286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1528 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_1528  general secretion pathway protein G  100 
 
 
142 aa  290  5e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.951257  normal  0.430889 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0883  general secretion pathway protein G  59.56 
 
 
145 aa  163  6.9999999999999995e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0912  general secretion pathway protein G  52.46 
 
 
172 aa  135  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.429886 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2310  putative GSPG-related transmembrane protein  52.55 
 
 
155 aa  134  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.164905  normal  0.125662 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1584  general secretion pathway protein G  50.71 
 
 
166 aa  134  6.0000000000000005e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0906658 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4713  general secretion pathway protein G  54.03 
 
 
166 aa  127  7.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2612  general secretion pathway protein G  50.37 
 
 
153 aa  127  7.000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.688921 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2590  general secretion pathway protein G  51.13 
 
 
154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1116  general secretion pathway protein G  46.46 
 
 
143 aa  124  6e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1280  general secretion pathway protein G  45.52 
 
 
158 aa  123  9e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2109  general secretion pathway protein G  50 
 
 
159 aa  122  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.117776  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4158  general secretion pathway protein G  56.3 
 
 
151 aa  122  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000753103 
 
 
-
 
NC_003296  RS00346  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  49.23 
 
 
144 aa  121  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.887338  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0686  general secretion pathway protein G  56.07 
 
 
161 aa  120  8e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0282491 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0739  general secretion pathway protein G  47.62 
 
 
164 aa  119  9e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.430586  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1301  general secretion pathway protein G  53.28 
 
 
146 aa  119  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.010915 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2613  putative general secretion pathway protein G precursor (PilD-dependent protein pddA)  45.45 
 
 
163 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02970  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  47.06 
 
 
144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0455058  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1343  general secretion pathway protein G  50 
 
 
160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.657967  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0102  general secretion pathway protein G  48 
 
 
149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.573705  normal  0.0126574 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2091  general secretion pathway protein G  44.36 
 
 
152 aa  112  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0177627  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3007  general secretion pathway protein G  44.44 
 
 
155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.303532 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1432  type II secretion systen protein G  48.39 
 
 
209 aa  108  3e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.412586  normal  0.909605 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2792  general secretion pathway protein G  54.26 
 
 
141 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.533388  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3221  general secretion pathway protein G  46.67 
 
 
156 aa  105  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.287852 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1609  general secretion pathway protein G  48.67 
 
 
150 aa  105  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.784305  normal  0.423382 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2893  general secretion pathway protein G  55 
 
 
144 aa  104  4e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.21869  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18680  type II secretion system protein G  37.23 
 
 
143 aa  103  6e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1293  tyep II secretion system protein G  46.76 
 
 
179 aa  101  4e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.138374  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3423  general secretion pathway protein G  51.15 
 
 
169 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2339  general secretion pathway protein G  53.33 
 
 
141 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16150  General secretion pathway protein G  43.9 
 
 
145 aa  99.8  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.853983  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2517  general secretion pathway protein G  53.33 
 
 
141 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.514813  normal  0.111432 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1351  general secretion pathway protein G  45.59 
 
 
150 aa  98.2  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.346821  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28620  General secretion pathway protein G  51.22 
 
 
142 aa  97.8  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1973  general secretion pathway protein G  54.17 
 
 
142 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.432332  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2923  general secretion pathway protein G  43.65 
 
 
141 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.370501  normal  0.274003 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3044  general secretion pathway protein G  42.22 
 
 
159 aa  96.7  9e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.21279  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1278  general secretion pathway protein G  43.38 
 
 
147 aa  96.7  9e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3106  putative general secretion pathway G transmembrane protein  43.75 
 
 
156 aa  96.3  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.590033  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3391  general secretion pathway protein G  43.31 
 
 
156 aa  96.7  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3030  general secretion pathway protein G  42.52 
 
 
139 aa  95.5  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.187173  hitchhiker  0.00937307 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2372  general secretion pathway protein G  42.86 
 
 
144 aa  95.5  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.411005  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3384  general secretion pathway protein G  44.27 
 
 
154 aa  94.7  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1794  general secretion pathway protein G  48.82 
 
 
154 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.338951  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0592  general secretion pathway protein G  43.9 
 
 
147 aa  94  6e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3221  general secretion pathway protein G  44 
 
 
163 aa  92.8  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2778  general secretion pathway protein G  39.84 
 
 
149 aa  92.8  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1081  general secretion pathway protein G  42.74 
 
