219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0548 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_0548  general secretion pathway protein G  100 
 
 
147 aa  293  6e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0374769 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02678  general secretion pathway protein G  73.24 
 
 
143 aa  190  6e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0771  general secretion pathway protein G  68.97 
 
 
144 aa  180  7e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0858  general secretory pathway protein G precursor  68.28 
 
 
144 aa  179  1e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.653891  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3315  general secretion pathway protein G  45.19 
 
 
143 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.82991  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3149  general secretion pathway protein G  44.44 
 
 
143 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.907974  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2181  general secretion pathway protein G  43.8 
 
 
140 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.934911  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2613  putative general secretion pathway protein G precursor (PilD-dependent protein pddA)  40.44 
 
 
163 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00346  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  41.41 
 
 
144 aa  105  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.887338  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3007  general secretion pathway protein G  40.77 
 
 
155 aa  104  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.303532 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0912  general secretion pathway protein G  40.46 
 
 
172 aa  104  4e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.429886 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3030  general secretion pathway protein G  38.3 
 
 
139 aa  103  9e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.187173  hitchhiker  0.00937307 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4713  general secretion pathway protein G  37.93 
 
 
166 aa  103  9e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2778  general secretion pathway protein G  37.14 
 
 
149 aa  101  3e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1280  general secretion pathway protein G  36.69 
 
 
158 aa  100  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1343  general secretion pathway protein G  39.37 
 
 
160 aa  100  8e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.657967  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2109  general secretion pathway protein G  41.98 
 
 
159 aa  99.8  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.117776  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02970  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  35.92 
 
 
144 aa  97.4  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0455058  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1432  type II secretion systen protein G  41.09 
 
 
209 aa  97.4  5e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.412586  normal  0.909605 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2590  general secretion pathway protein G  37.4 
 
 
154 aa  97.1  8e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0739  general secretion pathway protein G  37.78 
 
 
164 aa  96.3  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.430586  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2310  putative GSPG-related transmembrane protein  39.37 
 
 
155 aa  94.4  5e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.164905  normal  0.125662 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16150  General secretion pathway protein G  36.92 
 
 
145 aa  93.6  8e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.853983  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4158  general secretion pathway protein G  37.04 
 
 
151 aa  93.6  8e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000753103 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2612  general secretion pathway protein G  36.43 
 
 
153 aa  93.2  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.688921 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1116  general secretion pathway protein G  34.85 
 
 
143 aa  92.8  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2032  general secretion pathway protein G  36.88 
 
 
142 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3221  general secretion pathway protein G  36.43 
 
 
156 aa  91.7  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.287852 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1584  general secretion pathway protein G  36.15 
 
 
166 aa  91.7  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0906658 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0257  general secretion pathway protein G  36.67 
 
 
193 aa  91.3  4e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24020  general secretion pathway protein G  36.17 
 
 
148 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2650  general secretion pathway protein G  37.5 
 
 
155 aa  89.4  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0102  general secretion pathway protein G  33.85 
 
 
149 aa  89  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.573705  normal  0.0126574 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0883  general secretion pathway protein G  39.67 
 
 
145 aa  87  7e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2091  general secretion pathway protein G  34.97 
 
 
152 aa  85.9  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0177627  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1301  general secretion pathway protein G  32.86 
 
 
146 aa  85.1  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.010915 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1430  general secretion pathway protein G  36.36 
 
 
146 aa  85.1  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1973  general secretion pathway protein G  36.69 
 
 
142 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.432332  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29510  putative type II secretion system protein  37.23 
 
 
144 aa  84  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2923  general secretion pathway protein G  34.29 
 
 
141 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.370501  normal  0.274003 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2792  general secretion pathway protein G  41.28 
 
 
141 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.533388  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1351  general secretion pathway protein G  32.85 
 
 
150 aa  82.8  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.346821  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3423  general secretion pathway protein G  39.45 
 
 
169 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2339  general secretion pathway protein G  39.45 
 
 
141 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2517  general secretion pathway protein G  40.37 
 
 
141 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.514813  normal  0.111432 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1794  general secretion pathway protein G  42.72 
 
 
154 aa  82  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.338951  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1609  general secretion pathway protein G  35.81 
 
 
150 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.784305  normal  0.423382 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0318  general secretion pathway protein G  35.46 
 
 
163 aa  81.3  0.000000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1528  general secretion pathway protein G  40.31 
 
