More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1430 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1430  general secretion pathway protein G  100 
 
 		 146 aa  292  8e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1432  type II secretion systen protein G  56.92 
 
 		 209 aa  156  8e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.412586  normal  0.909605 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2590  general secretion pathway protein G  54.74 
 
 		 154 aa  152  1e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1343  general secretion pathway protein G  54.69 
 
 		 160 aa  152  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.657967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3221  general secretion pathway protein G  55.04 
 
 		 156 aa  148  3e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.287852 
 
 
-
 
NC_003296  RS02970  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  50 
 
 		 144 aa  144  4.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0455058  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00346  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  52.17 
 
 		 144 aa  142  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.887338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4713  general secretion pathway protein G  51.56 
 
 		 166 aa  141  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2310  putative GSPG-related transmembrane protein  52.27 
 
 		 155 aa  140  6e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.164905  normal  0.125662 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2612  general secretion pathway protein G  50 
 
 		 153 aa  134  4e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.688921 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16150  General secretion pathway protein G  48.25 
 
 		 145 aa  133  7.000000000000001e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.853983  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1301  general secretion pathway protein G  47.45 
 
 		 146 aa  132  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.010915 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4158  general secretion pathway protein G  49.62 
 
 		 151 aa  133  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000753103 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1116  general secretion pathway protein G  46.62 
 
 		 143 aa  128  3e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1293  tyep II secretion system protein G  52.82 
 
 		 179 aa  128  3e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.138374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0739  general secretion pathway protein G  45.93 
 
 		 164 aa  127  5.0000000000000004e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.430586  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0912  general secretion pathway protein G  43.66 
 
 		 172 aa  127  6e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.429886 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1280  general secretion pathway protein G  44.29 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0102  general secretion pathway protein G  45.11 
 
 		 149 aa  125  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.573705  normal  0.0126574 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3007  general secretion pathway protein G  45.04 
 
 		 155 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.303532 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2109  general secretion pathway protein G  45.8 
 
 		 159 aa  118  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.117776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2421  general secretion pathway protein G  53.08 
 
 		 142 aa  118  3e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29510  putative type II secretion system protein  46.76 
 
 		 144 aa  116  9e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2613  putative general secretion pathway protein G precursor (PilD-dependent protein pddA)  42.54 
 
 		 163 aa  116  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0686  general secretion pathway protein G  49.57 
 
 		 161 aa  114  3e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0282491 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3384  general secretion pathway protein G  39.58 
 
 		 154 aa  114  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2792  general secretion pathway protein G  50.38 
 
 		 141 aa  114  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.533388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1584  general secretion pathway protein G  42.66 
 
 		 166 aa  114  5e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0906658 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0257  general secretion pathway protein G  43.51 
 
 		 193 aa  113  7.999999999999999e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1081  general secretion pathway protein G  43.45 
 
 		 146 aa  113  8.999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464773  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3423  general secretion pathway protein G  50.38 
 
 		 169 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1973  general secretion pathway protein G  46.97 
 
 		 142 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.432332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5689  general secretion pathway protein G  43.94 
 
 		 158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128164  normal  0.128064 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2517  general secretion pathway protein G  50.38 
 
 		 141 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.514813  normal  0.111432 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3044  general secretion pathway protein G  39.26 
 
 		 159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.21279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3128  general secretion pathway protein G  42.34 
 
 		 165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0729977 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3221  general secretion pathway protein G  42.65 
 
 		 163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2339  general secretion pathway protein G  50.38 
 
 		 141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2372  general secretion pathway protein G  42.54 
 
 		 144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.411005  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3391  general secretion pathway protein G  39.26 
 
 		 156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0654  general secretion pathway protein G  42.22 
 
 		 159 aa  111  3e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0121173  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0675  general secretion pathway protein G  42.22 
 
 		 159 aa  111  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.186648  normal  0.343045 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2091  general secretion pathway protein G  42.42 
 
 		 152 aa  111  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0177627  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3419  general secretion pathway protein G  42.18 
 
 		 150 aa  111  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000422428 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2923  general secretion pathway protein G  42.42 
 
 		 141 aa  110  5e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.370501  normal  0.274003 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1321  general secretion pathway protein G  42.86 
 
 		 158 aa  110  5e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1413  general secretion pathway protein G  42.86 
 
 		 144 aa  110  9e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0288958  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3179  general secretion pathway protein G  42.75 
 
 		 152 aa  110  9e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.223664  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0231  general secretion pathway protein G  41.26 
 
