175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1603 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1603  general secretion pathway protein G  100 
 
 
129 aa  264  4e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.31338 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1584  general secretion pathway protein G  44.17 
 
 
166 aa  92.8  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0906658 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2109  general secretion pathway protein G  41.86 
 
 
159 aa  89.4  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.117776  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1528  general secretion pathway protein G  43.24 
 
 
142 aa  88.2  4e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.951257  normal  0.430889 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1116  general secretion pathway protein G  40.5 
 
 
143 aa  85.9  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2590  general secretion pathway protein G  39.06 
 
 
154 aa  85.5  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0883  general secretion pathway protein G  39.29 
 
 
145 aa  84  7e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0102  general secretion pathway protein G  41.09 
 
 
149 aa  83.6  9e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.573705  normal  0.0126574 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1293  tyep II secretion system protein G  41.46 
 
 
179 aa  83.2  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.138374  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1973  general secretion pathway protein G  39.83 
 
 
142 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.432332  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2091  general secretion pathway protein G  36.72 
 
 
152 aa  83.2  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0177627  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2893  general secretion pathway protein G  40.68 
 
 
144 aa  82  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.21869  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18680  type II secretion system protein G  37.69 
 
 
143 aa  82  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1432  type II secretion systen protein G  39.84 
 
 
209 aa  81.3  0.000000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.412586  normal  0.909605 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4713  general secretion pathway protein G  39.06 
 
 
166 aa  79.7  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2613  putative general secretion pathway protein G precursor (PilD-dependent protein pddA)  37.5 
 
 
163 aa  80.1  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2857  general secretion pathway protein G  39.55 
 
 
157 aa  79.3  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2310  putative GSPG-related transmembrane protein  41.44 
 
 
155 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.164905  normal  0.125662 
 
 
-
 
NC_003296  RS00346  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  37.3 
 
 
144 aa  78.6  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.887338  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3007  general secretion pathway protein G  35.9 
 
 
155 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.303532 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0912  general secretion pathway protein G  37.61 
 
 
172 aa  79.3  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.429886 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3312  general secretion pathway protein G  39.68 
 
 
138 aa  79  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16150  General secretion pathway protein G  38.89 
 
 
145 aa  78.6  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.853983  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1343  general secretion pathway protein G  38.28 
 
 
160 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.657967  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1415  general secretion pathway protein G  39.55 
 
 
146 aa  78.6  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0727  general secretion pathway protein G  36 
 
 
137 aa  77.8  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.807557  normal  0.202757 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1794  general secretion pathway protein G  41.23 
 
 
154 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.338951  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3221  general secretion pathway protein G  35.94 
 
 
156 aa  77.4  0.00000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.287852 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1280  general secretion pathway protein G  37.61 
 
 
158 aa  77.4  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1007  general secretion pathway protein G  38.28 
 
 
145 aa  77  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0956  general secretion pathway protein G  38.28 
 
 
145 aa  77  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.194745  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3266  general secretion pathway protein G  38.28 
 
 
145 aa  77  0.00000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000062887  hitchhiker  0.00000000000000294917 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1609  general secretion pathway protein G  36.21 
 
 
150 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.784305  normal  0.423382 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0124  general secretion pathway protein G  38.17 
 
 
144 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2792  general secretion pathway protein G  37.29 
 
 
141 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.533388  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4588  general secretion pathway protein G  37.21 
 
 
143 aa  75.5  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1278  general secretion pathway protein G  36.36 
 
 
147 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0739  general secretion pathway protein G  37.29 
 
 
164 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.430586  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2372  general secretion pathway protein G  37.69 
 
 
144 aa  74.7  0.0000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.411005  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2923  general secretion pathway protein G  38.17 
 
 
141 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.370501  normal  0.274003 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2612  general secretion pathway protein G  34.38 
 
 
153 aa  73.6  0.0000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.688921 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3423  general secretion pathway protein G  35.59 
 
 
169 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0169  general secretion pathway protein G  36.64 
 
 
144 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1032  general secretion pathway protein G  35.04 
 
 
153 aa  73.2  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2339  general secretion pathway protein G  35.59 
 
 
141 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02835  hypothetical type II secretion protein GspG  38.06 
 
