105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4781 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4781  Tfp pilus assembly protein  100 
 
 		 159 aa  317  6e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.431872  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4782  Tfp pilus assembly protein  76.58 
 
 		 179 aa  253  8e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4674  methylation  59.09 
 
 		 169 aa  180  8.000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4679  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  47.1 
 
 		 168 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1265  methylation  45 
 
 		 160 aa  105  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00964428  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4040  fimbrial protein pilin  42.42 
 
 		 178 aa  92.8  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736529  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12104  fimbrial protein  39.62 
 
 		 165 aa  90.1  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.246946  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5185  protein involved in methylation  40.96 
 
 		 174 aa  86.7  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101493  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1510  fimbrial protein  38.12 
 
 		 138 aa  78.2  0.00000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.0000000690325  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5973  general secretion pathway protein H  31.25 
 
 		 198 aa  71.2  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0600966 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58730  type IV pilin structural subunit  33.14 
 
 		 179 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.279942  normal  0.457351 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2680  fimbrial protein pilin  34.59 
 
 		 169 aa  70.1  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0726827  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2540  general secretion pathway protein H  34.97 
 
 		 147 aa  69.3  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.13206  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2035  hypothetical protein  31.25 
 
 		 198 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2646  hypothetical protein  31.25 
 
 		 198 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2675  general secretion pathway protein H  31.25 
 
 		 198 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3387  fgenesh4_pg.C_scaffold_2883000002  55.74 
 
 		 196 aa  66.6  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.437334  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0477  putative type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  29.09 
 
 		 173 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0748911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2693  general secretion pathway protein H  30.11 
 
 		 198 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.289926  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2567  general secretion pathway protein H  30.11 
 
 		 198 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0480  pilin subfamily protein  45.95 
 
 		 174 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0485  fimbrial protein pilin  66.67 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0473  fimbrial protein pilin  31.45 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0065  pilin  32.32 
 
 		 170 aa  63.2  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.154072 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0656  general secretion pathway protein H  28.98 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2449  Fimbrial protein pilin  39.64 
 
 		 162 aa  60.1  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000426279  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0558  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  31.33 
 
 		 168 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0797  pilin  37.66 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0478  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  31.33 
 
 		 169 aa  58.2  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.322644  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0557  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  27.71 
 
 		 173 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3385  fgenesh4_pg.C_scaffold_2883000002  55.56 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0864  pilin  77.42 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484071 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0799  fimbrial protein pilin  42.5 
 
 		 139 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0744296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4819  general secretion pathway protein H  32.46 
 
 		 138 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80083  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0472  fimbrial protein pilin  37.5 
 
 		 182 aa  53.9  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.877435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1828  fimbrial protein pilin  51.06 
 
 		 170 aa  53.1  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.10224  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0446  putative type IV fimbrial pilin protein  29.58 
 
 		 205 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.590776 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1889  hypothetical protein  53.49 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3945  fimbrial protein pilin  58.97 
 
 		 166 aa  51.6  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.373423  hitchhiker  0.00130999 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3946  fimbrial protein pilin  58.97 
 
 		 169 aa  51.6  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129399 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5161  type IV pilin structural subunit  51.16 
 
 		 179 aa  51.2  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4444  type IV pilin  48.94 
 
 		 160 aa  50.8  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0477  prepilin-type cleavage/methylation  39.78 
 
 		 148 aa  50.4  0.000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.695821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0677  putative type IV fimbrial pilin protein  41.82 
 
 		 207 aa  50.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2904  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  36.11 
 
 		 168 aa  49.7  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.3004 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3289  putative type IV fimbrial pilin protein  30.91 
 
 		 207 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.213615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3896  Fimbrial protein pilin  52.27 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3944  fimbrial protein pilin  70.97 
 
 		 166 aa  48.5  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.736158  hitchhiker  0.00123211 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0463  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  28.82 
 
 		 167 aa  48.9  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0476  methylation site containing protein  48 
 
