More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0864 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0864  peptidase S49, protease IV  100 
 
 		 139 aa  276  5e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2540  general secretion pathway protein H  47.55 
 
 		 147 aa  115  9.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.13206  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3782  methylation site containing protein  54.67 
 
 		 148 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1890  hypothetical protein  56.62 
 
 		 136 aa  113  8.999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2680  fimbrial protein pilin  42.07 
 
 		 169 aa  113  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0726827  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1889  hypothetical protein  49.26 
 
 		 137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0797  pilin  53.47 
 
 		 148 aa  110  7.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1878  hypothetical protein  47.06 
 
 		 137 aa  106  8.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1879  hypothetical protein  53.28 
 
 		 137 aa  106  9.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0485  fimbrial protein pilin  46.81 
 
 		 136 aa  102  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58730  type IV pilin structural subunit  40.78 
 
 		 179 aa  101  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.279942  normal  0.457351 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1265  methylation  43.84 
 
 		 160 aa  97.4  5e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00964428  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1078  pilin  37.5 
 
 		 162 aa  97.8  5e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.18456 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1510  fimbrial protein  43.66 
 
 		 138 aa  95.9  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.0000000690325  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0558  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  43.29 
 
 		 168 aa  96.3  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0864  pilin  45.18 
 
 		 163 aa  94  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484071 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0065  pilin  38.1 
 
 		 170 aa  90.9  5e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.154072 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4674  methylation  40.85 
 
 		 169 aa  88.6  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0480  pilin subfamily protein  36.36 
 
 		 174 aa  87  7e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12104  fimbrial protein  38.79 
 
 		 165 aa  87  8e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.246946  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0478  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  41.57 
 
 		 169 aa  86.3  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.322644  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0557  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  38.1 
 
 		 173 aa  85.9  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4782  Tfp pilus assembly protein  37.58 
 
 		 179 aa  85.1  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5185  protein involved in methylation  37.13 
 
 		 174 aa  84  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101493  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5161  type IV pilin structural subunit  39.13 
 
 		 179 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0477  putative type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  33.73 
 
 		 173 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0748911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0478  prepilin peptidase dependent protein D  42.19 
 
 		 134 aa  83.2  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.183909  normal  0.878303 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4679  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  52.04 
 
 		 168 aa  83.2  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0472  fimbrial protein pilin  37.33 
 
 		 182 aa  82  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.877435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3896  Fimbrial protein pilin  67.24 
 
 		 133 aa  82.8  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2449  Fimbrial protein pilin  37.66 
 
 		 162 aa  82.4  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000426279  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3387  fgenesh4_pg.C_scaffold_2883000002  73.68 
 
 		 196 aa  82  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.437334  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0463  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  42.11 
 
 		 167 aa  82  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04886  pilin  51.75 
 
 		 141 aa  81.6  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.969324  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2064  hypothetical protein  37.9 
 
 		 364 aa  81.6  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00393707  normal  0.614114 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3344  prepilin-type cleavage/methylation  44.36 
 
 		 148 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.62769  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0230  Fimbrial protein pilin  41.78 
 
 		 161 aa  80.9  0.000000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0799  fimbrial protein pilin  43.7 
 
 		 139 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0744296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1828  fimbrial protein pilin  32.47 
 
 		 170 aa  80.1  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.10224  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0461  fimbrial protein precursor PilE (MS11 antigen)  42.06 
 
 		 167 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4040  fimbrial protein pilin  68.42 
 
 		 178 aa  78.2  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736529  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0627  putative major pilin subunit  37.78 
 
 		 147 aa  78.2  0.00000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0446  putative type IV fimbrial pilin protein  37.14 
 
 		 205 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.590776 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0476  methylation site containing protein  69.09 
 
 		 141 aa  76.3  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.991113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3356  fimbrial protein pilin: general secretion pathway protein H  39.86 
 
 		 137 aa  75.1  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.669833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3946  fimbrial protein pilin  39.76 
 
 		 169 aa  74.7  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129399 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03468  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  35.34 
 
 		 141 aa  74.7  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3289  putative type IV fimbrial pilin protein  40 
 
