More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5269 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_5269  general secretory pathway protein  100 
 
 		 192 aa  400  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3549  type 4 prepilin-like protein  41.53 
 
 		 177 aa  131  5e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2564  hypothetical protein  44.1 
 
 		 177 aa  130  9e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.569226 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1343  general secretion pathway protein G  45.45 
 
 		 160 aa  57.8  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.657967  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00346  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  30.25 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.887338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0263  pilin polypeptide  34.62 
 
 		 178 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1432  type II secretion systen protein G  36.92 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.412586  normal  0.909605 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.1 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2590  general secretion pathway protein G  38.81 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1442  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  32.89 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.102563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1278  general secretion pathway protein G  41.67 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0617  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  34.38 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.217435 
 
 
-
 
NC_003296  RS02970  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  41.67 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0455058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0682  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  24.59 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0723462  hitchhiker  0.000000000174273 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1199  hypothetical protein  33.73 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.789092  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3221  general secretion pathway protein G  41.79 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.287852 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3179  general secretion pathway protein G  30.61 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.223664  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0605  general secretion pathway protein G  38.81 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000021872 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20881  pilin  37.8 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0592  general secretion pathway protein G  41.67 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3736  hypothetical protein  36.25 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2612  general secretion pathway protein G  38.03 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.688921 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0802  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.5 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.964553  normal  0.826959 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4713  general secretion pathway protein G  44.07 
 
 		 166 aa  54.7  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3128  general secretion pathway protein G  33.85 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0729977 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3391  general secretion pathway protein G  32.43 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1096  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.51 
 
 		 157 aa  53.9  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.292656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0449  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.67 
 
 		 167 aa  53.9  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000146857  hitchhiker  0.0000000193676 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1898  general secretion pathway protein G  32.58 
 
 		 167 aa  53.9  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0265  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.71 
 
 		 166 aa  54.3  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.319115  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3044  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 		 159 aa  53.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.21279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0788  fimbrial protein pilin  38.81 
 
 		 163 aa  53.5  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.684386  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1488  hypothetical protein  40.74 
 
 		 158 aa  53.5  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.109192  normal  0.403243 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3940  general secretion pathway protein G  36.67 
 
 		 154 aa  52.8  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.18178 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2310  putative GSPG-related transmembrane protein  44.07 
 
 		 155 aa  53.1  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.164905  normal  0.125662 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0124  general secretion pathway protein G  40 
 
 		 144 aa  53.1  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1097  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.1 
 
 		 151 aa  52.8  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.282151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1548  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  33.33 
 
 		 167 aa  52.8  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  hitchhiker  0.00000000000000294624 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1073  general secretion pathway protein G  37.1 
 
 		 155 aa  52.4  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.56277  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0253  general secretion pathway protein G  34.85 
 
 		 150 aa  52.4  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0152  general secretion pathway protein G  40 
 
 		 144 aa  52.4  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0260  pilin polypeptide  30.56 
 
 		 187 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3106  putative general secretion pathway G transmembrane protein  37.29 
 
 		 156 aa  52  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.590033  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3419  general secretion pathway protein G  36.67 
 
 		 150 aa  52  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000422428 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0960  hypothetical protein  29.63 
 
 		 186 aa  52  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0156  general secretion pathway protein G  40 
 
 		 144 aa  52.4  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0156  general secretion pathway protein G  40 
 
 		 144 aa  52.4  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.051245 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1524  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  29.41 
 
 		 159 aa  52  0.000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000584644  unclonable  2.6975300000000003e-19 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0933  hypothetical protein  29.63 
 
 		 186 aa  52  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07011  hypothetical protein  33.33 
 
 		 208 aa  52  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.212398  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4203  general secretion pathway protein G  40 
 
 		 144 aa  52  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0567  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  32.81 
 
 		 147 aa  51.6  0.000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16150  General secretion pathway protein G  38.33 
 
 		 145 aa  51.2  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.853983  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0606  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.71 
 
 		 156 aa  51.6  0.000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000101189  hitchhiker  0.000000768083 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3384  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 		 154 aa  51.2  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1351  general secretion pathway protein G  29.29 
 
 		 150 aa  50.4  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.346821  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0169  general secretion pathway protein G  38.33 
 
 		 144 aa  50.8  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0059  general secretion pathway protein G  35 
 
 		 150 aa  50.4  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3149  general secretion pathway protein G  32.81 
 
 		 143 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.907974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2916  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  39.13 
 
 		 145 aa  51.2  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0676  type IV pilin  44.07 
 
 		 144 aa  50.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256255  normal  0.685259 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3564  general secretion pathway protein G  38.33 
 
 		 144 aa  50.8  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  37.29 
 
 		 152 aa  50.8  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0058  general secretion pathway protein G  35 
 
 		 150 aa  50.4  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4497  general secretion pathway protein G  35 
 
 		 154 aa  50.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.13255 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00604  general secretion pathway protein G  32.61 
 
 		 146 aa  50.8  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3074  general secretion pathway protein G  35 
 
 		 158 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016497 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0159  general secretion pathway protein G  38.33 
 
 		 144 aa  50.8  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0154  general secretion pathway protein G  38.33 
 
 		 144 aa  50.8  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1161  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  34.43 
 
 		 157 aa  50.4  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0048  general secretion pathway protein G  35 
 
 		 150 aa  50.4  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.503149  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24020  general secretion pathway protein G  40.68 
 
 		 148 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0719  type IV pilin  44.07 
 
 		 144 aa  50.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.464442  normal  0.176419 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0154  general secretion pathway protein G  38.33 
 
 		 144 aa  50.8  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1018  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.29 
 
 		 161 aa  50.8  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4731  general secretion pathway protein G  35.82 
 
 		 144 aa  50.4  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0599807  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0086  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  41.54 
 
 		 150 aa  50.1  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0956  general secretion pathway protein G  36.67 
 
 		 145 aa  49.7  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.194745  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1007  general secretion pathway protein G  36.67 
 
 		 145 aa  49.7  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3315  general secretion pathway protein G  32.81 
 
 		 143 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.82991  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1413  general secretion pathway protein G  36.67 
 
 		 144 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0288958  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0495  fimbrial protein EcpC precursor  34.38 
 
 		 172 aa  50.1  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.014346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0613  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  36.67 
 
 		 165 aa  50.4  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0934015 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2522  pilin  26.19 
 
 		 176 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3584  fimbrial protein PilA  26.19 
 
 		 176 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.194411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3240  general secretion pathway protein G  35 
 
 		 150 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4829  HxcT pseudopilin  33.33 
 
 		 149 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  35.48 
 
 		 168 aa  50.4  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0012  general secretion pathway protein G  35 
 
 		 150 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3266  general secretion pathway protein G  36.67 
 
 		 145 aa  49.7  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000062887  hitchhiker  0.00000000000000294917 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1081  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 		 146 aa  50.1  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464773  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2032  general secretion pathway protein G  40.68 
 
 		 142 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0058  general secretion pathway protein G  35 
 
 		 150 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109015  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2181  general secretion pathway protein G  32.81 
 
 		 140 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.934911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0077  general secretion pathway protein G  35 
 
 		 150 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2581  N-terminal methylation site  32.39 
 
 		 138 aa  49.7  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0011  general secretion pathway protein G  35.59 
 
 		 150 aa  49.7  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  31.58 
 
 		 142 aa  49.3  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3514  general secretion pathway protein G  35.59 
 
 		 150 aa  49.7  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.957184  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0100  general secretion pathway protein G  36.67 
 
 		 144 aa  49.3  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>