More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0627 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0627  putative major pilin subunit  100 
 
 		 147 aa  299  1e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0666  putative major pilin subunit  76.87 
 
 		 147 aa  243  8e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3575  putative major pilin subunit  70.55 
 
 		 148 aa  220  4.9999999999999996e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.270372  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3762  putative major pilin subunit  71.43 
 
 		 148 aa  202  1e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0111  putative major pilin subunit  63.83 
 
 		 146 aa  192  1e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.273778  normal  0.482641 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0110  putative major pilin subunit  63.83 
 
 		 146 aa  192  1e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000976692  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00107  predicted major pilin subunit  63.83 
 
 		 146 aa  192  2e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.686894  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3494  putative major pilin subunit  63.83 
 
 		 146 aa  192  2e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00106  hypothetical protein  63.83 
 
 		 146 aa  192  2e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3551  putative major pilin subunit  63.83 
 
 		 146 aa  192  2e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000125636 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0157  putative major pilin subunit  63.38 
 
 		 145 aa  190  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0156  putative major pilin subunit  63.38 
 
 		 145 aa  190  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0114  putative major pilin subunit  63.12 
 
 		 146 aa  190  5e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00878541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0164  putative major pilin subunit  62.24 
 
 		 145 aa  189  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.268979  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0161  putative major pilin subunit  62.68 
 
 		 145 aa  189  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0158  putative major pilin subunit  63.12 
 
 		 145 aa  189  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.320147 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0652  putative major pilin subunit  60.99 
 
 		 145 aa  183  5e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0778  putative major pilin subunit  63.45 
 
 		 149 aa  159  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.282889 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3370  putative major pilin subunit  53.47 
 
 		 154 aa  157  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.981789  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3498  putative major pilin subunit  53.47 
 
 		 154 aa  157  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1041  putative major pilin subunit  53.47 
 
 		 154 aa  157  3e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.131052 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0250  fimbrial subunit  41.27 
 
 		 152 aa  103  1e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0333044  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0799  fimbrial protein pilin  37.5 
 
 		 139 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0744296  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1889  hypothetical protein  38.24 
 
 		 137 aa  76.3  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2540  general secretion pathway protein H  37.98 
 
 		 147 aa  73.2  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.13206  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0927  type IV pilus biogenesis protein  44.59 
 
 		 142 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0478  prepilin peptidase dependent protein D  45.21 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.183909  normal  0.878303 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002546  type IV pilin PilA  34.51 
 
 		 157 aa  69.3  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.790868  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1879  hypothetical protein  41.91 
 
 		 137 aa  68.2  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4444  type IV pilin  54.72 
 
 		 160 aa  65.9  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3604  methylation site containing protein  48.57 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0981563  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1878  hypothetical protein  33.82 
 
 		 137 aa  64.3  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0864  peptidase S49, protease IV  37.78 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0476  methylation site containing protein  46.03 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.991113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58730  type IV pilin structural subunit  38.46 
 
 		 179 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.279942  normal  0.457351 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0463  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  35.29 
 
 		 167 aa  62  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1265  methylation  39.33 
 
 		 160 aa  62.8  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00964428  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3344  prepilin-type cleavage/methylation  33.08 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.62769  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2126  methylation  37.98 
 
 		 146 aa  62  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.196428  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1890  hypothetical protein  41.18 
 
 		 136 aa  61.6  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4679  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  39.76 
 
 		 168 aa  60.8  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4040  fimbrial protein pilin  38.38 
 
 		 178 aa  60.5  0.000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2680  fimbrial protein pilin  58 
 
 		 169 aa  60.5  0.000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0726827  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2449  Fimbrial protein pilin  32.21 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000426279  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1510  fimbrial protein  27.78 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.0000000690325  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04886  pilin  36.23 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.969324  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3896  Fimbrial protein pilin  54.9 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0477  prepilin-type cleavage/methylation  44.83 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.695821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0864  pilin  39.13 
 
 		 163 aa  58.2  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484071 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0485  fimbrial protein pilin  30.22 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03468  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  48.08 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4674  methylation  46 
 
 		 169 aa  57.8  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0065  pilin  38.14 
 
 		 170 aa  57.4  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.154072 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4782  Tfp pilus assembly protein  37.93 
 
 		 179 aa  57.4  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2629  type IV pilus subunit PilA  48.08 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0548  hypothetical protein  40.62 
 
 		 169 aa  55.8  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1999  fimbrial protein  45.1 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12104  fimbrial protein  35.85 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.246946  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0879  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain protein  45.9 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0475  fimbrial protein pilin  41.1 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.665132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2567  general secretion pathway protein H  36.84 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0926  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  32.88 
 
 		 171 aa  55.1  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000619994  hitchhiker  8.71814e-18 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2693  general secretion pathway protein H  36.84 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.289926  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0248  type IV-A pilin protein PilA  37.29 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0613  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  42.11 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0934015 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0461  fimbrial protein precursor PilE (MS11 antigen)  39.66 
 
 		 167 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1950  type 4 major prepilin protein  37.29 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5185  protein involved in methylation  48 
 
 		 174 aa  54.7  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101493  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5973  general secretion pathway protein H  33.64 
 
 		 198 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0600966 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0480  pilin subfamily protein  39.29 
 
 		 174 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3387  fgenesh4_pg.C_scaffold_2883000002  43.64 
 
 		 196 aa  53.9  0.0000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.437334  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2675  general secretion pathway protein H  36.84 
 
 		 198 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2035  hypothetical protein  36.84 
 
 		 198 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2646  hypothetical protein  36.84 
 
 		 198 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0677  putative type IV fimbrial pilin protein  34.74 
 
 		 207 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2019  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45.28 
 
 		 130 aa  52.8  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3356  fimbrial protein pilin: general secretion pathway protein H  52.08 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.669833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0656  general secretion pathway protein H  37.11 
 
 		 199 aa  53.5  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3946  fimbrial protein pilin  61.11 
 
 		 169 aa  53.1  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129399 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1078  pilin  30.16 
 
 		 162 aa  53.1  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.18456 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0472  fimbrial protein pilin  30.2 
 
 		 182 aa  53.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.877435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0446  putative type IV fimbrial pilin protein  35.79 
 
 		 205 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.590776 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5161  type IV pilin structural subunit  34.06 
 
 		 179 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0567  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  26.57 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0557  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  34.65 
 
 		 173 aa  52.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2904  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  29.91 
 
 		 168 aa  52  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.3004 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0253  general secretion pathway protein G  43.1 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20881  pilin  36.52 
 
 		 159 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0478  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  55 
 
 		 169 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.322644  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0558  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  55 
 
 		 168 aa  52  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1441  type II secretion system protein G  28.91 
 
 		 129 aa  51.6  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000189967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  40.68 
 
 		 142 aa  51.6  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  31.69 
 
 		 152 aa  51.6  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03231  type IV pilin  30.88 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0578635  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0617  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  28.77 
 
 		 158 aa  51.2  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.217435 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  40.68 
 
 		 142 aa  51.2  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0533  general secretion pathway protein H  34.96 
 
 		 161 aa  51.2  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179216  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3945  fimbrial protein pilin  61.76 
 
 		 166 aa  51.2  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.373423  hitchhiker  0.00130999 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0638  fimbrillin  55 
 
 		 177 aa  51.2  0.000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.37134  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0100  general secretion pathway protein G  34.52 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>