237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2143 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2143  pilin, putative  100 
 
 		 185 aa  373  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.200029  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2144  pilus-related protein, putative  36.56 
 
 		 196 aa  72  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1383  type IV pilin PilE  37.14 
 
 		 135 aa  53.1  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.140998  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0417  pilin, putative  54.35 
 
 		 138 aa  52.8  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0816  type IV pilus biogenesis protein  30.7 
 
 		 133 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0314  general secretion pathway protein  53.19 
 
 		 147 aa  52.4  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0421  methylation site containing protein  54.35 
 
 		 142 aa  51.6  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000175547  normal  0.0256712 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1078  pilin  47.14 
 
 		 162 aa  51.2  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.18456 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20891  pilin  37.31 
 
 		 170 aa  51.2  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3388  methylation  54 
 
 		 138 aa  51.2  0.000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0472  fimbrial protein pilin  42.17 
 
 		 182 aa  50.8  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.877435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3918  methylation site containing protein  55.81 
 
 		 143 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000265425  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1999  fimbrial protein  48.94 
 
 		 153 aa  50.1  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1007  general secretion pathway protein G  29 
 
 		 145 aa  49.3  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3266  general secretion pathway protein G  29 
 
 		 145 aa  49.3  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000062887  hitchhiker  0.00000000000000294917 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0956  general secretion pathway protein G  29 
 
 		 145 aa  49.3  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.194745  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  48.94 
 
 		 152 aa  49.3  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2857  general secretion pathway protein G  30.53 
 
 		 157 aa  48.1  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17770  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain-containing protein  33.04 
 
 		 135 aa  48.5  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.775526 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1415  general secretion pathway protein G  30.53 
 
 		 146 aa  48.1  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004288  putative fimbrial assembly protein PilE  37.5 
 
 		 163 aa  47.8  0.00009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3896  Fimbrial protein pilin  42.47 
 
 		 133 aa  47.4  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0720  fimbrial protein pilin  40.98 
 
 		 133 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2921  general secretion pathway protein G  28.57 
 
 		 149 aa  47.4  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1473  general secretion pathway protein G  30.53 
 
 		 150 aa  47.4  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.660645  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03468  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  47.83 
 
 		 141 aa  47.4  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1217  type IV pilus biogenesis protein PilE  36.36 
 
 		 141 aa  47  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0799  fimbrial protein pilin  61.11 
 
 		 139 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0744296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5161  type IV pilin structural subunit  32.14 
 
 		 179 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0391  hypothetical protein  56.76 
 
 		 138 aa  46.6  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  7.588550000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0842  hypothetical protein  51.11 
 
 		 193 aa  46.6  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1302  general secretion pathway protein G  30.53 
 
 		 153 aa  46.6  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0475  fimbrial protein pilin  48.78 
 
 		 139 aa  46.2  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.665132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0059  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  48.78 
 
 		 151 aa  47  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.230525 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2629  type IV pilus subunit PilA  48.78 
 
 		 138 aa  45.8  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3356  fimbrial protein pilin: general secretion pathway protein H  45.65 
 
 		 137 aa  45.8  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.669833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60320  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  29.84 
 
 		 141 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000362369 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2886  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.4 
 
 		 170 aa  46.2  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.308484  normal  0.94282 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0414  methylation site containing protein  49.02 
 
 		 148 aa  45.4  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0331  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  48.78 
 
 		 172 aa  45.4  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1822  type IV pilin  31.96 
 
 		 138 aa  45.8  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0523524  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2449  Fimbrial protein pilin  41.56 
 
 		 162 aa  45.8  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000426279  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1510  fimbrial protein  40 
 
 		 138 aa  45.4  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.0000000690325  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0933  hypothetical protein  46.88 
 
 		 527 aa  45.4  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000356044  hitchhiker  0.000000000476431 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45.83 
 
 		 168 aa  45.4  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1487  fimbrial protein EcpC precursor  44.44 
 
 		 164 aa  45.1  0.0006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0651614  normal  0.606044 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3311  fimbrial protein pilin  37.5 
 
 		 137 aa  45.1  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3363  methylation  64.71 
 
 		 139 aa  45.1  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.57133  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3175  Fimbrial protein pilin  51.22 
 
 		 134 aa  45.1  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0376  hypothetical protein  39.66 
 
