282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_004288 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_004288  putative fimbrial assembly protein PilE  100 
 
 		 163 aa  336  9e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01136  Tfp pilus assembly protein PilE  75 
 
 		 128 aa  200  6e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0384  putative pilin  41.89 
 
 		 147 aa  121  5e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0671  hypothetical protein  44.83 
 
 		 143 aa  118  3e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.228298  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3128  methylation site containing protein  36.57 
 
 		 132 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.932633 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3255  hypothetical protein  31.47 
 
 		 140 aa  73.6  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3168  prepilin-type cleavage/methylation  32.06 
 
 		 130 aa  72.8  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1067  methylation site containing protein  34.88 
 
 		 130 aa  71.2  0.000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3031  methylation site containing protein  36.43 
 
 		 133 aa  70.5  0.000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1865  pilus assembly protein  35 
 
 		 134 aa  69.3  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1202  type IV pilus biogenesis protein PilE  34.88 
 
 		 130 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1383  type IV pilin PilE  32.35 
 
 		 135 aa  68.6  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.140998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1107  methylation site containing protein  31.58 
 
 		 130 aa  67  0.00000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.963603 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2680  type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  32.06 
 
 		 146 aa  65.1  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0580057 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2540  fimbrial protein pilin  37.8 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2882  methylation site containing protein  32.61 
 
 		 138 aa  63.9  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2154  Tfp pilus assembly protein PilE  28.78 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0852  methylation site containing protein  33.85 
 
 		 131 aa  63.2  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3170  methylation site containing protein  33.85 
 
 		 131 aa  63.2  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2916  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  32.09 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1299  Type IV pilus biogenesis protein PilE  31.11 
 
 		 128 aa  62.8  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.799661 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1217  type IV pilus biogenesis protein PilE  30.66 
 
 		 141 aa  62  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1129  type IV pilus biogenesis protein PilE  33.33 
 
 		 130 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2882  methylation  34.67 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.938712  normal  0.364905 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5198  fimbrial protein pilin  31.2 
 
 		 148 aa  62  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1164  type IV pilus biogenesis protein PilE  33.58 
 
 		 130 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.536283 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2949  methylation site containing protein  33.55 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0811797  normal  0.399462 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2904  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  30.53 
 
 		 168 aa  61.2  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.3004 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01325  type IV pilin  34.11 
 
 		 122 aa  60.8  0.000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.113469  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1062  type IV pilus biogenesis protein PilE  33.33 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3227  type IV pilus biogenesis protein PilE  33.33 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0932  type IV pilus biogenesis protein PilE  35.94 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0340511  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0461  fimbrial protein precursor PilE (MS11 antigen)  45.76 
 
 		 167 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2914  type IV pilin PilE  31.21 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0462503 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0720  fimbrial protein pilin  35.21 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3170  prepilin-type cleavage/methylation  50 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.647515  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0719  type IV pilin  32.12 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.464442  normal  0.176419 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0816  type IV pilus biogenesis protein  47.76 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0676  type IV pilin  31.39 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256255  normal  0.685259 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1702  type IV pilin  28.03 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.135824  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0220  pilus assembly protein  35.46 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.168362 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3189  fimbrial protein pilin  39.05 
 
 		 162 aa  57.4  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.208  normal  0.535395 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1764  type IV pilin  28.03 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.940075  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1091  methylation site containing protein  31.58 
 
 		 130 aa  56.6  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0872  general secretion pathway protein H  53.85 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.854476  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0505  fimbrial protein pilin  32.5 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0681  type-IV pilin  25.55 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0664  type-IV pilin  26.62 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3356  fimbrial protein pilin: general secretion pathway protein H  31.9 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.669833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  29.71 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2886  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  28.57 
 
 		 170 aa  53.9  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.308484  normal  0.94282 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20891  pilin  48.98 
 
 		 170 aa  53.9  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3550  Tfp pilus assembly protein PilE  46.94 
 
