More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3175 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3175  Fimbrial protein pilin  100 
 
 		 134 aa  277  3e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3896  Fimbrial protein pilin  46.21 
 
 		 133 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3176  Fimbrial protein pilin  49.28 
 
 		 137 aa  107  5e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2031  fimbrial protein pilin  44.52 
 
 		 148 aa  90.9  5e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.187958  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2112  fimbrial protein  44.52 
 
 		 146 aa  90.1  1e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2109  fimbrial protein  43.84 
 
 		 149 aa  89  2e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2033  fimbrial protein pilin  44.52 
 
 		 146 aa  89  2e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.244331  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0680  fimbrial protein pilin  39.13 
 
 		 136 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0634  fimbrial protein pilin  39.86 
 
 		 136 aa  87  7e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0675  fimbrial protein pilin  39.86 
 
 		 136 aa  87  7e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357739 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0475  fimbrial protein pilin  34.56 
 
 		 139 aa  84  7e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.665132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0638  fimbrillin  34.31 
 
 		 177 aa  83.6  8e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.37134  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4536  fimbrial protein pilin  38.41 
 
 		 136 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4819  general secretion pathway protein H  38.71 
 
 		 138 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80083  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3356  fimbrial protein pilin: general secretion pathway protein H  35.07 
 
 		 137 aa  79  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.669833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2629  type IV pilus subunit PilA  34.68 
 
 		 138 aa  78.6  0.00000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3422  fimbrial protein pilin  39.26 
 
 		 148 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0896  fimbrillin  29.78 
 
 		 180 aa  75.1  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0271  putative pilin protein PilA  27.01 
 
 		 154 aa  73.6  0.0000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.148513  normal  0.384028 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1143  fimbrillin  30 
 
 		 180 aa  72.8  0.000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2449  Fimbrial protein pilin  32.89 
 
 		 162 aa  72.8  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000426279  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1999  fimbrial protein  32.17 
 
 		 153 aa  68.6  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03468  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  35.48 
 
 		 141 aa  67.4  0.00000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2173  methylation  35.97 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0480  pilin subfamily protein  39.09 
 
 		 174 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0472  fimbrial protein pilin  57.45 
 
 		 182 aa  62.4  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.877435  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0557  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  65.12 
 
 		 173 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2126  methylation  36.72 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.196428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1265  methylation  31.88 
 
 		 160 aa  60.5  0.000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00964428  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60320  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  47.89 
 
 		 141 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000362369 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0249  fimbrial protein pilin  34.48 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5161  type IV pilin structural subunit  39.73 
 
 		 179 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2680  fimbrial protein pilin  52 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0726827  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58730  type IV pilin structural subunit  47.17 
 
 		 179 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.279942  normal  0.457351 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0478  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  39.24 
 
 		 169 aa  57.8  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.322644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3944  fimbrial protein pilin  42.65 
 
 		 166 aa  57  0.00000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.736158  hitchhiker  0.00123211 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0558  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  58.14 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0065  pilin  46.38 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.154072 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5973  general secretion pathway protein H  43.18 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0600966 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0463  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  44.12 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2680  type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  42.47 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0580057 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0656  general secretion pathway protein H  41.11 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1866  hypothetical protein  32 
 
 		 446 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.287595  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3386  hypothetical protein  32 
 
 		 438 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00409988 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00107  predicted major pilin subunit  34.07 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.686894  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3494  putative major pilin subunit  34.07 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3551  putative major pilin subunit  34.07 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000125636 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00106  hypothetical protein  34.07 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1067  methylation site containing protein  37.89 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0110  putative major pilin subunit  34.07 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000976692  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0230  Fimbrial protein pilin  41.03 
 
 		 161 aa  55.1  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0414  methylation site containing protein  32.73 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0864  pilin  58.54 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484071 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0114  putative major pilin subunit  34.07 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00878541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0111  putative major pilin subunit  34.07 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.273778  normal  0.482641 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1828  fimbrial protein pilin  27.81 
 
 		 170 aa  54.7  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.10224  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2200  pilus assembly protein PilA  57.14 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.360457  hitchhiker  0.000654211 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1078  pilin  59.52 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.18456 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0126  Tfp pilus assembly protein PilE-like  56.1 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0148502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2567  general secretion pathway protein H  42.05 
 
 		 198 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  48 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2693  general secretion pathway protein H  42.05 
 
 		 198 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.289926  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2675  general secretion pathway protein H  57.78 
 
 		 198 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1878  hypothetical protein  43.24 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2035  hypothetical protein  57.78 
 
 		 198 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2646  hypothetical protein  57.78 
 
 		 198 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0477  putative type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  59.52 
 
 		 173 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0748911  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4444  type IV pilin  35.23 
 
 		 160 aa  53.9  0.0000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4782  Tfp pilus assembly protein  44.64 
 
 		 179 aa  53.9  0.0000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3385  fgenesh4_pg.C_scaffold_2883000002  57.14 
 
 		 199 aa  53.9  0.0000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2916  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  41.1 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0164  putative major pilin subunit  34.81 
 
 		 145 aa  52.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.268979  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0158  putative major pilin subunit  34.81 
 
 		 145 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.320147 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0161  putative major pilin subunit  34.81 
 
 		 145 aa  52.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4679  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  30 
 
 		 168 aa  53.1  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0649  pilin family protein  61.9 
 
 		 207 aa  53.5  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3387  fgenesh4_pg.C_scaffold_2883000002  48.94 
 
 		 196 aa  53.5  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.437334  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0156  putative major pilin subunit  34.81 
 
 		 145 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3945  fimbrial protein pilin  52.08 
 
 		 166 aa  53.1  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.373423  hitchhiker  0.00130999 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0157  putative major pilin subunit  34.81 
 
 		 145 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0927  type IV pilus biogenesis protein  47.06 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1889  hypothetical protein  42.67 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3289  putative type IV fimbrial pilin protein  53.33 
 
 		 207 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.213615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0765  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  32 
 
 		 170 aa  52.4  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000473938  hitchhiker  1.49827e-16 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4674  methylation  46.3 
 
 		 169 aa  52.4  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0677  putative type IV fimbrial pilin protein  44.64 
 
 		 207 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0652  putative major pilin subunit  33.33 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0250  fimbrial subunit  42.62 
 
 		 152 aa  52.4  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0333044  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0723  type-4 fimbrial pilin-like transmembrane protein  31.3 
 
 		 161 aa  51.6  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0816  type IV pilus biogenesis protein  64.86 
 
 		 133 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0278  type IV pilin, putative  60.53 
 
 		 172 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0720  fimbrial protein pilin  64.86 
 
 		 133 aa  52  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0461  fimbrial protein precursor PilE (MS11 antigen)  51.02 
 
 		 167 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3946  fimbrial protein pilin  50 
 
 		 169 aa  52  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129399 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0820  putative type IV pilin protein PilA  60.53 
 
 		 172 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0816  putative type IV pilin protein PilA  60.53 
 
 		 172 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0485  fimbrial protein pilin  52.08 
 
 		 136 aa  52  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0797  pilin  32.62 
 
 		 148 aa  51.6  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1383  type IV pilin PilE  47.69 
 
 		 135 aa  51.6  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.140998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5196  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  52.17 
 
 		 141 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>