More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_20891 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_20891  pilin  100 
 
 		 170 aa  349  1e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1442  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  30.43 
 
 		 155 aa  65.1  0.0000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.102563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1199  hypothetical protein  29.66 
 
 		 221 aa  64.7  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.789092  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07011  hypothetical protein  29.23 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.212398  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20881  pilin  45.33 
 
 		 159 aa  62  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0376  hypothetical protein  33.33 
 
 		 174 aa  60.8  0.000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000272235  hitchhiker  0.0000000000782624 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0345  general secretion pathway protein H  38.03 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177644  normal  0.0749297 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.39 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1036  hypothetical protein  42.42 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2664  methylation  42.19 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1067  methylation site containing protein  32.82 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  50 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5161  type IV pilin structural subunit  42.42 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3031  methylation site containing protein  46 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1107  methylation site containing protein  46 
 
 		 130 aa  55.5  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.963603 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3409  general secretion pathway protein GspG  36.23 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17770  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain-containing protein  31.06 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.775526 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2904  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  32.23 
 
 		 168 aa  55.1  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.3004 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0461  fimbrial protein precursor PilE (MS11 antigen)  55.32 
 
 		 167 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2540  fimbrial protein pilin  44.62 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03468  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  39.06 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0057  hypothetical protein  36.76 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.266791 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1078  pilin  41.94 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.18456 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  49.02 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0802  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.88 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.964553  normal  0.826959 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3189  fimbrial protein pilin  46.67 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.208  normal  0.535395 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0651  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.91 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0613  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  32.71 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0934015 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3128  methylation site containing protein  46.94 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.932633 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3584  fimbrial protein PilA  40 
 
 		 176 aa  53.9  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.194411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2949  methylation site containing protein  44.44 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0811797  normal  0.399462 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2522  pilin  40 
 
 		 176 aa  53.9  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004288  putative fimbrial assembly protein PilE  48.98 
 
 		 163 aa  53.9  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3944  fimbrial protein pilin  58.14 
 
 		 166 aa  53.5  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.736158  hitchhiker  0.00123211 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0260  pilin polypeptide  50 
 
 		 187 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0049  pilin polypeptide PilA-like  45.16 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0965276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0480  pilin subfamily protein  49.06 
 
 		 174 aa  53.9  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  47.06 
 
 		 142 aa  53.5  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1202  type IV pilus biogenesis protein PilE  32.26 
 
 		 130 aa  53.1  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0475  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  34.85 
 
 		 171 aa  52.8  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0960  hypothetical protein  41.82 
 
 		 186 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0927  type IV pilus biogenesis protein  47.92 
 
 		 142 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2921  general secretion pathway protein G  30.99 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3424  general secretion pathway protein G  34.78 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0263  pilin polypeptide  45 
 
 		 178 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0617  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  47.06 
 
 		 158 aa  52.8  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.217435 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0933  hypothetical protein  41.82 
 
 		 186 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02835  hypothetical type II secretion protein GspG  34.78 
 
 		 151 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000370073  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0169  general secretion pathway protein G  36.62 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2663  type IV pilus biogenesis protein PilE  41.94 
 
 		 142 aa  52.4  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3135  general secretion pathway protein G  34.78 
 
 		 151 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1865  pilus assembly protein  37.5 
 
 		 134 aa  52.4  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02785  hypothetical protein  34.78 
 
 		 151 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000404727  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  31.25 
 
 		 169 aa  52.4  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1201  Tfp pilus assembly protein PilE-like  29.21 
 
 		 189 aa  52.4  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0048  pilin polypeptide PilA-like  45.16 
 
 		 144 aa  52.4  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.335089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3549  type 4 prepilin-like protein  38.33 
 
 		 177 aa  52.4  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0159  general secretion pathway protein G  36.62 
 
 		 144 aa  52.4  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0154  general secretion pathway protein G  36.62 
 
 		 144 aa  52.4  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3244  general secretion pathway protein GspG  34.78 
 
 		 151 aa  52.4  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.948956  normal  0.749494 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4782  Tfp pilus assembly protein  41.67 
 
 		 179 aa  52.4  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2564  hypothetical protein  38.33 
 
 		 177 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.569226 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3550  Tfp pilus assembly protein PilE  36.51 
 
 		 164 aa  52.8  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.844187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1164  type IV pilus biogenesis protein PilE  46.94 
 
 		 130 aa  52  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.536283 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1129  type IV pilus biogenesis protein PilE  46.94 
 
 		 130 aa  52  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1062  type IV pilus biogenesis protein PilE  46.94 
 
 		 130 aa  52  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4674  methylation  58.97 
 
 		 169 aa  52  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4155  fimbiral protein PilA  40 
 
 		 188 aa  52  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.614605  normal  0.158719 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0571  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.36 
 
 		 163 aa  52  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3227  type IV pilus biogenesis protein PilE  46.94 
 
 		 130 aa  52  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0154  general secretion pathway protein G  36.62 
 
 		 144 aa  52  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3312  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 		 138 aa  51.6  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00604  general secretion pathway protein G  30.84 
 
 		 146 aa  51.6  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2882  methylation site containing protein  43.1 
 
 		 138 aa  51.6  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0392  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.96 
 
 		 175 aa  51.6  0.000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000336485  hitchhiker  0.0000000727713 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001889  general secretion pathway protein G  25.36 
 
 		 147 aa  51.2  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1024  hypothetical protein  34.21 
 
 		 162 aa  51.2  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0096  hypothetical protein  30 
 
 		 163 aa  51.2  0.000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.062594 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1383  type IV pilin PilE  42 
 
 		 135 aa  51.2  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.140998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4679  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  47.92 
 
 		 168 aa  51.2  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4203  general secretion pathway protein G  36.92 
 
 		 144 aa  51.2  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0156  general secretion pathway protein G  36.92 
 
 		 144 aa  51.2  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0676  type IV pilin  39.34 
 
 		 144 aa  51.2  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256255  normal  0.685259 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2143  pilin, putative  37.31 
 
 		 185 aa  51.2  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.200029  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0156  general secretion pathway protein G  36.92 
 
 		 144 aa  51.2  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.051245 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5185  protein involved in methylation  43.1 
 
 		 174 aa  51.2  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101493  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5198  fimbrial protein pilin  50 
 
 		 148 aa  51.2  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0719  type IV pilin  39.34 
 
 		 144 aa  51.2  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.464442  normal  0.176419 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3248  hypothetical protein  39.68 
 
 		 132 aa  51.2  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2914  type IV pilin PilE  36.92 
 
 		 144 aa  51.2  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0462503 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0152  general secretion pathway protein G  36.92 
 
 		 144 aa  50.8  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4040  fimbrial protein pilin  34.62 
 
 		 178 aa  50.8  0.000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  34.88 
 
 		 168 aa  50.8  0.000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0475  fimbrial protein pilin  57.14 
 
 		 139 aa  50.8  0.000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.665132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1096  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40 
 
 		 157 aa  50.8  0.000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.292656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0384  putative pilin  45.83 
 
 		 147 aa  50.8  0.000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2886  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  50 
 
 		 170 aa  50.8  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.308484  normal  0.94282 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60320  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  36.76 
 
 		 141 aa  50.8  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000362369 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0265  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.58 
 
 		 166 aa  50.8  0.000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.319115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0799  fimbrial protein pilin  47.17 
 
 		 139 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0744296  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>