More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0138 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0138  putative pilus assembly protein  100 
 
 		 149 aa  306  4e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3311  fimbrial protein pilin  63.85 
 
 		 137 aa  171  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2997  type II secretion system protein G  54.01 
 
 		 135 aa  147  4e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000413298 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1931  type II secretion system protein G  52.76 
 
 		 138 aa  147  7e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000053439  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1460  type II secretion system protein G  52.17 
 
 		 153 aa  145  3e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52288  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1857  N-terminal methylation  51.91 
 
 		 140 aa  143  8.000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2413  type II secretion system protein G  50 
 
 		 149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330838  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1286  type II secretion system protein G  53.28 
 
 		 135 aa  130  5e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1776  pilin domain-containing protein  50.41 
 
 		 121 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3218  general secretion pathway protein G  48.03 
 
 		 126 aa  114  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.427151 
 
 
-
 
NC_003296  RS00348  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  47.58 
 
 		 128 aa  113  8.999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3886  type II secretion system protein G  44.35 
 
 		 122 aa  112  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1441  type II secretion system protein G  46.77 
 
 		 129 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000189967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1334  methylation  44.35 
 
 		 133 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.372792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2412  methylation  45.16 
 
 		 126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2581  N-terminal methylation site  44 
 
 		 138 aa  110  6e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02979  putative general secretion pathway GSPG related transmembrane protein  46.77 
 
 		 129 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.811632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1999  general secretion pathway protein G  41.98 
 
 		 131 aa  107  7.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1302  type II secretion system protein  46.67 
 
 		 124 aa  105  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0879623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2621  type II secretion system protein G  44.83 
 
 		 184 aa  99.4  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1989  hypothetical protein  41.73 
 
 		 124 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0788365  normal  0.18788 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2470  type II secretion system protein G  40.16 
 
 		 124 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.335351  normal  0.427711 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29080  general secretion pathway protein G  40.94 
 
 		 124 aa  97.4  6e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3476  type II secretion system protein G  39.37 
 
 		 128 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0390478  normal  0.854758 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2295  type II secretion system protein G  39.37 
 
 		 124 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.478951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1440  type II secretion system protein G  41.73 
 
 		 131 aa  97.1  8e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0197781  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2461  type II secretion system protein G  38.58 
 
 		 124 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.508549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4704  Type II secretion system protein G  42.34 
 
 		 145 aa  88.6  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0140964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1301  type II secretion system protein  37.34 
 
 		 168 aa  82.4  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.12689  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2301  putative GSPG-related protein  38.32 
 
 		 130 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.152629  normal  0.0321295 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29090  general secretion pathway protein G  33.96 
 
 		 160 aa  78.6  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.260708  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02978  putative general secretion pathway GSPG related transmembrane protein  35.71 
 
 		 172 aa  77.4  0.00000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.671308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1440  type II secretion system transmembrane protein  38.46 
 
 		 158 aa  76.3  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00799419  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00349  putative general secretion pathway GSPG-related transmembrane protein  33.33 
 
 		 158 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2582  N-terminal methylation site  29.41 
 
 		 170 aa  73.2  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3217  N-terminal methylation site  34.19 
 
 		 159 aa  72  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.280155 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4795  putative general (Type II) secretion pathway protein  30.46 
 
 		 223 aa  70.5  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.954024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2413  methylation  32.48 
 
 		 157 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3885  hypothetical protein  32.03 
 
 		 161 aa  67.8  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2302  GSPG-like signal peptide protein  31.37 
 
 		 172 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.186261  normal  0.0333639 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1988  hypothetical protein  31.41 
 
 		 157 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0923651  normal  0.190547 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1998  general secretion pathway protein G  31.91 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4705  putative secretion type II protein  30.32 
 
 		 176 aa  65.5  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0420147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1858  N-terminal methylation  29.87 
 
 		 161 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.450176 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0137  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  32.45 
 
 		 161 aa  61.2  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0720  fimbrial protein pilin  41.54 
 
