More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_2675 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_2675  general secretion pathway protein H  100 
 
 		 198 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2035  hypothetical protein  99.49 
 
 		 198 aa  388  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2646  hypothetical protein  99.49 
 
 		 198 aa  388  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5973  general secretion pathway protein H  93.94 
 
 		 198 aa  365  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0600966 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2567  general secretion pathway protein H  90.4 
 
 		 198 aa  347  1e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2693  general secretion pathway protein H  90.4 
 
 		 198 aa  347  1e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.289926  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0656  general secretion pathway protein H  85.5 
 
 		 199 aa  317  1e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0446  putative type IV fimbrial pilin protein  64.06 
 
 		 205 aa  236  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.590776 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0278  type IV pilin, putative  76.61 
 
 		 172 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0816  putative type IV pilin protein PilA  76.61 
 
 		 172 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0820  putative type IV pilin protein PilA  76.61 
 
 		 172 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2398  putative type IV pilin  77.38 
 
 		 207 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.558979  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0011  putative type IV pilin  77.38 
 
 		 189 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0979  PilA  77.38 
 
 		 207 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3289  putative type IV fimbrial pilin protein  75.6 
 
 		 207 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.213615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2678  putative type IV pilin  77.38 
 
 		 189 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0649  pilin family protein  75.6 
 
 		 207 aa  228  6e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0677  putative type IV fimbrial pilin protein  74.4 
 
 		 207 aa  227  9e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0477  putative type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  46.07 
 
 		 173 aa  135  5e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0748911  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0558  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  46.81 
 
 		 168 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0065  pilin  50.84 
 
 		 170 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.154072 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0480  pilin subfamily protein  42.94 
 
 		 174 aa  122  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0557  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  47.34 
 
 		 173 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0864  pilin  44.57 
 
 		 163 aa  118  7e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484071 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3387  fgenesh4_pg.C_scaffold_2883000002  41.29 
 
 		 196 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.437334  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0467  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  44.51 
 
 		 171 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.568157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58730  type IV pilin structural subunit  42.94 
 
 		 179 aa  108  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.279942  normal  0.457351 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3385  fgenesh4_pg.C_scaffold_2883000002  37.06 
 
 		 199 aa  103  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0478  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  42.26 
 
 		 169 aa  102  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.322644  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1889  hypothetical protein  40 
 
 		 137 aa  100  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2680  fimbrial protein pilin  39.13 
 
 		 169 aa  97.4  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0726827  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1878  hypothetical protein  40 
 
 		 137 aa  95.5  5e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1828  fimbrial protein pilin  36.76 
 
 		 170 aa  95.1  6e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.10224  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1890  hypothetical protein  43.18 
 
 		 136 aa  88.2  7e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1879  hypothetical protein  42.29 
 
 		 137 aa  85.9  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2540  general secretion pathway protein H  36.18 
 
 		 147 aa  84  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.13206  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0472  fimbrial protein pilin  38.46 
 
 		 182 aa  80.1  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.877435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0799  fimbrial protein pilin  37.75 
 
 		 139 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0744296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4782  Tfp pilus assembly protein  33.16 
 
 		 179 aa  74.3  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0485  fimbrial protein pilin  43.81 
 
 		 136 aa  73.6  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12104  fimbrial protein  32.04 
 
 		 165 aa  73.2  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.246946  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04886  pilin  33.33 
 
 		 141 aa  69.3  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.969324  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4781  Tfp pilus assembly protein  31.25 
 
 		 159 aa  69.7  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.431872  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4040  fimbrial protein pilin  33.33 
 
 		 178 aa  68.9  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1265  methylation  31.84 
 
 		 160 aa  68.2  0.00000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00964428  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0461  fimbrial protein precursor PilE (MS11 antigen)  47.22 
 
 		 167 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4674  methylation  54.39 
 
 		 169 aa  67  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5161  type IV pilin structural subunit  31.87 
 
 		 179 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0797  pilin  36.9 
 
 		 148 aa  64.7  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2904  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  44.94 
 
