More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_2126 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_2126  methylation  100 
 
 
146 aa  287  3e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.196428  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3896  Fimbrial protein pilin  48.28 
 
 
133 aa  114  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3356  fimbrial protein pilin: general secretion pathway protein H  53.62 
 
 
137 aa  110  6e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.669833  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4819  general secretion pathway protein H  45.26 
 
 
138 aa  93.6  9e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80083  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0634  fimbrial protein pilin  44.96 
 
 
136 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0680  fimbrial protein pilin  45.74 
 
 
136 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0675  fimbrial protein pilin  45.74 
 
 
136 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0357739 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4536  fimbrial protein pilin  45.74 
 
 
136 aa  87.4  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0475  fimbrial protein pilin  42.75 
 
 
139 aa  85.9  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.665132  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3422  fimbrial protein pilin  47.01 
 
 
148 aa  84.7  4e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1999  fimbrial protein  43.94 
 
 
153 aa  83.6  7e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2629  type IV pilus subunit PilA  44.53 
 
 
138 aa  83.2  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2540  general secretion pathway protein H  43.38 
 
 
147 aa  79.3  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.13206  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03468  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  42.75 
 
 
141 aa  79  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2033  fimbrial protein pilin  44.76 
 
 
146 aa  78.2  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.244331  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0472  fimbrial protein pilin  36.42 
 
 
182 aa  77.8  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.877435  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2112  fimbrial protein  45.45 
 
 
146 aa  77.8  0.00000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5161  type IV pilin structural subunit  41.91 
 
 
179 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2200  pilus assembly protein PilA  62.12 
 
 
111 aa  74.3  0.0000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.360457  hitchhiker  0.000654211 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3175  Fimbrial protein pilin  36.72 
 
 
134 aa  73.2  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4679  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  47.42 
 
 
168 aa  73.6  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4444  type IV pilin  60 
 
 
160 aa  71.6  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3918  methylation site containing protein  45.05 
 
 
143 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000265425  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2680  fimbrial protein pilin  69.23 
 
 
169 aa  71.6  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0726827  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0558  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  66 
 
 
168 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0480  pilin subfamily protein  66 
 
 
174 aa  69.3  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3176  Fimbrial protein pilin  47.37 
 
 
137 aa  69.7  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0463  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  39.42 
 
 
167 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0485  fimbrial protein pilin  39.86 
 
 
136 aa  69.7  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0477  prepilin-type cleavage/methylation  57.14 
 
 
148 aa  69.7  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.695821  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4040  fimbrial protein pilin  57.38 
 
 
178 aa  68.6  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736529  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3344  prepilin-type cleavage/methylation  55 
 
 
148 aa  68.9  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.62769  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0249  fimbrial protein pilin  39.29 
 
 
165 aa  68.9  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0478  prepilin peptidase dependent protein D  59.32 
 
 
134 aa  68.6  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.183909  normal  0.878303 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0896  fimbrillin  45.9 
 
 
180 aa  68.2  0.00000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0476  methylation site containing protein  57.14 
 
 
141 aa  68.2  0.00000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.991113  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1510  fimbrial protein  76.92 
 
 
138 aa  67.4  0.00000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.0000000690325  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3387  fgenesh4_pg.C_scaffold_2883000002  65.38 
 
 
196 aa  67.8  0.00000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.437334  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2449  Fimbrial protein pilin  41.88 
 
 
162 aa  67.8  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000426279  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0065  pilin  66 
 
 
170 aa  67.8  0.00000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.154072 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4674  methylation  33.99 
 
 
169 aa  67.4  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0478  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  76.32 
 
 
169 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.322644  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0864  pilin  70.45 
 
 
163 aa  67.4  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.484071 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3946  fimbrial protein pilin  65.38 
 
 
169 aa  67.4  0.00000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00129399 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1265  methylation  43.62 
 
 
160 aa  67  0.00000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00964428  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  50 
 
 
141 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0557  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  66 
 
 
173 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0417  pilin, putative  68.75 
 
 
138 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4782  Tfp pilus assembly protein  81.08 
 
 
179 aa  66.2  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2173  methylation  41.79 
 
 
146 aa  66.2  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1143  fimbrillin  44.26 
 
