More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1609 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_1609  general secretion pathway protein G  100 
 
 
150 aa  294  3e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.784305  normal  0.423382 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2091  general secretion pathway protein G  57.02 
 
 
152 aa  136  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0177627  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1584  general secretion pathway protein G  50.76 
 
 
166 aa  130  6e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0906658 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1116  general secretion pathway protein G  55.05 
 
 
143 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2109  general secretion pathway protein G  48.12 
 
 
159 aa  125  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.117776  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0912  general secretion pathway protein G  48.84 
 
 
172 aa  124  6e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.429886 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1280  general secretion pathway protein G  43.62 
 
 
158 aa  122  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3007  general secretion pathway protein G  46.27 
 
 
155 aa  118  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.303532 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2778  general secretion pathway protein G  56.44 
 
 
149 aa  118  3e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2613  putative general secretion pathway protein G precursor (PilD-dependent protein pddA)  49.57 
 
 
163 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4158  general secretion pathway protein G  48.03 
 
 
151 aa  113  7.999999999999999e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000753103 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0686  general secretion pathway protein G  51.4 
 
 
161 aa  108  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0282491 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1301  general secretion pathway protein G  46.67 
 
 
146 aa  108  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.010915 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0739  general secretion pathway protein G  40.91 
 
 
164 aa  106  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.430586  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4713  general secretion pathway protein G  46.28 
 
 
166 aa  106  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1528  general secretion pathway protein G  48.67 
 
 
142 aa  105  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.951257  normal  0.430889 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2310  putative GSPG-related transmembrane protein  46.61 
 
 
155 aa  105  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.164905  normal  0.125662 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1343  general secretion pathway protein G  45.22 
 
 
160 aa  102  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.657967  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2587  general secretion pathway protein G  43.2 
 
 
161 aa  102  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0883  general secretion pathway protein G  43.12 
 
 
145 aa  102  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02970  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  41.94 
 
 
144 aa  100  6e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0455058  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2612  general secretion pathway protein G  48.6 
 
 
153 aa  100  6e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.688921 
 
 
-
 
NC_003296  RS00346  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  45.54 
 
 
144 aa  99  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.887338  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16150  General secretion pathway protein G  47.22 
 
 
145 aa  98.6  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.853983  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1032  general secretion pathway protein G  44.19 
 
 
153 aa  99.4  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0102  general secretion pathway protein G  46.02 
 
 
149 aa  98.2  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.573705  normal  0.0126574 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1794  general secretion pathway protein G  48.8 
 
 
154 aa  97.4  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.338951  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29510  putative type II secretion system protein  45 
 
 
144 aa  96.7  9e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2893  general secretion pathway protein G  52.17 
 
 
144 aa  96.3  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.21869  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0675  general secretion pathway protein G  44 
 
 
159 aa  95.9  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.186648  normal  0.343045 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0654  general secretion pathway protein G  44 
 
 
159 aa  95.9  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0121173  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2021  general secretion pathway protein G  48.85 
 
 
145 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.131235  normal  0.178843 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1432  type II secretion systen protein G  43.64 
 
 
209 aa  95.1  3e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.412586  normal  0.909605 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2590  general secretion pathway protein G  38.97 
 
 
154 aa  94  6e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2650  general secretion pathway protein G  42.52 
 
 
155 aa  94  6e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3221  general secretion pathway protein G  46.3 
 
 
156 aa  93.2  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.287852 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3179  general secretion pathway protein G  44.07 
 
 
152 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.223664  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0592  general secretion pathway protein G  41.82 
 
 
147 aa  92.8  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0318  general secretion pathway protein G  44.8 
 
 
163 aa  90.5  7e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3030  general secretion pathway protein G  37.29 
 
 
139 aa  90.1  9e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.187173  hitchhiker  0.00937307 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2032  general secretion pathway protein G  39.67 
 
 
142 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1351  general secretion pathway protein G  40 
 
 
150 aa  89.4  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.346821  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0605  general secretion pathway protein G  40 
 
 
147 aa  89.7  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000021872 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0534  general secretion pathway protein G  44.14 
 
 
147 aa  89.7  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3384  general secretion pathway protein G  39.58 
 
 
154 aa  89.7  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1278  general secretion pathway protein G  38.6 
 
 
147 aa  89.4  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5689  general secretion pathway protein G  42.98 
 
 
158 aa  88.6  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128164  normal  0.128064 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1321  general secretion pathway protein G  43.86 
 
 
158 aa  89  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3419  general secretion pathway protein G  43.1 
 