 
151 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000370073  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3409  general secretion pathway protein GspG  38.06 
 
 
151 aa  71.6  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3135  general secretion pathway protein G  38.06 
 
 
151 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3244  general secretion pathway protein GspG  38.06 
 
 
151 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.948956  normal  0.749494 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3424  general secretion pathway protein G  38.06 
 
 
151 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0159  general secretion pathway protein G  36.64 
 
 
144 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0154  general secretion pathway protein G  36.64 
 
 
144 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2391  general secretion pathway protein G  37.88 
 
 
144 aa  72  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000271033 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02785  hypothetical protein  38.06 
 
 
151 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000404727  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0154  general secretion pathway protein G  36.64 
 
 
144 aa  72  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0686  general secretion pathway protein G  43.88 
 
 
161 aa  72  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0282491 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3564  general secretion pathway protein G  36.64 
 
 
144 aa  72  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0592  general secretion pathway protein G  34.85 
 
 
147 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1073  general secretion pathway protein G  39.69 
 
 
155 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.56277  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2517  general secretion pathway protein G  35.59 
 
 
141 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.514813  normal  0.111432 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3616  general secretion pathway protein G  36.09 
 
 
144 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2032  general secretion pathway protein G  38.17 
 
 
142 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1301  general secretion pathway protein G  37.8 
 
 
146 aa  70.9  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.010915 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0144  general secretion pathway protein G  36.36 
 
 
166 aa  70.9  0.000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0147  general secretion pathway protein G  35.56 
 
 
144 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0231  general secretion pathway protein G  36.36 
 
 
149 aa  70.1  0.000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0925  general secretion pathway protein G  40 
 
 
162 aa  70.1  0.000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0172546  normal  0.856291 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0006  general secretion pathway protein G  37.4 
 
 
144 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0815216 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0156  general secretion pathway protein G  35.88 
 
 
144 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.051245 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24020  general secretion pathway protein G  37.4 
 
 
148 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0156  general secretion pathway protein G  35.88 
 
 
144 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0172  general secretion pathway protein G  35.61 
 
 
143 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4158  general secretion pathway protein G  37.8 
 
 
151 aa  69.7  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000753103 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4203  general secretion pathway protein G  35.88 
 
 
144 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0152  general secretion pathway protein G  35.88 
 
 
144 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3106  putative general secretion pathway G transmembrane protein  38.93 
 
 
156 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.590033  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_003296  RS02970  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  33.33 
 
 
144 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0455058  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3044  general secretion pathway protein G  37.4 
 
 
159 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.21279  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28620  General secretion pathway protein G  38.32 
 
 
142 aa  69.3  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4355  general secretion pathway protein G  34.59 
 
 
144 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0100  general secretion pathway protein G  37.12 
 
 
144 aa  68.9  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3074  general secretion pathway protein G  38.81 
 
 
158 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000016497 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1302  general secretion pathway protein G  36.92 
 
 
153 aa  68.6  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3391  general secretion pathway protein G  37.4 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1413  general secretion pathway protein G  35.61 
 
 
144 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0288958  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2421  general secretion pathway protein G  39.25 
 
 
142 aa  68.2  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4497  general secretion pathway protein G  38.06 
 
 
154 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.13255 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4731  general secretion pathway protein G  35.66 
 
 
144 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0599807  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2781  general secretion pathway protein G  38.17 
 
 
150 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0224  general secretion pathway protein G  38.17 
 
 
150 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5689  general secretion pathway protein G  40 
 
 
158 aa  68.2  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128164  normal  0.128064 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0011  general secretion pathway protein G  38.17 
 
 
150 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3514  general secretion pathway protein G  38.17 
 
 
150 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.957184  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1886  general secretion pathway protein G  38.17 
 
 
150 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.354233  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0012  general secretion pathway protein G  38.17 
 
 
150 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0012  general secretion pathway protein G  38.17 
 
 
150 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127302  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2666  general secretion pathway protein G  38.17 
 
 
150 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1473  general secretion pathway protein G  35.88 
 
 
150 aa  67.8  0.00000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.660645  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0048  general secretion pathway protein G  37.4 
 
 
150 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.503149  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0058  general secretion pathway protein G  37.4 
 
 
150 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663302  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>