 		 133 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0816  type IV pilus biogenesis protein  41.54 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1865  pilus assembly protein  41.67 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1335  methylation  35.03 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0885873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2620  putative general secretion pathway GspG related transmembrane protein  30.19 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1777  hypothetical protein  29.09 
 
 		 177 aa  57.8  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00171207  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2680  type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  32 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0580057 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1678  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  29.61 
 
 		 163 aa  57.4  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3477  hypothetical protein  32.92 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103302  normal  0.864591 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  33.66 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  33.66 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1217  type IV pilus biogenesis protein PilE  27.91 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1930  hypothetical protein  28.22 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000900532  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2414  general secretion pathway protein G  31.65 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2294  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  32.92 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.797755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  34 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2460  secretion type II protein  32.92 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.839329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2916  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  35.78 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1439  general secretion pathway GspG related transmembrane protein  31.65 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0119159  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1383  type IV pilin PilE  36.67 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.140998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1073  general secretion pathway protein G  28.83 
 
 		 155 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.56277  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0872  general secretion pathway protein H  30.88 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.854476  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2469  G protein signal peptide-like secretion type II protein  32.05 
 
 		 157 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354384  normal  0.562325 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0505  fimbrial protein pilin  37.1 
 
 		 159 aa  53.1  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0463  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  34.94 
 
 		 167 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1507  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  34.09 
 
 		 121 aa  52.4  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000010883  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2154  Tfp pilus assembly protein PilE  32.43 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0253  general secretion pathway protein G  36.73 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2096  pilin domain protein  40.68 
 
 		 70 aa  52  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000511675  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3824  fimbrial protein pilin  37.1 
 
 		 164 aa  52.8  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0456668 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2826  Tfp pilus assembly protein  38.1 
 
 		 153 aa  52  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0621265 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1442  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  41.54 
 
 		 155 aa  51.2  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.102563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4177  general secretion pathway protein G  27.66 
 
 		 144 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.250819  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5185  protein involved in methylation  57.45 
 
 		 174 aa  51.2  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101493  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5180  fimbrial protein pilin  32.56 
 
 		 169 aa  51.2  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0088813  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1316  type II secretory pathway protein LspG  30.61 
 
 		 140 aa  51.2  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1313  type II secretory pathway protein LspG  30.61 
 
 		 140 aa  51.2  0.000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1265  methylation  37.21 
 
 		 160 aa  51.2  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00964428  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0682  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  31.43 
 
 		 165 aa  51.2  0.000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0723462  hitchhiker  0.000000000174273 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1702  type IV pilin  37.14 
 
 		 151 aa  50.8  0.000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.135824  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1822  type IV pilin  39.68 
 
 		 138 aa  51.2  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0523524  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2612  general secretion pathway protein G  32.54 
 
 		 153 aa  50.8  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.688921 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1764  type IV pilin  37.14 
 
 		 151 aa  50.8  0.000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.940075  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2091  general secretion pathway protein G  36.05 
 
 		 152 aa  50.4  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0177627  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0231  general secretion pathway protein G  33.01 
 
 		 149 aa  50.4  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4829  HxcT pseudopilin  32.26 
 
 		 149 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1049  general secretion pathway protein G  29 
 
 		 151 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1088  hypothetical protein  29.41 
 
 		 338 aa  50.1  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1999  fimbrial protein  37.29 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1107  methylation site containing protein  28.57 
 
 		 130 aa  50.1  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.963603 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5689  general secretion pathway protein G  29.27 
 
 		 158 aa  49.7  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128164  normal  0.128064 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3940  general secretion pathway protein G  31.63 
 
 		 154 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.18178 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0102  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.573705  normal  0.0126574 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3550  Tfp pilus assembly protein PilE  39.66 
 
 		 164 aa  50.1  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.844187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0926  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  40.74 
 
 		 171 aa  50.1  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000619994  hitchhiker  8.71814e-18 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>