 		 168 aa  64.7  0.0000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.3004 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3946  fimbrial protein pilin  50 
 
 		 169 aa  63.9  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129399 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3945  fimbrial protein pilin  56.86 
 
 		 166 aa  63.5  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.373423  hitchhiker  0.00130999 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4679  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  39.6 
 
 		 168 aa  63.2  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2449  Fimbrial protein pilin  41.75 
 
 		 162 aa  63.5  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000426279  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3782  methylation site containing protein  39.13 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3944  fimbrial protein pilin  52.94 
 
 		 166 aa  62.4  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.736158  hitchhiker  0.00123211 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4819  general secretion pathway protein H  36.42 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80083  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0230  Fimbrial protein pilin  56 
 
 		 161 aa  62.4  0.000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1999  fimbrial protein  50 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3356  fimbrial protein pilin: general secretion pathway protein H  52.73 
 
 		 137 aa  61.2  0.000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.669833  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1510  fimbrial protein  30.99 
 
 		 138 aa  61.2  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.0000000690325  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2663  type IV pilus biogenesis protein PilE  46.67 
 
 		 142 aa  60.8  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5185  protein involved in methylation  49.15 
 
 		 174 aa  61.2  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101493  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3896  Fimbrial protein pilin  46.48 
 
 		 133 aa  60.8  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0463  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  54 
 
 		 167 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1078  pilin  52.08 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.18456 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2629  type IV pilus subunit PilA  58.7 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0475  fimbrial protein pilin  35.45 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.665132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2126  methylation  75.76 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.196428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3386  hypothetical protein  37.29 
 
 		 438 aa  58.9  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00409988 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1866  hypothetical protein  37.29 
 
 		 446 aa  58.9  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.287595  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03468  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  40.91 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1383  type IV pilin PilE  42.86 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.140998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3918  methylation site containing protein  42.67 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000265425  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002546  type IV pilin PilA  48.89 
 
 		 157 aa  57.8  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.790868  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0927  type IV pilus biogenesis protein  56.6 
 
 		 142 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2200  pilus assembly protein PilA  47.14 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.360457  hitchhiker  0.000654211 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0014  type IV pilin structural subunit  35.68 
 
 		 178 aa  57.4  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  49.02 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0473  fimbrial protein pilin  35.16 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0852  methylation site containing protein  27.74 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3170  methylation site containing protein  27.74 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3175  Fimbrial protein pilin  57.78 
 
 		 134 aa  54.7  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0864  peptidase S49, protease IV  40.37 
 
 		 139 aa  54.3  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3344  prepilin-type cleavage/methylation  50.98 
 
 		 148 aa  54.3  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.62769  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0627  putative major pilin subunit  36.84 
 
 		 147 aa  53.9  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4444  type IV pilin  41.27 
 
 		 160 aa  53.1  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0417  pilin, putative  61.9 
 
 		 138 aa  53.5  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0421  methylation site containing protein  61.9 
 
 		 142 aa  53.5  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000175547  normal  0.0256712 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2886  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.26 
 
 		 170 aa  53.5  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.308484  normal  0.94282 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1107  methylation site containing protein  57.14 
 
 		 130 aa  53.1  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.963603 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0340  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.42 
 
 		 165 aa  53.5  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5196  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  50 
 
 		 141 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2242  fimbrial protein pilin  56.6 
 
 		 151 aa  53.1  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0233874  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0314  general secretion pathway protein  38.46 
 
 		 147 aa  52.8  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0250  fimbrial subunit  39.58 
 
 		 152 aa  52.8  0.000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0333044  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0477  prepilin-type cleavage/methylation  36 
 
 		 148 aa  52.8  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.695821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0414  methylation site containing protein  63.64 
 
 		 148 aa  52.4  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0126  Tfp pilus assembly protein PilE-like  61.76 
 
 		 151 aa  52.4  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0148502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0872  general secretion pathway protein H  63.89 
 
 		 152 aa  52.8  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.854476  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>