 		 174 aa  45.1  0.0006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000272235  hitchhiker  0.0000000000782624 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0260  pilin polypeptide  41.67 
 
 		 187 aa  45.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2413  type II secretion system protein G  40.68 
 
 		 149 aa  45.1  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330838  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3945  fimbrial protein pilin  55.26 
 
 		 166 aa  45.1  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.373423  hitchhiker  0.00130999 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4819  general secretion pathway protein H  47.73 
 
 		 138 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80083  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3946  fimbrial protein pilin  55.26 
 
 		 169 aa  45.1  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129399 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5198  fimbrial protein pilin  44.64 
 
 		 148 aa  45.1  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0349  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.18 
 
 		 179 aa  44.7  0.0008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2904  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  36.25 
 
 		 168 aa  44.7  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.3004 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2675  general secretion pathway protein H  43.86 
 
 		 198 aa  44.7  0.0009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1488  hypothetical protein  43.9 
 
 		 158 aa  44.7  0.0009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.109192  normal  0.403243 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3255  hypothetical protein  32.97 
 
 		 140 aa  44.7  0.0009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0651  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  50 
 
 		 165 aa  43.9  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0557  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  48.08 
 
 		 173 aa  44.3  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1524  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  47.37 
 
 		 159 aa  44.3  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000584644  unclonable  2.6975300000000003e-19 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  46.34 
 
 		 157 aa  43.9  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0485  fimbrial protein pilin  60.61 
 
 		 136 aa  43.9  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1036  hypothetical protein  45.45 
 
 		 131 aa  43.9  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5973  general secretion pathway protein H  35.63 
 
 		 198 aa  43.9  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0600966 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0480  pilin subfamily protein  56.1 
 
 		 174 aa  44.3  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1495  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45 
 
 		 167 aa  44.3  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.70798  normal  0.112729 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2126  methylation  60.61 
 
 		 146 aa  44.3  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.196428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  48.78 
 
 		 141 aa  44.3  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4674  methylation  51.28 
 
 		 169 aa  44.3  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3341  methylation  53.85 
 
 		 205 aa  43.9  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000885834  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2035  hypothetical protein  43.86 
 
 		 198 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0613  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  47.37 
 
 		 165 aa  44.3  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0934015 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3313  methylation site containing protein  42.11 
 
 		 144 aa  43.9  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.936741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0689  putative Tfp pilus assembly protein PilE  42.31 
 
 		 151 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.786204  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0692  hypothetical protein  39.02 
 
 		 548 aa  44.3  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000140435  unclonable  7.26108e-19 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2646  hypothetical protein  43.86 
 
 		 198 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1532  putative transformation system protein CtsG  38.57 
 
 		 190 aa  44.3  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0340  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  50 
 
 		 165 aa  43.9  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0864  pilin  57.58 
 
 		 163 aa  43.9  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484071 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3758  hypothetical protein  44 
 
 		 174 aa  43.9  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0723  type-4 fimbrial pilin-like transmembrane protein  36.84 
 
 		 161 aa  43.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4570  MSHA pilin protein MshB  62.86 
 
 		 229 aa  43.5  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.527275  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0853  pilin, putative  48.48 
 
 		 144 aa  43.5  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0477  putative type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  51.35 
 
 		 173 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0748911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0345  general secretion pathway protein H  34.38 
 
 		 176 aa  43.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177644  normal  0.0749297 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0138  putative pilus assembly protein  39.34 
 
 		 149 aa  43.5  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0576  hypothetical protein  44.44 
 
 		 174 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0726397 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0709  methylation site containing protein  42.5 
 
 		 144 aa  43.1  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1097  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  34.48 
 
 		 151 aa  43.5  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.282151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0864  methylation site containing protein  43.9 
 
 		 145 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3189  fimbrial protein pilin  51.16 
 
 		 162 aa  43.5  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.208  normal  0.535395 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4040  fimbrial protein pilin  59.38 
 
 		 178 aa  43.5  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0324  hypothetical protein  56.25 
 
 		 167 aa  43.5  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00212965  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0395  methylation site containing protein  51.28 
 
 		 211 aa  43.1  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0635812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1828  fimbrial protein pilin  45.95 
 
 		 170 aa  43.1  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.10224  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0093  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  47.37 
 
 		 169 aa  43.1  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0563183 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>