 
150 aa  88.6  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000422428 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24020  general secretion pathway protein G  39.67 
 
 
148 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18680  type II secretion system protein G  42.2 
 
 
143 aa  88.2  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0925  general secretion pathway protein G  39.1 
 
 
162 aa  88.6  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0172546  normal  0.856291 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1293  tyep II secretion system protein G  47.66 
 
 
179 aa  87.8  4e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.138374  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1081  general secretion pathway protein G  41.32 
 
 
146 aa  87.8  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464773  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3423  general secretion pathway protein G  42.42 
 
 
169 aa  87  7e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4829  HxcT pseudopilin  42.48 
 
 
149 aa  87  7e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0144  general secretion pathway protein G  40.18 
 
 
166 aa  87  7e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1413  general secretion pathway protein G  39.13 
 
 
144 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0288958  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3221  general secretion pathway protein G  36.67 
 
 
163 aa  86.7  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2923  general secretion pathway protein G  39.82 
 
 
141 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.370501  normal  0.274003 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2339  general secretion pathway protein G  42.42 
 
 
141 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55490  HxcT pseudopilin  42.34 
 
 
149 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.04599 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0764  general secretion pathway protein G  40.15 
 
 
139 aa  86.3  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.546085  normal  0.0744092 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3391  general secretion pathway protein G  36.6 
 
 
156 aa  85.5  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2792  general secretion pathway protein G  42.97 
 
 
141 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.533388  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3128  general secretion pathway protein G  43.12 
 
 
165 aa  84.7  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0729977 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2517  general secretion pathway protein G  44.64 
 
 
141 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.514813  normal  0.111432 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3044  general secretion pathway protein G  36.88 
 
 
159 aa  84.3  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.21279  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3106  putative general secretion pathway G transmembrane protein  41.82 
 
 
156 aa  84.3  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.590033  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1316  type II secretory pathway protein LspG  38.76 
 
 
140 aa  83.6  8e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1313  type II secretory pathway protein LspG  38.76 
 
 
140 aa  83.6  8e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0257  general secretion pathway protein G  32.06 
 
 
193 aa  82  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3244  general secretion pathway protein GspG  36.3 
 
 
151 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.948956  normal  0.749494 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2532  general secretion pathway protein G  38.71 
 
 
156 aa  80.9  0.000000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.211317  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1090  general secretion pathway protein G  40 
 
 
144 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319049  normal  0.327028 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03959  general secretion pathway protein G  39.02 
 
 
145 aa  80.9  0.000000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0384  general secretion pathway protein G  40.91 
 
 
151 aa  80.9  0.000000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.54833 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1046  general secretion pathway protein G  40 
 
 
144 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02835  hypothetical type II secretion protein GspG  35.56 
 
 
151 aa  80.5  0.000000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000370073  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3409  general secretion pathway protein GspG  35.56 
 
 
151 aa  80.5  0.000000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02785  hypothetical protein  35.56 
 
 
151 aa  80.5  0.000000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000404727  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3424  general secretion pathway protein G  35.56 
 
 
151 aa  80.5  0.000000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3135  general secretion pathway protein G  35.56 
 
 
151 aa  80.5  0.000000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1049  general secretion pathway protein G  40 
 
 
151 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001889  general secretion pathway protein G  37.07 
 
 
147 aa  80.1  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0231  general secretion pathway protein G  40.91 
 
 
149 aa  79.7  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2303  general secretion pathway protein G  38.39 
 
 
146 aa  79.3  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28620  General secretion pathway protein G  42.98 
 
 
142 aa  79.3  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3312  general secretion pathway protein G  35.85 
 
 
138 aa  79.3  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0253  general secretion pathway protein G  38.74 
 
 
150 aa  79  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3577  ATPase  36.59 
 
 
146 aa  79.3  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.44565 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2421  general secretion pathway protein G  47.73 
 
 
142 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0234  general secretion pathway protein G  36.09 
 
 
146 aa  79  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4177  general secretion pathway protein G  40 
 
 
144 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.250819  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0956  general secretion pathway protein G  36.36 
 
 
145 aa  78.6  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.194745  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1007  general secretion pathway protein G  36.36 
 
 
145 aa  78.6  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3266  general secretion pathway protein G  36.36 
 
 
145 aa  78.6  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000062887  hitchhiker  0.00000000000000294917 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0059  general secretion pathway protein G  36.8 
 
 
150 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00604  general secretion pathway protein G  36.21 
 
 
146 aa  78.2  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1973  general secretion pathway protein G  48.08 
 
 
142 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.432332  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>