 
180 aa  66.2  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58730  type IV pilin structural subunit  66 
 
 
179 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.279942  normal  0.457351 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0421  methylation site containing protein  68.75 
 
 
142 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000175547  normal  0.0256712 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0927  type IV pilus biogenesis protein  66.67 
 
 
142 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0441  Fimbrial protein pilin  41.18 
 
 
167 aa  65.9  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0461  fimbrial protein precursor PilE (MS11 antigen)  40.52 
 
 
167 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653734  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3945  fimbrial protein pilin  62.75 
 
 
166 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.373423  hitchhiker  0.00130999 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5185  protein involved in methylation  32.54 
 
 
174 aa  65.1  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101493  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0627  putative major pilin subunit  37.98 
 
 
147 aa  64.7  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12104  fimbrial protein  57.38 
 
 
165 aa  64.3  0.0000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.246946  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0638  fimbrillin  46.58 
 
 
177 aa  64.3  0.0000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.37134  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0250  fimbrial subunit  40.18 
 
 
152 aa  63.9  0.0000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0333044  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2019  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  55.36 
 
 
130 aa  63.9  0.0000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3289  putative type IV fimbrial pilin protein  38.98 
 
 
207 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.213615  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0677  putative type IV fimbrial pilin protein  38.98 
 
 
207 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0314  general secretion pathway protein  65.91 
 
 
147 aa  62.8  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0467  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  75.68 
 
 
171 aa  62  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.568157  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4155  fimbiral protein PilA  50 
 
 
188 aa  62  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.614605  normal  0.158719 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1889  hypothetical protein  35.86 
 
 
137 aa  62.4  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5198  fimbrial protein pilin  38.46 
 
 
148 aa  62.4  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1383  type IV pilin PilE  45.05 
 
 
135 aa  62  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.140998  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2663  type IV pilus biogenesis protein PilE  50.91 
 
 
142 aa  62  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0477  putative type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  71.79 
 
 
173 aa  62  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0748911  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0666  putative major pilin subunit  36.84 
 
 
147 aa  61.6  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2540  fimbrial protein pilin  54.39 
 
 
140 aa  61.6  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1878  hypothetical protein  35.17 
 
 
137 aa  61.2  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3944  fimbrial protein pilin  49.28 
 
 
166 aa  61.6  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.736158  hitchhiker  0.00123211 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002546  type IV pilin PilA  75.68 
 
 
157 aa  61.2  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.790868  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3575  putative major pilin subunit  39.66 
 
 
148 aa  61.2  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.270372  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3388  methylation  63.27 
 
 
138 aa  61.2  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3128  methylation site containing protein  38.89 
 
 
132 aa  60.8  0.000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.932633 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0797  pilin  39.13 
 
 
148 aa  60.5  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0799  fimbrial protein pilin  70.27 
 
 
139 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0744296  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0872  general secretion pathway protein H  71.79 
 
 
152 aa  60.5  0.000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.854476  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0414  methylation site containing protein  67.44 
 
 
148 aa  60.1  0.000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0161  putative major pilin subunit  50 
 
 
145 aa  59.3  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5973  general secretion pathway protein H  62.22 
 
 
198 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0600966 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3189  fimbrial protein pilin  50.88 
 
 
162 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.208  normal  0.535395 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2035  hypothetical protein  62.22 
 
 
198 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2675  general secretion pathway protein H  62.22 
 
 
198 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0158  putative major pilin subunit  50 
 
 
145 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.320147 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2646  hypothetical protein  62.22 
 
 
198 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0384  putative pilin  35.35 
 
 
147 aa  60.1  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0852  methylation site containing protein  29.69 
 
 
145 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.992733 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3494  putative major pilin subunit  50 
 
 
146 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0156  putative major pilin subunit  50 
 
 
145 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1078  pilin  67.39 
 
 
162 aa  58.9  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.18456 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0271  putative pilin protein PilA  33.82 
 
 
154 aa  58.9  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.148513  normal  0.384028 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0446  putative type IV fimbrial pilin protein  33.57 
 
 
205 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.590776 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2567  general secretion pathway protein H  62.22 
 
 
198 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>