236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2181 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2181  general secretion pathway protein G  100 
 
 		 140 aa  284  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.934911  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3315  general secretion pathway protein G  80 
 
 		 143 aa  224  3e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.82991  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3149  general secretion pathway protein G  79.29 
 
 		 143 aa  224  3e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.907974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3221  general secretion pathway protein G  42.42 
 
 		 156 aa  111  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.287852 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4713  general secretion pathway protein G  40 
 
 		 166 aa  105  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02678  general secretion pathway protein G  45.74 
 
 		 143 aa  104  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2590  general secretion pathway protein G  37.23 
 
 		 154 aa  104  4e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1116  general secretion pathway protein G  37.86 
 
 		 143 aa  103  8e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1432  type II secretion systen protein G  40.3 
 
 		 209 aa  101  4e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.412586  normal  0.909605 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0548  general secretion pathway protein G  43.8 
 
 		 147 aa  100  5e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0374769 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2310  putative GSPG-related transmembrane protein  38.41 
 
 		 155 aa  100  6e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.164905  normal  0.125662 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2612  general secretion pathway protein G  40.15 
 
 		 153 aa  99.4  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.688921 
 
 
-
 
NC_003296  RS00346  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  37.5 
 
 		 144 aa  95.9  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.887338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1343  general secretion pathway protein G  35.66 
 
 		 160 aa  95.5  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.657967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0858  general secretory pathway protein G precursor  45.67 
 
 		 144 aa  94.4  4e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.653891  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0771  general secretion pathway protein G  45.67 
 
 		 144 aa  94.4  4e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02970  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  36.43 
 
 		 144 aa  93.6  7e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0455058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4158  general secretion pathway protein G  39.42 
 
 		 151 aa  93.6  7e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000753103 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16150  General secretion pathway protein G  38.69 
 
 		 145 aa  93.2  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.853983  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1293  tyep II secretion system protein G  39.42 
 
 		 179 aa  92.4  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.138374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2778  general secretion pathway protein G  36.99 
 
 		 149 aa  90.5  7e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1032  general secretion pathway protein G  37.75 
 
 		 153 aa  90.1  8e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3391  general secretion pathway protein G  37.24 
 
 		 156 aa  90.5  8e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0912  general secretion pathway protein G  35.77 
 
 		 172 aa  90.1  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.429886 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0102  general secretion pathway protein G  36.76 
 
 		 149 aa  89.4  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.573705  normal  0.0126574 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02835  hypothetical type II secretion protein GspG  38.51 
 
 		 151 aa  89  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000370073  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3424  general secretion pathway protein G  38.51 
 
 		 151 aa  89  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3409  general secretion pathway protein GspG  38.51 
 
 		 151 aa  89.4  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3244  general secretion pathway protein GspG  38.51 
 
 		 151 aa  89  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.948956  normal  0.749494 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2091  general secretion pathway protein G  36.62 
 
 		 152 aa  89  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0177627  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02785  hypothetical protein  38.51 
 
 		 151 aa  89  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000404727  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3135  general secretion pathway protein G  38.51 
 
 		 151 aa  89  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00604  general secretion pathway protein G  38.13 
 
 		 146 aa  87.8  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1049  general secretion pathway protein G  38.89 
 
 		 151 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3384  general secretion pathway protein G  35.62 
 
 		 154 aa  87.8  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3074  general secretion pathway protein G  37.14 
 
 		 158 aa  87.4  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016497 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4177  general secretion pathway protein G  38.19 
 
 		 144 aa  87.4  7e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.250819  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3044  general secretion pathway protein G  36.57 
 
 		 159 aa  87  8e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.21279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0144  general secretion pathway protein G  35.88 
 
 		 166 aa  86.7  9e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1301  general secretion pathway protein G  34.75 
 
 		 146 aa  86.7  9e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.010915 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2923  general secretion pathway protein G  35.71 
 
 		 141 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.370501  normal  0.274003 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001889  general secretion pathway protein G  38.13 
 
 		 147 aa  86.3  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2109  general secretion pathway protein G  34.33 
 
 		 159 aa  85.9  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.117776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4497  general secretion pathway protein G  37.14 
 
 		 154 aa  86.7  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.13255 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2303  general secretion pathway protein G  38.41 
 
 		 146 aa  86.3  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2372  general secretion pathway protein G  36.5 
 
 		 144 aa  86.3  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.411005  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2032  general secretion pathway protein G  36.5 
 
 		 142 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1413  general secretion pathway protein G  34.51 
 
