More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0799 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_0799  fimbrial protein pilin  100 
 
 		 139 aa  272  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0744296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0478  prepilin peptidase dependent protein D  42.52 
 
 		 134 aa  88.6  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.183909  normal  0.878303 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3344  prepilin-type cleavage/methylation  44.2 
 
 		 148 aa  88.2  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.62769  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4444  type IV pilin  42.18 
 
 		 160 aa  87.4  6e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0164  putative major pilin subunit  39.02 
 
 		 145 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.268979  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0111  putative major pilin subunit  38.21 
 
 		 146 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.273778  normal  0.482641 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0652  putative major pilin subunit  37.4 
 
 		 145 aa  85.5  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0110  putative major pilin subunit  37.4 
 
 		 146 aa  84.7  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000976692  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0927  type IV pilus biogenesis protein  42.11 
 
 		 142 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00107  predicted major pilin subunit  37.4 
 
 		 146 aa  84.7  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.686894  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3494  putative major pilin subunit  37.4 
 
 		 146 aa  84.7  4e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3551  putative major pilin subunit  37.4 
 
 		 146 aa  84.7  4e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000125636 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0114  putative major pilin subunit  38.18 
 
 		 146 aa  84.7  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00878541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0158  putative major pilin subunit  38.21 
 
 		 145 aa  84.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.320147 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00106  hypothetical protein  37.4 
 
 		 146 aa  84.7  4e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0156  putative major pilin subunit  38.21 
 
 		 145 aa  84.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0157  putative major pilin subunit  38.21 
 
 		 145 aa  84.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0250  fimbrial subunit  43.09 
 
 		 152 aa  83.6  7e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0333044  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0161  putative major pilin subunit  37.4 
 
 		 145 aa  84  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3575  putative major pilin subunit  36.59 
 
 		 148 aa  82  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.270372  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0627  putative major pilin subunit  37.5 
 
 		 147 aa  81.6  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0240  pilus assembly protein major pilin PilA  47.06 
 
 		 139 aa  81.6  0.000000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0628338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2540  general secretion pathway protein H  45 
 
 		 147 aa  81.6  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.13206  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5185  protein involved in methylation  44.27 
 
 		 174 aa  81.6  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101493  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1041  putative major pilin subunit  35.29 
 
 		 154 aa  81.3  0.000000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.131052 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3370  putative major pilin subunit  35.29 
 
 		 154 aa  81.3  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.981789  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3498  putative major pilin subunit  35.29 
 
 		 154 aa  81.3  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0485  fimbrial protein pilin  45.45 
 
 		 136 aa  80.9  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2680  fimbrial protein pilin  47.11 
 
 		 169 aa  80.5  0.000000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0726827  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0778  putative major pilin subunit  40.98 
 
 		 149 aa  80.1  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.282889 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4674  methylation  57.97 
 
 		 169 aa  79.7  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1265  methylation  44.8 
 
 		 160 aa  79  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00964428  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4040  fimbrial protein pilin  42.65 
 
 		 178 aa  79  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58730  type IV pilin structural subunit  47.9 
 
 		 179 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.279942  normal  0.457351 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0666  putative major pilin subunit  34.17 
 
 		 147 aa  76.3  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1889  hypothetical protein  40.3 
 
 		 137 aa  76.3  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0557  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  42.86 
 
 		 173 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1878  hypothetical protein  39.39 
 
 		 137 aa  75.9  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5973  general secretion pathway protein H  39.74 
 
 		 198 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0600966 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2675  general secretion pathway protein H  37.75 
 
 		 198 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03231  type IV pilin  45.74 
 
 		 141 aa  75.9  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0578635  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1879  hypothetical protein  47.18 
 
 		 137 aa  75.1  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2035  hypothetical protein  37.75 
 
 		 198 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0065  pilin  42.48 
 
 		 170 aa  75.5  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.154072 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2646  hypothetical protein  37.75 
 
 		 198 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1510  fimbrial protein  41.67 
 
 		 138 aa  74.7  0.0000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.0000000690325  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12104  fimbrial protein  43.9 
 