 		 149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3030  general secretion pathway protein G  41.48 
 
 		 139 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.187173  hitchhiker  0.00937307 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4829  HxcT pseudopilin  40.15 
 
 		 149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28620  General secretion pathway protein G  46.21 
 
 		 142 aa  108  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2532  general secretion pathway protein G  39.16 
 
 		 156 aa  108  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.211317  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2032  general secretion pathway protein G  41.18 
 
 		 142 aa  108  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1351  general secretion pathway protein G  40.46 
 
 		 150 aa  108  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.346821  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0534  general secretion pathway protein G  42.65 
 
 		 147 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2778  general secretion pathway protein G  45.45 
 
 		 149 aa  107  4.0000000000000004e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24020  general secretion pathway protein G  39.44 
 
 		 148 aa  107  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2391  general secretion pathway protein G  40.44 
 
 		 144 aa  107  7.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000271033 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55490  HxcT pseudopilin  39.39 
 
 		 149 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.04599 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3106  putative general secretion pathway G transmembrane protein  40.77 
 
 		 156 aa  107  8.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.590033  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2587  general secretion pathway protein G  43.7 
 
 		 161 aa  106  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1046  general secretion pathway protein G  39.71 
 
 		 144 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4177  general secretion pathway protein G  39.71 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.250819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3940  general secretion pathway protein G  40.88 
 
 		 154 aa  105  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.18178 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0925  general secretion pathway protein G  42.31 
 
 		 162 aa  105  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0172546  normal  0.856291 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4497  general secretion pathway protein G  41.48 
 
 		 154 aa  105  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.13255 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0883  general secretion pathway protein G  43.24 
 
 		 145 aa  105  3e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1090  general secretion pathway protein G  39.71 
 
 		 144 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319049  normal  0.327028 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1073  general secretion pathway protein G  39.71 
 
 		 155 aa  104  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.56277  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0144  general secretion pathway protein G  41.09 
 
 		 166 aa  104  4e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1049  general secretion pathway protein G  39.71 
 
 		 151 aa  104  5e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0592  general secretion pathway protein G  39.71 
 
 		 147 aa  103  5e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001889  general secretion pathway protein G  41.18 
 
 		 147 aa  103  6e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2303  general secretion pathway protein G  41.18 
 
 		 146 aa  103  8e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3240  general secretion pathway protein G  38.36 
 
 		 150 aa  103  9e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00604  general secretion pathway protein G  41.91 
 
 		 146 aa  102  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1278  general secretion pathway protein G  40.74 
 
 		 147 aa  102  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3074  general secretion pathway protein G  38.3 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016497 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0059  general secretion pathway protein G  37.67 
 
 		 150 aa  101  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0318  general secretion pathway protein G  41.38 
 
 		 163 aa  100  5e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0077  general secretion pathway protein G  36.99 
 
 		 150 aa  100  7e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2650  general secretion pathway protein G  42.55 
 
 		 155 aa  100  7e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0012  general secretion pathway protein G  36.99 
 
 		 150 aa  100  7e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0058  general secretion pathway protein G  36.99 
 
 		 150 aa  100  7e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0048  general secretion pathway protein G  36.99 
 
 		 150 aa  100  7e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.503149  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0058  general secretion pathway protein G  36.99 
 
 		 150 aa  100  7e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109015  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1032  general secretion pathway protein G  39.42 
 
 		 153 aa  99.4  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0764  general secretion pathway protein G  41.91 
 
 		 139 aa  99  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.546085  normal  0.0744092 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3514  general secretion pathway protein G  38.93 
 
 		 150 aa  98.2  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.957184  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2781  general secretion pathway protein G  38.93 
 
 		 150 aa  98.2  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0012  general secretion pathway protein G  38.93 
 
 		 150 aa  98.2  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2666  general secretion pathway protein G  38.93 
 
 		 150 aa  98.2  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0224  general secretion pathway protein G  38.93 
 
 		 150 aa  98.2  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2893  general secretion pathway protein G  48.48 
 
 		 144 aa  98.6  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.21869  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0011  general secretion pathway protein G  38.93 
 
 		 150 aa  98.2  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1886  general secretion pathway protein G  38.93 
 
 		 150 aa  98.2  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.354233  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0012  general secretion pathway protein G  38.93 
 
 		 150 aa  98.2  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127302  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2921  general secretion pathway protein G  38.03 
 
 		 149 aa  98.6  3e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3409  general secretion pathway protein GspG  40.44 
 
 		 151 aa  97.4  5e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>