 
142 aa  80.9  0.000000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.951257  normal  0.430889 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2421  general secretion pathway protein G  37.96 
 
 
142 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1321  general secretion pathway protein G  34.75 
 
 
158 aa  79  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2021  general secretion pathway protein G  38.32 
 
 
145 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.131235  normal  0.178843 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28620  General secretion pathway protein G  35.29 
 
 
142 aa  78.6  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5689  general secretion pathway protein G  33.1 
 
 
158 aa  78.6  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128164  normal  0.128064 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2587  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 
161 aa  77.4  0.00000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1413  general secretion pathway protein G  34.07 
 
 
144 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0288958  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3230  general secretion pathway protein G  36.84 
 
 
139 aa  77  0.00000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000198179  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1046  general secretion pathway protein G  35.34 
 
 
144 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2391  general secretion pathway protein G  31.47 
 
 
144 aa  77  0.00000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000271033 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3044  general secretion pathway protein G  32.88 
 
 
159 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.21279  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2921  general secretion pathway protein G  32.14 
 
 
149 aa  76.3  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1090  general secretion pathway protein G  35.34 
 
 
144 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319049  normal  0.327028 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3312  general secretion pathway protein G  34.17 
 
 
138 aa  75.5  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2372  general secretion pathway protein G  31.43 
 
 
144 aa  75.9  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.411005  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18680  type II secretion system protein G  31.39 
 
 
143 aa  75.1  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4177  general secretion pathway protein G  34.33 
 
 
144 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.250819  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3391  general secretion pathway protein G  32.24 
 
 
156 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1049  general secretion pathway protein G  34.04 
 
 
151 aa  74.3  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0592  general secretion pathway protein G  31.25 
 
 
147 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4497  general secretion pathway protein G  30.72 
 
 
154 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.13255 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3419  general secretion pathway protein G  34.93 
 
 
150 aa  74.3  0.0000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000422428 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3384  general secretion pathway protein G  32.03 
 
 
154 aa  73.9  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3106  putative general secretion pathway G transmembrane protein  32 
 
 
156 aa  73.9  0.0000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.590033  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3221  general secretion pathway protein G  29.61 
 
 
163 aa  73.9  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0675  general secretion pathway protein G  32.47 
 
 
159 aa  73.6  0.0000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.186648  normal  0.343045 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0058  general secretion pathway protein G  31.21 
 
 
150 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663302  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0048  general secretion pathway protein G  31.21 
 
 
150 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.503149  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1278  general secretion pathway protein G  32.62 
 
 
147 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4829  HxcT pseudopilin  30.83 
 
 
149 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2893  general secretion pathway protein G  35.78 
 
 
144 aa  73.2  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.21869  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3179  general secretion pathway protein G  32.87 
 
 
152 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.223664  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55490  HxcT pseudopilin  30.83 
 
 
149 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.04599 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0686  general secretion pathway protein G  36.09 
 
 
161 aa  73.2  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0282491 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02835  hypothetical type II secretion protein GspG  29.93 
 
 
151 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000370073  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3135  general secretion pathway protein G  29.93 
 
 
151 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3409  general secretion pathway protein GspG  29.93 
 
 
151 aa  72.8  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0654  general secretion pathway protein G  32.47 
 
 
159 aa  72.8  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0121173  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3244  general secretion pathway protein GspG  29.93 
 
 
151 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.948956  normal  0.749494 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1081  general secretion pathway protein G  31.82 
 
 
146 aa  72.8  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464773  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02785  hypothetical protein  29.93 
 
 
151 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000404727  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3424  general secretion pathway protein G  29.93 
 
 
151 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3128  general secretion pathway protein G  32.12 
 
 
165 aa  72.8  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0729977 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3940  general secretion pathway protein G  30.71 
 
 
154 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.18178 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0144  general secretion pathway protein G  30.82 
 
 
166 aa  71.6  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2303  general secretion pathway protein G  29.71 
 
 
146 aa  71.2  0.000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0077  general secretion pathway protein G  30.5 
 
 
150 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0683  general secretion pathway protein G  32.09 
 
 
137 aa  71.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0012  general secretion pathway protein G  30.5 
 
 
150 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3074  general secretion pathway protein G  30.71 
 
 
158 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000016497 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0058  general secretion pathway protein G  30.5 
 
 
150 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109015  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>