 		 141 aa  48.5  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.991113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1866  hypothetical protein  51.16 
 
 		 446 aa  48.5  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.287595  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3386  hypothetical protein  51.16 
 
 		 438 aa  48.5  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00409988 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2663  type IV pilus biogenesis protein PilE  43.64 
 
 		 142 aa  48.5  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1078  pilin  30.67 
 
 		 162 aa  48.1  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.18456 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0478  prepilin peptidase dependent protein D  46 
 
 		 134 aa  48.1  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.183909  normal  0.878303 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3356  fimbrial protein pilin: general secretion pathway protein H  48.89 
 
 		 137 aa  47.8  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.669833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1999  fimbrial protein  44 
 
 		 153 aa  47.8  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0250  fimbrial subunit  38.33 
 
 		 152 aa  47.4  0.00008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0333044  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0927  type IV pilus biogenesis protein  48.78 
 
 		 142 aa  47  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0278  type IV pilin, putative  27.16 
 
 		 172 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0230  Fimbrial protein pilin  53.49 
 
 		 161 aa  47  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0979  PilA  27.16 
 
 		 207 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3344  prepilin-type cleavage/methylation  48.94 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.62769  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2678  putative type IV pilin  27.16 
 
 		 189 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2398  putative type IV pilin  27.16 
 
 		 207 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.558979  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0816  putative type IV pilin protein PilA  27.16 
 
 		 172 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0820  putative type IV pilin protein PilA  27.16 
 
 		 172 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0011  putative type IV pilin  27.16 
 
 		 189 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04886  pilin  30.28 
 
 		 141 aa  47  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.969324  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1878  hypothetical protein  42.22 
 
 		 137 aa  46.2  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  48.94 
 
 		 141 aa  46.2  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0634  fimbrial protein pilin  48.78 
 
 		 136 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0864  peptidase S49, protease IV  35.71 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0475  fimbrial protein pilin  58.06 
 
 		 139 aa  45.8  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.665132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0675  fimbrial protein pilin  48.78 
 
 		 136 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357739 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002546  type IV pilin PilA  65.52 
 
 		 157 aa  45.4  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.790868  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0680  fimbrial protein pilin  48.78 
 
 		 136 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0461  fimbrial protein precursor PilE (MS11 antigen)  40.43 
 
 		 167 aa  44.7  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0777  fimbrial protein pilin  31.82 
 
 		 131 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0649  pilin family protein  56.67 
 
 		 207 aa  44.3  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0467  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  66.67 
 
 		 171 aa  44.3  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.568157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0872  general secretion pathway protein H  58.62 
 
 		 152 aa  44.3  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.854476  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3782  methylation site containing protein  30.63 
 
 		 148 aa  43.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03468  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  42.55 
 
 		 141 aa  43.9  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4536  fimbrial protein pilin  46.34 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0314  general secretion pathway protein  43.33 
 
 		 147 aa  43.9  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2064  hypothetical protein  24.34 
 
 		 364 aa  42.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00393707  normal  0.614114 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0126  Tfp pilus assembly protein PilE-like  52.94 
 
 		 151 aa  43.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0148502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2914  type IV pilin PilE  65.38 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0462503 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2126  methylation  65.38 
 
 		 146 aa  42  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.196428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3388  methylation  73.08 
 
 		 138 aa  42.4  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0800  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  30 
 
 		 167 aa  42.4  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.346386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5196  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  50 
 
 		 141 aa  41.6  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0414  methylation site containing protein  69.23 
 
 		 148 aa  41.2  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0613  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  50 
 
 		 165 aa  41.6  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0934015 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1058  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  37.78 
 
 		 176 aa  41.6  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.110537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1421  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  52.78 
 
 		 172 aa  41.2  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2629  type IV pilus subunit PilA  34 
 
 		 138 aa  41.2  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1879  hypothetical protein  33.55 
 
 		 137 aa  40.8  0.008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1387  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  25.6 
 
 		 175 aa  40.8  0.008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>