 
146 aa  92.8  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464773  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1413  general secretion pathway protein G  42.4 
 
 
144 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0288958  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2587  general secretion pathway protein G  39.39 
 
 
161 aa  91.7  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2391  general secretion pathway protein G  43.65 
 
 
144 aa  90.9  5e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000271033 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2032  general secretion pathway protein G  41.27 
 
 
142 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1032  general secretion pathway protein G  42.62 
 
 
153 aa  89.7  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4497  general secretion pathway protein G  42.19 
 
 
154 aa  90.1  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.13255 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24020  general secretion pathway protein G  41.27 
 
 
148 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3074  general secretion pathway protein G  42.19 
 
 
158 aa  89  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000016497 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3940  general secretion pathway protein G  41.41 
 
 
154 aa  89  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.18178 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0605  general secretion pathway protein G  43.22 
 
 
147 aa  88.2  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000021872 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1603  general secretion pathway protein G  43.24 
 
 
129 aa  88.2  4e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.31338 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1073  general secretion pathway protein G  42.28 
 
 
155 aa  88.2  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.56277  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0257  general secretion pathway protein G  39.67 
 
 
193 aa  87.8  5e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5689  general secretion pathway protein G  41.13 
 
 
158 aa  87.8  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128164  normal  0.128064 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0231  general secretion pathway protein G  42.06 
 
 
149 aa  87.4  6e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2421  general secretion pathway protein G  51.22 
 
 
142 aa  87.4  7e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1316  type II secretory pathway protein LspG  37.4 
 
 
140 aa  87  8e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1313  type II secretory pathway protein LspG  37.4 
 
 
140 aa  87  8e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3128  general secretion pathway protein G  41.13 
 
 
165 aa  87  8e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0729977 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02835  hypothetical type II secretion protein GspG  41.79 
 
 
151 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000370073  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3424  general secretion pathway protein G  41.79 
 
 
151 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3179  general secretion pathway protein G  43.33 
 
 
152 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.223664  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3409  general secretion pathway protein GspG  41.79 
 
 
151 aa  86.7  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0253  general secretion pathway protein G  39.02 
 
 
150 aa  86.3  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1898  general secretion pathway protein G  46.79 
 
 
167 aa  86.7  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3135  general secretion pathway protein G  41.79 
 
 
151 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0048  general secretion pathway protein G  40.48 
 
 
150 aa  86.3  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.503149  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0058  general secretion pathway protein G  40.48 
 
 
150 aa  86.3  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663302  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02785  hypothetical protein  41.79 
 
 
151 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000404727  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0534  general secretion pathway protein G  40.8 
 
 
147 aa  85.9  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3419  general secretion pathway protein G  41.13 
 
 
150 aa  85.5  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000422428 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3244  general secretion pathway protein GspG  40.3 
 
 
151 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.948956  normal  0.749494 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29510  putative type II secretion system protein  41.94 
 
 
144 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0059  general secretion pathway protein G  40.48 
 
 
150 aa  85.5  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2021  general secretion pathway protein G  47.58 
 
 
145 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.131235  normal  0.178843 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3564  general secretion pathway protein G  42.19 
 
 
144 aa  85.1  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0675  general secretion pathway protein G  37.6 
 
 
159 aa  84.7  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.186648  normal  0.343045 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0654  general secretion pathway protein G  37.6 
 
 
159 aa  84.7  4e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0121173  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3240  general secretion pathway protein G  39.68 
 
 
150 aa  84.7  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0077  general secretion pathway protein G  39.68 
 
 
150 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0012  general secretion pathway protein G  39.68 
 
 
150 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0058  general secretion pathway protein G  39.68 
 
 
150 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109015  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4829  HxcT pseudopilin  41.54 
 
 
149 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0144  general secretion pathway protein G  37.8 
 
 
166 aa  84.3  5e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2532  general secretion pathway protein G  42.86 
 
 
156 aa  84  6e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.211317  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0925  general secretion pathway protein G  39.52 
 
 
162 aa  84  6e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0172546  normal  0.856291 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2781  general secretion pathway protein G  39.84 
 
 
150 aa  84  7e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2666  general secretion pathway protein G  39.84 
 
 
150 aa  84  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0012  general secretion pathway protein G  39.84 
 
 
150 aa  84  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127302  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0011  general secretion pathway protein G  39.84 
 
 
150 aa  84  7e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1886  general secretion pathway protein G  39.84 
 
 
150 aa  84  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.354233  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>