 		 164 aa  53.1  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.844187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3224  type IV pilin  32.62 
 
 		 141 aa  52.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0926  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  42.62 
 
 		 171 aa  52.8  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000619994  hitchhiker  8.71814e-18 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2096  pilin domain protein  50 
 
 		 70 aa  53.1  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000511675  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2663  type IV pilus biogenesis protein PilE  36.99 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0634  fimbrial protein pilin  36.92 
 
 		 136 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1999  fimbrial protein  42.11 
 
 		 153 aa  52  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0771  hypothetical protein  30.56 
 
 		 142 aa  52.4  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.25436 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1143  fimbrillin  39.29 
 
 		 180 aa  52.4  0.000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0675  fimbrial protein pilin  36.92 
 
 		 136 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357739 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0314  general secretion pathway protein  32.41 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0475  fimbrial protein pilin  51.06 
 
 		 139 aa  52.4  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.665132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3901  putative Tfp pilus assembly protein PilE  42.86 
 
 		 148 aa  51.6  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0477  putative type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  55.81 
 
 		 173 aa  52  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0748911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3918  methylation site containing protein  51.06 
 
 		 143 aa  52  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000265425  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0680  fimbrial protein pilin  37.7 
 
 		 136 aa  52  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5196  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  31.82 
 
 		 141 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2826  Tfp pilus assembly protein  42.86 
 
 		 153 aa  52  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0621265 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2675  general secretion pathway protein H  36.59 
 
 		 198 aa  51.2  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0463  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  43.86 
 
 		 167 aa  50.8  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  36.19 
 
 		 152 aa  50.8  0.000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3896  Fimbrial protein pilin  44.44 
 
 		 133 aa  50.8  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0520  type IV pilin  26.52 
 
 		 136 aa  50.8  0.000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2275  general secretion pathway protein H  30.36 
 
 		 164 aa  50.4  0.000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1661  type 4 pili biogenesis protein (prepilin-like protein)  26.52 
 
 		 136 aa  50.8  0.000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.507585  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2035  hypothetical protein  35.37 
 
 		 198 aa  50.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2646  hypothetical protein  35.37 
 
 		 198 aa  50.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0723  type-4 fimbrial pilin-like transmembrane protein  30.84 
 
 		 161 aa  50.4  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4536  fimbrial protein pilin  30.56 
 
 		 136 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0788  fimbrial protein pilin  30.2 
 
 		 163 aa  50.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.684386  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0896  fimbrillin  37.5 
 
 		 180 aa  50.4  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2664  methylation  32.35 
 
 		 160 aa  50.1  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2024  hypothetical protein  36.36 
 
 		 173 aa  50.1  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.833436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0239  pilus assembly protein PilE  33.9 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.179125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4819  general secretion pathway protein H  29.13 
 
 		 138 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80083  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5973  general secretion pathway protein H  35.37 
 
 		 198 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0600966 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0263  pilin polypeptide  33.57 
 
 		 178 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0472  fimbrial protein pilin  29.03 
 
 		 182 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.877435  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0086  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  28.89 
 
 		 150 aa  48.9  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2567  general secretion pathway protein H  26.98 
 
 		 198 aa  48.9  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3824  fimbrial protein pilin  32.43 
 
 		 164 aa  48.9  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0456668 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2693  general secretion pathway protein H  26.98 
 
 		 198 aa  48.9  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.289926  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0571  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  60.53 
 
 		 163 aa  48.9  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3524  type IV pilus biogenesis protein PilE  33.59 
 
 		 130 aa  48.5  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0927  type IV pilus biogenesis protein  51.11 
 
 		 142 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2575  putative Tfp pilus assembly protein PilE  45.28 
 
 		 143 aa  48.5  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.253595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60320  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  52.38 
 
 		 141 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000362369 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0294  pilus assembly protein  31.11 
 
 		 133 aa  48.5  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.429546  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>