 		 165 aa  74.3  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.246946  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2693  general secretion pathway protein H  39.87 
 
 		 198 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.289926  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2567  general secretion pathway protein H  39.87 
 
 		 198 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0476  methylation site containing protein  53.97 
 
 		 141 aa  73.9  0.0000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.991113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0478  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  42.66 
 
 		 169 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.322644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0480  pilin subfamily protein  37.88 
 
 		 174 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3604  methylation site containing protein  39.69 
 
 		 150 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0981563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4782  Tfp pilus assembly protein  43.62 
 
 		 179 aa  72.8  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0558  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  45.45 
 
 		 168 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0656  general secretion pathway protein H  37.91 
 
 		 199 aa  72  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0864  pilin  46.43 
 
 		 163 aa  71.6  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484071 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0477  prepilin-type cleavage/methylation  44.87 
 
 		 148 aa  72  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.695821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0414  methylation site containing protein  56.72 
 
 		 148 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5161  type IV pilin structural subunit  61.11 
 
 		 179 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1950  type 4 major prepilin protein  38.24 
 
 		 140 aa  70.9  0.000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0248  type IV-A pilin protein PilA  38.24 
 
 		 140 aa  70.9  0.000000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4679  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  58.93 
 
 		 168 aa  70.5  0.000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1890  hypothetical protein  46.1 
 
 		 136 aa  70.5  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0472  fimbrial protein pilin  49.33 
 
 		 182 aa  70.1  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.877435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3762  putative major pilin subunit  36.59 
 
 		 148 aa  68.9  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0677  putative type IV fimbrial pilin protein  42.2 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0477  putative type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  39.52 
 
 		 173 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0748911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3289  putative type IV fimbrial pilin protein  42.2 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.213615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0548  hypothetical protein  35.88 
 
 		 169 aa  67  0.00000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0314  general secretion pathway protein  41.38 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3388  methylation  40 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3387  fgenesh4_pg.C_scaffold_2883000002  78.95 
 
 		 196 aa  66.6  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.437334  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3356  fimbrial protein pilin: general secretion pathway protein H  57.14 
 
 		 137 aa  65.9  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.669833  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0463  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  46.55 
 
 		 167 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0446  putative type IV fimbrial pilin protein  35.76 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.590776 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0467  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  42.61 
 
 		 171 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.568157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0816  putative type IV pilin protein PilA  36.18 
 
 		 172 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0278  type IV pilin, putative  36.18 
 
 		 172 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0820  putative type IV pilin protein PilA  36.18 
 
 		 172 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0241  pilus assembly protein major pilin PilA  42.75 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0389135  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2449  Fimbrial protein pilin  63.04 
 
 		 162 aa  64.7  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000426279  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3918  methylation site containing protein  51.61 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000265425  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0417  pilin, putative  42.99 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0979  PilA  36.42 
 
 		 207 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2398  putative type IV pilin  36.42 
 
 		 207 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.558979  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3946  fimbrial protein pilin  82.86 
 
 		 169 aa  63.9  0.0000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129399 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0011  putative type IV pilin  36.42 
 
 		 189 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2678  putative type IV pilin  36.42 
 
 		 189 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1828  fimbrial protein pilin  46.67 
 
 		 170 aa  63.2  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.10224  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3945  fimbrial protein pilin  80 
 
 		 166 aa  62.8  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.373423  hitchhiker  0.00130999 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0370  prepilin-type cleavage/methylation  51.14 
 
 		 157 aa  63.2  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000439379  unclonable  0.00000838241 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2629  type IV pilus subunit PilA  46.67 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002546  type IV pilin PilA  36.36 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.790868  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4819  general secretion pathway protein H  48.39 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80083  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2904  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  53.7 
 
 		 168 aa  61.2  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.3004 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0421  methylation site containing protein  56.9 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000175547  normal  0.0256712 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0797  pilin  42.28 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0649  pilin family protein  35.26 
 
 		 207 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0864  peptidase S49, protease IV  43.7 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>