More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1301 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_1301  general secretion pathway protein G  100 
 
 
146 aa  291  2e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.010915 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4158  general secretion pathway protein G  78.36 
 
 
151 aa  216  1e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000753103 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0686  general secretion pathway protein G  73.68 
 
 
161 aa  178  2.9999999999999997e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0282491 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1116  general secretion pathway protein G  54.93 
 
 
143 aa  159  1e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3221  general secretion pathway protein G  57.25 
 
 
156 aa  157  4e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.287852 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0912  general secretion pathway protein G  54.61 
 
 
172 aa  154  3e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.429886 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1432  type II secretion systen protein G  53.68 
 
 
209 aa  150  4e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.412586  normal  0.909605 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1280  general secretion pathway protein G  53.33 
 
 
158 aa  149  8e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16150  General secretion pathway protein G  52.14 
 
 
145 aa  148  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.853983  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2091  general secretion pathway protein G  51.06 
 
 
152 aa  147  6e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0177627  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4713  general secretion pathway protein G  52.76 
 
 
166 aa  146  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02970  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  52.31 
 
 
144 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0455058  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3007  general secretion pathway protein G  51.49 
 
 
155 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.303532 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0739  general secretion pathway protein G  52.31 
 
 
164 aa  144  5e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.430586  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2590  general secretion pathway protein G  49.65 
 
 
154 aa  143  9e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2613  putative general secretion pathway protein G precursor (PilD-dependent protein pddA)  51.88 
 
 
163 aa  142  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00346  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  49.31 
 
 
144 aa  142  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.887338  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1343  general secretion pathway protein G  50.37 
 
 
160 aa  143  1e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.657967  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2109  general secretion pathway protein G  53.85 
 
 
159 aa  140  7e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.117776  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1293  tyep II secretion system protein G  56.06 
 
 
179 aa  139  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.138374  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2612  general secretion pathway protein G  52.71 
 
 
153 aa  138  3e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.688921 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0102  general secretion pathway protein G  50 
 
 
149 aa  137  7e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.573705  normal  0.0126574 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2310  putative GSPG-related transmembrane protein  51.59 
 
 
155 aa  135  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.164905  normal  0.125662 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1584  general secretion pathway protein G  56.8 
 
 
166 aa  134  3.0000000000000003e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0906658 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2421  general secretion pathway protein G  54.61 
 
 
142 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1973  general secretion pathway protein G  52.48 
 
 
142 aa  130  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.432332  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2372  general secretion pathway protein G  49.63 
 
 
144 aa  130  5e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.411005  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1032  general secretion pathway protein G  50.34 
 
 
153 aa  127  5.0000000000000004e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28620  General secretion pathway protein G  52.59 
 
 
142 aa  127  6e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3423  general secretion pathway protein G  55.38 
 
 
169 aa  126  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2339  general secretion pathway protein G  55.38 
 
 
141 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0675  general secretion pathway protein G  46.43 
 
 
159 aa  125  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.186648  normal  0.343045 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2792  general secretion pathway protein G  54.96 
 
 
141 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.533388  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0144  general secretion pathway protein G  46.1 
 
 
166 aa  125  2.0000000000000002e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2517  general secretion pathway protein G  55.38 
 
 
141 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.514813  normal  0.111432 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0654  general secretion pathway protein G  46.43 
 
 
159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0121173  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1081  general secretion pathway protein G  45.99 
 
 
146 aa  124  5e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464773  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0059  general secretion pathway protein G  44.9 
 
 
150 aa  124  5e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1278  general secretion pathway protein G  46.94 
 
 
147 aa  124  5e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1351  general secretion pathway protein G  46.1 
 
 
150 aa  123  8.000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.346821  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3384  general secretion pathway protein G  45.32 
 
 
154 aa  123  8.000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3419  general secretion pathway protein G  46.62 
 
 
150 aa  122  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000422428 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2893  general secretion pathway protein G  54.17 
 
 
144 aa  122  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.21869  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4829  HxcT pseudopilin  47.76 
 
 
149 aa  122  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0592  general secretion pathway protein G  50.37 
 
 
147 aa  122  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0231  general secretion pathway protein G  45.21 
 
 
149 aa  122  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55490  HxcT pseudopilin  48.09 
 
 
149 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.04599 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5689  general secretion pathway protein G  47.76 
 