 		 207 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.213615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2200  pilus assembly protein PilA  55.71 
 
 		 111 aa  74.3  0.0000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.360457  hitchhiker  0.000654211 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0677  putative type IV fimbrial pilin protein  40.35 
 
 		 207 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0656  general secretion pathway protein H  31.03 
 
 		 199 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2567  general secretion pathway protein H  41.28 
 
 		 198 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2693  general secretion pathway protein H  41.28 
 
 		 198 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.289926  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0475  fimbrial protein pilin  35.51 
 
 		 139 aa  73.6  0.0000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.665132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2126  methylation  41.1 
 
 		 146 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.196428  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0467  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  36.05 
 
 		 171 aa  72  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.568157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3945  fimbrial protein pilin  37.42 
 
 		 166 aa  71.6  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.373423  hitchhiker  0.00130999 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4444  type IV pilin  68.52 
 
 		 160 aa  70.9  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5973  general secretion pathway protein H  41.28 
 
 		 198 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0600966 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3944  fimbrial protein pilin  47.96 
 
 		 166 aa  70.9  0.000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.736158  hitchhiker  0.00123211 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0477  prepilin-type cleavage/methylation  61.82 
 
 		 148 aa  70.5  0.000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.695821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2675  general secretion pathway protein H  40.37 
 
 		 198 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3575  putative major pilin subunit  34.93 
 
 		 148 aa  69.7  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.270372  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2035  hypothetical protein  40.37 
 
 		 198 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2646  hypothetical protein  40.37 
 
 		 198 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4819  general secretion pathway protein H  72.55 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80083  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2663  type IV pilus biogenesis protein PilE  47.95 
 
 		 142 aa  68.6  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1999  fimbrial protein  34.9 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0156  putative major pilin subunit  31.69 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0157  putative major pilin subunit  31.69 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  43.37 
 
 		 141 aa  67.8  0.00000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0158  putative major pilin subunit  31.69 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.320147 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0161  putative major pilin subunit  31.69 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0473  fimbrial protein pilin  35.25 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002546  type IV pilin PilA  33.33 
 
 		 157 aa  67  0.00000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.790868  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2475  N-terminal methylation site  31.52 
 
 		 172 aa  67  0.00000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2904  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  41.38 
 
 		 168 aa  66.6  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.3004 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0164  putative major pilin subunit  30.99 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.268979  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0668  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  34.78 
 
 		 155 aa  65.9  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000136734 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3388  methylation  42.97 
 
 		 138 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0269  fimbrial protein pilin  44.59 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.372108  normal  0.389594 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1067  methylation site containing protein  47.89 
 
 		 130 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0652  putative major pilin subunit  30.15 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1442  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  37.61 
 
 		 155 aa  65.1  0.0000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.102563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3385  fgenesh4_pg.C_scaffold_2883000002  46.27 
 
 		 199 aa  65.1  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4781  Tfp pilus assembly protein  35.06 
 
 		 159 aa  64.7  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.431872  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0634  fimbrial protein pilin  35.62 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3031  methylation site containing protein  47.83 
 
 		 133 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0649  pilin family protein  34 
 
 		 207 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0765  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.37 
 
 		 170 aa  63.5  0.0000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000473938  hitchhiker  1.49827e-16 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00107  predicted major pilin subunit  30.28 
 
 		 146 aa  63.5  0.0000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.686894  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3494  putative major pilin subunit  30.28 
 
 		 146 aa  63.5  0.0000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0110  putative major pilin subunit  30.28 
 
 		 146 aa  63.5  0.0000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000976692  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0680  fimbrial protein pilin  37.86 
 
 		 136 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3551  putative major pilin subunit  30.28 
 
 		 146 aa  63.5  0.0000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000125636 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00106  hypothetical protein  30.28 
 
 		 146 aa  63.5  0.0000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0666  putative major pilin subunit  31.97 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1866  hypothetical protein  50.85 
 
 		 446 aa  62.8  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.287595  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3386  hypothetical protein  50.85 
 
 		 438 aa  62.8  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00409988 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5198  fimbrial protein pilin  42.16 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>