 
 
 
174 aa  60.5  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0692  hypothetical protein  53.7 
 
 
548 aa  60.5  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000140435  unclonable  7.26108e-19 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0872  general secretion pathway protein H  51.92 
 
 
152 aa  60.1  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.854476  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02978  putative general secretion pathway GSPG related transmembrane protein  50.88 
 
 
172 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.671308  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0927  type IV pilus biogenesis protein  53.06 
 
 
142 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07011  hypothetical protein  38.24 
 
 
208 aa  59.7  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.212398  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1199  hypothetical protein  39.39 
 
 
221 aa  59.7  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.789092  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20891  pilin  34.58 
 
 
170 aa  59.7  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3387  fgenesh4_pg.C_scaffold_2883000002  59.52 
 
 
196 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.437334  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1413  general secretion pathway protein G  40.28 
 
 
144 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0288958  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1316  type II secretory pathway protein LspG  46.03 
 
 
140 aa  58.9  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1313  type II secretory pathway protein LspG  46.03 
 
 
140 aa  58.9  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1078  pilin  43.55 
 
 
162 aa  58.9  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.18456 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0463  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  52 
 
 
167 aa  58.9  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58730  type IV pilin structural subunit  57.45 
 
 
179 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.279942  normal  0.457351 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>