 
158 aa  121  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128164  normal  0.128064 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29510  putative type II secretion system protein  45.99 
 
 
144 aa  121  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3240  general secretion pathway protein G  44.9 
 
 
150 aa  120  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3391  general secretion pathway protein G  43.42 
 
 
156 aa  120  5e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0058  general secretion pathway protein G  44.9 
 
 
150 aa  120  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663302  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0048  general secretion pathway protein G  44.9 
 
 
150 aa  120  5e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.503149  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1528  general secretion pathway protein G  53.28 
 
 
142 aa  119  9.999999999999999e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.951257  normal  0.430889 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3044  general secretion pathway protein G  42.58 
 
 
159 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.21279  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4497  general secretion pathway protein G  45.52 
 
 
154 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.13255 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0925  general secretion pathway protein G  47.29 
 
 
162 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0172546  normal  0.856291 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0077  general secretion pathway protein G  43.54 
 
 
150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1321  general secretion pathway protein G  43.06 
 
 
158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0012  general secretion pathway protein G  43.54 
 
 
150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0058  general secretion pathway protein G  43.54 
 
 
150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109015  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3940  general secretion pathway protein G  44.78 
 
 
154 aa  118  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.18178 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0257  general secretion pathway protein G  45.39 
 
 
193 aa  118  3e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2778  general secretion pathway protein G  44.14 
 
 
149 aa  118  3e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1046  general secretion pathway protein G  42.45 
 
 
144 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3179  general secretion pathway protein G  47.33 
 
 
152 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.223664  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3128  general secretion pathway protein G  44.53 
 
 
165 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0729977 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3221  general secretion pathway protein G  43.92 
 
 
163 aa  117  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3074  general secretion pathway protein G  44.78 
 
 
158 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000016497 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1090  general secretion pathway protein G  42.45 
 
 
144 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319049  normal  0.327028 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00604  general secretion pathway protein G  44.93 
 
 
146 aa  116  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1049  general secretion pathway protein G  42.34 
 
 
151 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2532  general secretion pathway protein G  44.44 
 
 
156 aa  115  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.211317  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1073  general secretion pathway protein G  44.85 
 
 
155 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.56277  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2391  general secretion pathway protein G  43.97 
 
 
144 aa  115  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000271033 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001889  general secretion pathway protein G  44.93 
 
 
147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3106  putative general secretion pathway G transmembrane protein  46.21 
 
 
156 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.590033  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0534  general secretion pathway protein G  44.06 
 
 
147 aa  115  3e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2666  general secretion pathway protein G  46.56 
 
 
150 aa  114  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3514  general secretion pathway protein G  46.56 
 
 
150 aa  114  5e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.957184  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4177  general secretion pathway protein G  40.29 
 
 
144 aa  114  5e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.250819  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0012  general secretion pathway protein G  46.56 
 
 
150 aa  114  5e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2781  general secretion pathway protein G  46.56 
 
 
150 aa  114  5e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1886  general secretion pathway protein G  46.56 
 
 
150 aa  114  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.354233  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0224  general secretion pathway protein G  46.56 
 
 
150 aa  114  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0012  general secretion pathway protein G  46.56 
 
 
150 aa  114  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127302  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0011  general secretion pathway protein G  46.56 
 
 
150 aa  114  5e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3244  general secretion pathway protein GspG  45.39 
 
 
151 aa  113  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.948956  normal  0.749494 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0883  general secretion pathway protein G  55.24 
 
 
145 aa  113  8.999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02835  hypothetical type II secretion protein GspG  44.68 
 
 
151 aa  112  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000370073  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3135  general secretion pathway protein G  44.68 
 
 
151 aa  112  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3409  general secretion pathway protein GspG  44.68 
 
 
151 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02785  hypothetical protein  44.68 
 
 
151 aa  112  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000404727  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3424  general secretion pathway protein G  44.68 
 
 
151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2032  general secretion pathway protein G  46.38 
 
 
142 aa  110  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3030  general secretion pathway protein G  43.61 
 
 
139 aa  110  6e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.187173  hitchhiker  0.00937307 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1413  general secretion pathway protein G  44.29 
 
 
144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0288958  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24020  general secretion pathway protein G  45.65 
 
 
148 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1609  general secretion pathway protein G  46.67 
 
 
150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.784305  normal  0.423382 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2921  general secretion pathway protein G  44.06 
 
 
149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>