More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp1890 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp1890  hypothetical protein  100 
 
 
136 aa  266  7e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1879  hypothetical protein  90.51 
 
 
137 aa  214  2.9999999999999998e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1889  hypothetical protein  72.99 
 
 
137 aa  194  3e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1878  hypothetical protein  69.34 
 
 
137 aa  184  2e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0558  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  49.69 
 
 
168 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2540  general secretion pathway protein H  54.93 
 
 
147 aa  122  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.13206  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2680  fimbrial protein pilin  48.12 
 
 
169 aa  120  8e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0726827  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0864  peptidase S49, protease IV  56.62 
 
 
139 aa  119  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0065  pilin  46.71 
 
 
170 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.154072 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0656  general secretion pathway protein H  44 
 
 
199 aa  110  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2675  general secretion pathway protein H  43.18 
 
 
198 aa  110  9e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2035  hypothetical protein  43.18 
 
 
198 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2646  hypothetical protein  43.18 
 
 
198 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5973  general secretion pathway protein H  41.71 
 
 
198 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0600966 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0864  pilin  47.85 
 
 
163 aa  108  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.484071 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0677  putative type IV fimbrial pilin protein  47.14 
 
 
207 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2567  general secretion pathway protein H  41.14 
 
 
198 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2693  general secretion pathway protein H  41.14 
 
 
198 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.289926  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3289  putative type IV fimbrial pilin protein  45.71 
 
 
207 aa  106  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.213615  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0477  putative type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  45.78 
 
 
173 aa  105  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0748911  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0446  putative type IV fimbrial pilin protein  44.74 
 
 
205 aa  104  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.590776 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0485  fimbrial protein pilin  44.85 
 
 
136 aa  102  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04886  pilin  51.47 
 
 
141 aa  101  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.969324  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1828  fimbrial protein pilin  38.71 
 
 
170 aa  101  4e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.10224  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0478  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  47.53 
 
 
169 aa  101  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.322644  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58730  type IV pilin structural subunit  41.81 
 
 
179 aa  100  8e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.279942  normal  0.457351 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0649  pilin family protein  47.71 
 
 
207 aa  98.2  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0557  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  44.85 
 
 
173 aa  97.8  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5161  type IV pilin structural subunit  40.62 
 
 
179 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1265  methylation  42.36 
 
 
160 aa  95.1  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00964428  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0799  fimbrial protein pilin  45.39 
 
 
139 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0744296  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0278  type IV pilin, putative  46.81 
 
 
172 aa  93.6  7e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0816  putative type IV pilin protein PilA  46.81 
 
 
172 aa  93.6  7e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0820  putative type IV pilin protein PilA  46.81 
 
 
172 aa  93.6  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3782  methylation site containing protein  48.55 
 
 
148 aa  93.6  9e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2064  hypothetical protein  41.13 
 
 
364 aa  91.3  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00393707  normal  0.614114 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0480  pilin subfamily protein  43.57 
 
 
174 aa  90.1  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1510  fimbrial protein  45.65 
 
 
138 aa  90.1  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.0000000690325  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0797  pilin  48.57 
 
 
148 aa  89  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0979  PilA  46.72 
 
 
207 aa  87.8  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2398  putative type IV pilin  46.72 
 
 
207 aa  87.8  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.558979  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2678  putative type IV pilin  48.18 
 
 
189 aa  87.4  5e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0011  putative type IV pilin  48.18 
 
 
189 aa  87.4  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5185  protein involved in methylation  38.41 
 
 
174 aa  86.7  9e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101493  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0230  Fimbrial protein pilin  36.49 
 
 
161 aa  85.9  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0463  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  39.51 
 
 
167 aa  85.9  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12104  fimbrial protein  38.89 
 
 
165 aa  84  7e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.246946  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1078  pilin  40.94 
 
 
162 aa  83.6  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.18456 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0627  putative major pilin subunit  41.18 
 
 
147 aa  82  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3387  fgenesh4_pg.C_scaffold_2883000002  60.76 
 
 
196 aa  81.6  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.437334  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4674  methylation  39.29 
 
 
169 aa  82  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2449  Fimbrial protein pilin  60.61 
 
 
162 aa  81.3  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000426279  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3356  fimbrial protein pilin: general secretion pathway protein H  40 
 
