More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_20881 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_20881  pilin  100 
 
 		 159 aa  316  7e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3584  fimbrial protein PilA  36.84 
 
 		 176 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.194411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2522  pilin  36.84 
 
 		 176 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0049  pilin polypeptide PilA-like  47.76 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0965276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07011  hypothetical protein  45.07 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.212398  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0048  pilin polypeptide PilA-like  43.04 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.335089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0253  general secretion pathway protein G  28.81 
 
 		 150 aa  64.3  0.0000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0960  hypothetical protein  37.35 
 
 		 186 aa  64.3  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0933  hypothetical protein  37.35 
 
 		 186 aa  64.3  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1199  hypothetical protein  44.29 
 
 		 221 aa  64.3  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.789092  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2612  general secretion pathway protein G  27.2 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.688921 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0654  general secretion pathway protein G  27.64 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0121173  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5689  general secretion pathway protein G  26.06 
 
 		 158 aa  62.8  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128164  normal  0.128064 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0897  tfp pilus assembly protein, major pilin  35.04 
 
 		 118 aa  62  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.768254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20891  pilin  45.33 
 
 		 170 aa  62  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0345  general secretion pathway protein H  38.71 
 
 		 176 aa  60.8  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177644  normal  0.0749297 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0927  type IV pilus biogenesis protein  40.74 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  33.59 
 
 		 141 aa  60.5  0.000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0675  general secretion pathway protein G  26.83 
 
 		 159 aa  60.8  0.000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.186648  normal  0.343045 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00107  predicted major pilin subunit  36.52 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.686894  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3494  putative major pilin subunit  36.52 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03468  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  43.33 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3179  general secretion pathway protein G  25.58 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.223664  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3240  general secretion pathway protein G  26.98 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00106  hypothetical protein  36.52 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  35.77 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0114  putative major pilin subunit  36.52 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00878541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0110  putative major pilin subunit  36.52 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000976692  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0111  putative major pilin subunit  36.52 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.273778  normal  0.482641 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3551  putative major pilin subunit  36.52 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000125636 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0077  general secretion pathway protein G  26.19 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1316  type II secretory pathway protein LspG  40.62 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1313  type II secretory pathway protein LspG  40.62 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0059  general secretion pathway protein G  35.71 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0260  pilin polypeptide  37.33 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0058  general secretion pathway protein G  26.19 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0012  general secretion pathway protein G  26.19 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3387  fgenesh4_pg.C_scaffold_2883000002  50.88 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.437334  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0250  fimbrial subunit  35.83 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0333044  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4829  HxcT pseudopilin  24.81 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0048  general secretion pathway protein G  26.19 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.503149  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55490  HxcT pseudopilin  24.81 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.04599 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0058  general secretion pathway protein G  26.19 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109015  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3128  methylation site containing protein  32.8 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.932633 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0926  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  36.92 
 
 		 171 aa  58.2  0.00000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000619994  hitchhiker  8.71814e-18 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1442  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  39.68 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.102563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0534  general secretion pathway protein G  26.98 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4155  fimbiral protein PilA  52.17 
 
 		 188 aa  57.8  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.614605  normal  0.158719 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4782  Tfp pilus assembly protein  37.3 
 
 		 179 aa  57.8  0.00000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.23 
 
 		 168 aa  57.8  0.00000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  29.29 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0263  pilin polypeptide  43.55 
 
 		 178 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3384  general secretion pathway protein G  34.92 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0144  general secretion pathway protein G  24.82 
 
 		 166 aa  57  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0925  general secretion pathway protein G  26.32 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0172546  normal  0.856291 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1321  general secretion pathway protein G  25 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0449  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.46 
 
 		 167 aa  55.8  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000146857  hitchhiker  0.0000000193676 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4679  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  61.54 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0842  hypothetical protein  50 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1081  general secretion pathway protein G  24.37 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464773  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2904  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  34.65 
 
 		 168 aa  55.5  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.3004 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3044  general secretion pathway protein G  34.21 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.21279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3074  general secretion pathway protein G  37.29 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016497 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0376  hypothetical protein  35.05 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000272235  hitchhiker  0.0000000000782624 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3940  general secretion pathway protein G  33.75 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.18178 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3391  general secretion pathway protein G  33.78 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3419  general secretion pathway protein G  26.09 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000422428 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4497  general secretion pathway protein G  32.5 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.13255 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5269  general secretory pathway protein  37.8 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0802  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  35.71 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.964553  normal  0.826959 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0898  hypothetical protein  38.24 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.725433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0936  general secretion pathway protein  38.33 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.898049 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3106  putative general secretion pathway G transmembrane protein  37.1 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.590033  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3221  general secretion pathway protein G  34.92 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0864  pilin  57.5 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484071 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1351  general secretion pathway protein G  26.19 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.346821  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  35.94 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1073  general secretion pathway protein G  25.42 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.56277  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002546  type IV pilin PilA  63.16 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.790868  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2882  methylation  35.94 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.938712  normal  0.364905 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4674  methylation  55 
 
 		 169 aa  54.7  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1487  fimbrial protein EcpC precursor  37.7 
 
 		 164 aa  54.3  0.0000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0651614  normal  0.606044 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24020  general secretion pathway protein G  26.15 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2372  general secretion pathway protein G  24.03 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.411005  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3945  fimbrial protein pilin  56.1 
 
 		 166 aa  54.3  0.0000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.373423  hitchhiker  0.00130999 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0558  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  45 
 
 		 168 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2540  general secretion pathway protein H  57.5 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.13206  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2038  fimbrial protein pilin  36.76 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1096  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  31.33 
 
 		 157 aa  53.9  0.0000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.292656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2666  general secretion pathway protein G  35.48 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2032  general secretion pathway protein G  25.98 
 
 		 142 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0224  general secretion pathway protein G  35.48 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3514  general secretion pathway protein G  35.48 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.957184  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1898  general secretion pathway protein G  34.67 
 
 		 167 aa  53.5  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0011  general secretion pathway protein G  35.48 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00604  general secretion pathway protein G  40.62 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0012  general secretion pathway protein G  35.48 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0012  general secretion pathway protein G  35.48 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127302  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0478  prepilin peptidase dependent protein D  61.54 
 
 		 134 aa  53.5  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.183909  normal  0.878303 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3244  general secretion pathway protein GspG  27.2 
 
 		 151 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.948956  normal  0.749494 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>