More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1036 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1036  hypothetical protein  100 
 
 		 131 aa  264  4e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  34.17 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2629  type IV pilus subunit PilA  39.19 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20891  pilin  42.42 
 
 		 170 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0708  methylation site containing protein  45.61 
 
 		 170 aa  59.7  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0386199  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0760  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  47.37 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.014468  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4570  MSHA pilin protein MshB  47.46 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.527275  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3268  hypothetical protein  50 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.359601  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  31.67 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0391  hypothetical protein  67.5 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  7.588550000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0449  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  35.96 
 
 		 167 aa  57.8  0.00000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000146857  hitchhiker  0.0000000193676 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3217  hypothetical protein  44.44 
 
 		 108 aa  58.2  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000170582 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.33 
 
 		 157 aa  57.4  0.00000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3781  hypothetical protein  39.66 
 
 		 172 aa  57.8  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1442  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  36 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.102563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0856  methylation site containing protein  48.15 
 
 		 182 aa  57.4  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0802  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.88 
 
 		 152 aa  57  0.00000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.964553  normal  0.826959 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0682  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.54 
 
 		 165 aa  57  0.00000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0723462  hitchhiker  0.000000000174273 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4569  MSHA pilin protein MshA  48.21 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442923  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3248  hypothetical protein  50 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0253  general secretion pathway protein G  41.94 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1487  fimbrial protein EcpC precursor  35.48 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0651614  normal  0.606044 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17770  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain-containing protein  39.29 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.775526 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0093  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.85 
 
 		 169 aa  56.6  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0563183 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1176  hypothetical protein  32.93 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3464  hypothetical protein  43.64 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0392  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.13 
 
 		 175 aa  56.2  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000336485  hitchhiker  0.0000000727713 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1857  N-terminal methylation  43.48 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0872  hypothetical protein  41.38 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0907  hypothetical protein  41.38 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1460  type II secretion system protein G  51.67 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52288  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2913  hypothetical protein  43.4 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0898  hypothetical protein  43.64 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2827  MSHA pilin protein MshA  39.47 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.99325  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3689  pilin, putative  39.39 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3315  pilin, putative  33.72 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.540059  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1410  hypothetical protein  39.19 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000260045  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1042  hypothetical protein  44.64 
 
 		 120 aa  54.7  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3363  methylation  58.97 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.57133  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0612  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  34.62 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4679  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  46.77 
 
 		 168 aa  54.3  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3761  MSHA pilin protein MshA  37.93 
 
 		 178 aa  54.3  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000202365  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2997  type II secretion system protein G  44.12 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000413298 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3476  type II secretion system protein G  38.03 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0390478  normal  0.854758 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2295  type II secretion system protein G  38.03 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.478951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0551  MSHA pilin protein MshA  38.6 
 
 		 173 aa  53.9  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000258454  normal  0.542221 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0926  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  40.35 
 
 		 171 aa  53.9  0.0000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000619994  hitchhiker  8.71814e-18 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0461  fimbrial protein precursor PilE (MS11 antigen)  40 
 
 		 167 aa  53.5  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1097  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.33 
 
 		 151 aa  53.5  0.0000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.282151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3821  hypothetical protein  38.6 
 
 		 173 aa  53.5  0.0000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2413  type II secretion system protein G  46.15 
 
 		 149 aa  53.5  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330838  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0548  hypothetical protein  41.38 
 
 		 169 aa  53.1  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2301  putative GSPG-related protein  40.85 
 
 		 130 aa  53.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.152629  normal  0.0321295 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002375  MSHA pilin protein MshA  38.6 
 
 		 168 aa  53.1  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0138724  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0613  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  41.94 
 
 		 165 aa  53.5  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0934015 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.88 
 
 		 169 aa  53.5  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4411  methylation site containing protein  31.3 
 
 		 219 aa  52.8  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000316241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0176  prepilin-type cleavage/methylation  49.06 
 
 		 212 aa  53.1  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0999  methylation site containing protein  42 
 
 		 164 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0926979  normal  0.0597088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1064  methylation site containing protein  42 
 
 		 164 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.691522  normal  0.0588159 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2391  general secretion pathway protein G  42.59 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000271033 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0463  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  36.9 
 
 		 167 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1003  methylation site containing protein  42 
 
 		 164 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.102399 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4106  MSHA pilin protein MshB  43.4 
 
 		 205 aa  52  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0927  type IV pilus biogenesis protein  42.11 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1316  type II secretory pathway protein LspG  35.48 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1313  type II secretory pathway protein LspG  35.48 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0799  fimbrial protein pilin  45.61 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0744296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0883  general secretion pathway protein H  45.1 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0109332  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3444  methylation site containing protein  34.18 
 
 		 167 aa  52  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280491 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29080  general secretion pathway protein G  39.44 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0842  hypothetical protein  35.09 
 
 		 193 aa  52.4  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3074  pilin, putative  34.15 
 
 		 178 aa  52.8  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1141  MSHA pilin protein MshB  47.17 
 
 		 126 aa  52.4  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0936  general secretion pathway protein  32.47 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.898049 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3384  general secretion pathway protein G  43.55 
 
 		 154 aa  52.4  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0567  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  33.33 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2470  type II secretion system protein G  38.03 
 
 		 124 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.335351  normal  0.427711 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0550  methylation site containing protein  42.11 
 
 		 218 aa  52.4  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000424061  normal  0.764365 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0552  MSHA pilin protein MshA  36.84 
 
 		 159 aa  52.4  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00386307  normal  0.526597 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3419  general secretion pathway protein G  34.44 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000422428 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3657  methylation site containing protein  43.4 
 
 		 205 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000205665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0364  MshA, mannose-sensitive haemaglutinin  45.83 
 
 		 163 aa  52.4  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0735599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03468  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  38.46 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2461  type II secretion system protein G  36.62 
 
 		 124 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.508549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0566  MSHA pilin protein MshB  41.54 
 
 		 205 aa  52.8  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.571105  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2452  methylation site containing protein  35.85 
 
 		 197 aa  51.6  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00816638  normal  0.444869 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3549  type 4 prepilin-like protein  41.67 
 
 		 177 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20881  pilin  40.35 
 
 		 159 aa  51.6  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0515  methylation site containing protein  42 
 
 		 168 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000372661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4155  fimbiral protein PilA  39.06 
 
 		 188 aa  52  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.614605  normal  0.158719 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0530  hypothetical protein  39.62 
 
 		 192 aa  52  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2372  general secretion pathway protein G  41.38 
 
 		 144 aa  51.6  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.411005  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1956  hypothetical protein  38.46 
 
 		 189 aa  51.6  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0620526  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3745  methylation site containing protein  39.66 
 
 		 201 aa  52  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0403042  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0396  methylation site containing protein  36.84 
 
 		 169 aa  52  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0195536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0460  MSHA pilin protein MshB  42.11 
 
 		 201 aa  52  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0475  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.39 
 
 		 171 aa  51.6  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0231  general secretion pathway protein G  42.59 
 
 		 149 aa  51.6  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0779  hypothetical protein  37.88 
 
 		 136 aa  51.6  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>