 
137 aa  80.1  0.000000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.669833  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0472  fimbrial protein pilin  39.33 
 
 
182 aa  79.7  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.877435  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4782  Tfp pilus assembly protein  36.81 
 
 
179 aa  79.3  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0110  putative major pilin subunit  40 
 
 
146 aa  77  0.00000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000976692  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0014  type IV pilin structural subunit  44.63 
 
 
178 aa  77  0.00000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00107  predicted major pilin subunit  40 
 
 
146 aa  77  0.00000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.686894  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3494  putative major pilin subunit  40 
 
 
146 aa  77  0.00000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3551  putative major pilin subunit  40 
 
 
146 aa  77  0.00000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000125636 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00106  hypothetical protein  40 
 
 
146 aa  77  0.00000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4040  fimbrial protein pilin  35.88 
 
 
178 aa  76.6  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736529  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0111  putative major pilin subunit  40 
 
 
146 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.273778  normal  0.482641 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3946  fimbrial protein pilin  75.51 
 
 
169 aa  75.9  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00129399 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0114  putative major pilin subunit  39.5 
 
 
146 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00878541  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0467  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  39.88 
 
 
171 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.568157  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3896  Fimbrial protein pilin  42.76 
 
 
133 aa  74.7  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0158  putative major pilin subunit  40 
 
 
145 aa  74.7  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.320147 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1999  fimbrial protein  38.46 
 
 
153 aa  74.7  0.0000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3370  putative major pilin subunit  40.16 
 
 
154 aa  74.3  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.981789  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3498  putative major pilin subunit  40.16 
 
 
154 aa  74.3  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0156  putative major pilin subunit  40 
 
 
145 aa  74.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0157  putative major pilin subunit  40 
 
 
145 aa  74.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1041  putative major pilin subunit  40.16 
 
 
154 aa  74.3  0.0000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.131052 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0161  putative major pilin subunit  40 
 
 
145 aa  73.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4679  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  35.29 
 
 
168 aa  73.6  0.0000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0652  putative major pilin subunit  39.17 
 
 
145 aa  73.6  0.0000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3945  fimbrial protein pilin  74.47 
 
 
166 aa  73.6  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.373423  hitchhiker  0.00130999 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0666  putative major pilin subunit  38.84 
 
 
147 aa  72.8  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0164  putative major pilin subunit  39.5 
 
 
145 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.268979  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0461  fimbrial protein precursor PilE (MS11 antigen)  37.41 
 
 
167 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653734  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0250  fimbrial subunit  43.8 
 
 
152 aa  72  0.000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0333044  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2629  type IV pilus subunit PilA  40.94 
 
 
138 aa  71.2  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3575  putative major pilin subunit  38.98 
 
 
148 aa  71.6  0.000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.270372  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3385  fgenesh4_pg.C_scaffold_2883000002  31.55 
 
 
199 aa  71.2  0.000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3944  fimbrial protein pilin  70.21 
 
 
166 aa  71.2  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.736158  hitchhiker  0.00123211 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3344  prepilin-type cleavage/methylation  43.38 
 
 
148 aa  70.1  0.000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.62769  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0478  prepilin peptidase dependent protein D  45.53 
 
 
134 aa  68.6  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.183909  normal  0.878303 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0269  fimbrial protein pilin  48.28 
 
 
151 aa  67.4  0.00000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.372108  normal  0.389594 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2126  methylation  42.36 
 
 
146 aa  67  0.00000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.196428  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4444  type IV pilin  66.67 
 
 
160 aa  66.2  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0927  type IV pilus biogenesis protein  68 
 
 
142 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2200  pilus assembly protein PilA  56.34 
 
 
111 aa  66.6  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.360457  hitchhiker  0.000654211 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2663  type IV pilus biogenesis protein PilE  43.84 
 
 
142 aa  66.2  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0533  general secretion pathway protein H  47.33 
 
 
161 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179216  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3386  hypothetical protein  33.78 
 
 
438 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00409988 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1866  hypothetical protein  33.78 
 
 
446 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.287595  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0473  fimbrial protein pilin  33.81 
 
 
139 aa  64.7  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72626  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03468  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  34.11 
 
 
141 aa  63.9  0.0000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5196  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  61.7 
 
 
141 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>