 		 144 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0288958  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3240  general secretion pathway protein G  35 
 
 		 150 aa  85.5  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1090  general secretion pathway protein G  38.19 
 
 		 144 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319049  normal  0.327028 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1278  general secretion pathway protein G  36.36 
 
 		 147 aa  85.9  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1046  general secretion pathway protein G  38.19 
 
 		 144 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1073  general secretion pathway protein G  33.82 
 
 		 155 aa  85.1  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.56277  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4829  HxcT pseudopilin  36.3 
 
 		 149 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2921  general secretion pathway protein G  36.99 
 
 		 149 aa  84.7  4e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0231  general secretion pathway protein G  35.77 
 
 		 149 aa  84.7  4e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3106  putative general secretion pathway G transmembrane protein  36.57 
 
 		 156 aa  84.3  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.590033  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3179  general secretion pathway protein G  35.17 
 
 		 152 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.223664  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0012  general secretion pathway protein G  34.29 
 
 		 150 aa  84.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24020  general secretion pathway protein G  35.77 
 
 		 148 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55490  HxcT pseudopilin  36.3 
 
 		 149 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.04599 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0058  general secretion pathway protein G  34.29 
 
 		 150 aa  84.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109015  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0077  general secretion pathway protein G  34.29 
 
 		 150 aa  84.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0058  general secretion pathway protein G  34.29 
 
 		 150 aa  84  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2532  general secretion pathway protein G  35.77 
 
 		 156 aa  84  6e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.211317  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0048  general secretion pathway protein G  34.29 
 
 		 150 aa  84  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.503149  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3940  general secretion pathway protein G  35.71 
 
 		 154 aa  84  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.18178 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3221  general secretion pathway protein G  36.3 
 
 		 163 aa  83.6  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1280  general secretion pathway protein G  36.3 
 
 		 158 aa  83.6  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3030  general secretion pathway protein G  33.59 
 
 		 139 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.187173  hitchhiker  0.00937307 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1973  general secretion pathway protein G  38.3 
 
 		 142 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.432332  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1316  type II secretory pathway protein LspG  35.77 
 
 		 140 aa  82  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1313  type II secretory pathway protein LspG  35.77 
 
 		 140 aa  82  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0592  general secretion pathway protein G  36.3 
 
 		 147 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0059  general secretion pathway protein G  33.57 
 
 		 150 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2587  general secretion pathway protein G  37.04 
 
 		 161 aa  80.9  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1321  general secretion pathway protein G  35.46 
 
 		 158 aa  80.5  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0739  general secretion pathway protein G  33.08 
 
 		 164 aa  80.9  0.000000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.430586  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1081  general secretion pathway protein G  35 
 
 		 146 aa  80.5  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464773  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2391  general secretion pathway protein G  33.81 
 
 		 144 aa  80.1  0.000000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000271033 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5689  general secretion pathway protein G  32.62 
 
 		 158 aa  79  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128164  normal  0.128064 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0534  general secretion pathway protein G  36.03 
 
 		 147 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3007  general secretion pathway protein G  33.85 
 
 		 155 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.303532 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0257  general secretion pathway protein G  36.88 
 
 		 193 aa  78.2  0.00000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2781  general secretion pathway protein G  32.85 
 
 		 150 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0224  general secretion pathway protein G  32.85 
 
 		 150 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0012  general secretion pathway protein G  32.85 
 
 		 150 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0011  general secretion pathway protein G  32.85 
 
 		 150 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18680  type II secretion system protein G  32.61 
 
 		 143 aa  77  0.00000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2666  general secretion pathway protein G  32.85 
 
 		 150 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0012  general secretion pathway protein G  32.85 
 
 		 150 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127302  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3514  general secretion pathway protein G  32.85 
 
 		 150 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.957184  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1886  general secretion pathway protein G  32.85 
 
 		 150 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.354233  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2613  putative general secretion pathway protein G precursor (PilD-dependent protein pddA)  31.06 
 
 		 163 aa  77  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3419  general secretion pathway protein G  34.56 
 
 		 150 aa  76.6  0.00000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000422428 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3312  general secretion pathway protein G  31.88 
 
 		 138 aa  76.6  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0253  general secretion pathway protein G  38.85 
 
 		 150 aa  75.9  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0654  general secretion pathway protein G  33.1 
 
 		 159 aa  75.9  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0121173  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3531  general secretion pathway protein G  31.85 
 
 		 142 aa  75.9  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.524702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0675  general secretion pathway protein G  32.67 
 
 		 159 aa  75.9  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.186648  normal  0.343045 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>