258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3149 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_3149  general secretion pathway protein G  100 
 
 
143 aa  292  8e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.907974  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3315  general secretion pathway protein G  99.3 
 
 
143 aa  292  1e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.82991  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2181  general secretion pathway protein G  79.29 
 
 
140 aa  224  3e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.934911  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2590  general secretion pathway protein G  43.28 
 
 
154 aa  119  9.999999999999999e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4713  general secretion pathway protein G  42.31 
 
 
166 aa  114  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2310  putative GSPG-related transmembrane protein  41.61 
 
 
155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.164905  normal  0.125662 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02678  general secretion pathway protein G  47.79 
 
 
143 aa  110  5e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3221  general secretion pathway protein G  41.67 
 
 
156 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.287852 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1343  general secretion pathway protein G  38.12 
 
 
160 aa  108  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.657967  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1432  type II secretion systen protein G  41.67 
 
 
209 aa  107  5e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.412586  normal  0.909605 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0548  general secretion pathway protein G  44.44 
 
 
147 aa  107  8.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0374769 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1116  general secretion pathway protein G  39.42 
 
 
143 aa  103  6e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0858  general secretory pathway protein G precursor  49.61 
 
 
144 aa  103  8e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.653891  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00346  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  41.5 
 
 
144 aa  103  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.887338  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0912  general secretion pathway protein G  40.29 
 
 
172 aa  102  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.429886 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16150  General secretion pathway protein G  42.22 
 
 
145 aa  102  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.853983  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0771  general secretion pathway protein G  48.82 
 
 
144 aa  102  2e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0102  general secretion pathway protein G  39.29 
 
 
149 aa  102  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.573705  normal  0.0126574 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2612  general secretion pathway protein G  39.86 
 
 
153 aa  102  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.688921 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1280  general secretion pathway protein G  39.57 
 
 
158 aa  100  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1032  general secretion pathway protein G  39.04 
 
 
153 aa  100  6e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1316  type II secretory pathway protein LspG  41.3 
 
 
140 aa  99.8  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1313  type II secretory pathway protein LspG  41.3 
 
 
140 aa  99.8  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0144  general secretion pathway protein G  40.15 
 
 
166 aa  99.4  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3384  general secretion pathway protein G  39.31 
 
 
154 aa  99.8  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2923  general secretion pathway protein G  40 
 
 
141 aa  99  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.370501  normal  0.274003 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3106  putative general secretion pathway G transmembrane protein  40.3 
 
 
156 aa  97.8  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.590033  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1073  general secretion pathway protein G  38 
 
 
155 aa  97.8  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.56277  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2109  general secretion pathway protein G  37.31 
 
 
159 aa  97.8  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.117776  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2532  general secretion pathway protein G  38.36 
 
 
156 aa  97.4  5e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.211317  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3044  general secretion pathway protein G  39.29 
 
 
159 aa  97.4  6e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.21279  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1413  general secretion pathway protein G  39.46 
 
 
144 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0288958  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1293  tyep II secretion system protein G  43.85 
 
 
179 aa  96.3  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.138374  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0231  general secretion pathway protein G  36.96 
 
 
149 aa  96.7  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2372  general secretion pathway protein G  38.89 
 
 
144 aa  95.9  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.411005  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0739  general secretion pathway protein G  35.86 
 
 
164 aa  95.5  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.430586  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2391  general secretion pathway protein G  37.96 
 
 
144 aa  95.1  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000271033 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3391  general secretion pathway protein G  39.55 
 
 
156 aa  95.1  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4158  general secretion pathway protein G  38.03 
 
 
151 aa  95.1  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000753103 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4829  HxcT pseudopilin  38.69 
 
 
149 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55490  HxcT pseudopilin  38.69 
 
 
149 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.04599 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1046  general secretion pathway protein G  40.44 
 
 
144 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3940  general secretion pathway protein G  37.86 
 
 
154 aa  94.4  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.18178 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4497  general secretion pathway protein G  38.85 
 
 
154 aa  94.4  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.13255 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2303  general secretion pathway protein G  40.43 
 
 
146 aa  94  6e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2032  general secretion pathway protein G  40.29 
 
 
142 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02970  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  33.33 
 
 
144 aa  93.2  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0455058  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3244  general secretion pathway protein GspG  40.54 
 
 
151 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.948956  normal  0.749494 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3179  general secretion pathway protein G  37.78 
 
 
152 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.223664  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3074  general secretion pathway protein G  37.86 
 
 
158 aa  93.2  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000016497 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2778  general secretion pathway protein G  39.16 
 
 
149 aa  92.8  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02835  hypothetical type II secretion protein GspG  39.19 
 
 
151 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000370073  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2921  general secretion pathway protein G  37.96 
 
 
149 aa  92  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3221  general secretion pathway protein G  37.31 
 
 
163 aa  92  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02785  hypothetical protein  39.19 
 
 
151 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000404727  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3424  general secretion pathway protein G  39.19 
 
 
151 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3135  general secretion pathway protein G  39.19 
 
 
151 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3409  general secretion pathway protein GspG  39.19 
 
 
151 aa  92  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1090  general secretion pathway protein G  39.71 
 
 
144 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319049  normal  0.327028 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1973  general secretion pathway protein G  40.14 
 
 
142 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.432332  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24020  general secretion pathway protein G  37.84 
 
 
148 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00604  general secretion pathway protein G  39.58 
 
 
146 aa  91.7  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1049  general secretion pathway protein G  39.71 
 
 
151 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3240  general secretion pathway protein G  34.9 
 
 
150 aa  91.3  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0592  general secretion pathway protein G  37.76 
 
 
147 aa  90.9  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001889  general secretion pathway protein G  38.67 
 
 
147 aa  90.9  5e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4177  general secretion pathway protein G  38.69 
 
 
144 aa  90.5  6e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.250819  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3007  general secretion pathway protein G  36.92 
 
 
155 aa  90.5  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.303532 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1351  general secretion pathway protein G  34.01 
 
 
150 aa  90.1  9e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.346821  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0058  general secretion pathway protein G  34.23 
 
 
150 aa  89.7  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663302  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0077  general secretion pathway protein G  34.23 
 
 
150 aa  89.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0012  general secretion pathway protein G  34.23 
 
 
150 aa  89.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0048  general secretion pathway protein G  34.23 
 
 
150 aa  89.7  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.503149  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0058  general secretion pathway protein G  34.23 
 
 
150 aa  89.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109015  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0059  general secretion pathway protein G  34.23 
 
 
150 aa  89  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18680  type II secretion system protein G  35 
 
 
143 aa  89  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2587  general secretion pathway protein G  35.92 
 
 
161 aa  88.2  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3419  general secretion pathway protein G  37.67 
 
 
150 aa  88.6  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000422428 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1321  general secretion pathway protein G  34.23 
 
 
158 aa  87.8  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2091  general secretion pathway protein G  34.48 
 
 
152 aa  87  8e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0177627  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1081  general secretion pathway protein G  36.03 
 
 
146 aa  86.7  9e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464773  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5689  general secretion pathway protein G  34.21 
 
 
158 aa  86.3  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128164  normal  0.128064 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1301  general secretion pathway protein G  31.94 
 
 
146 aa  85.9  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.010915 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2613  putative general secretion pathway protein G precursor (PilD-dependent protein pddA)  33.33 
 
 
163 aa  84.7  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0654  general secretion pathway protein G  34.75 
 
 
159 aa  84  6e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0121173  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0675  general secretion pathway protein G  34.75 
 
 
159 aa  84  6e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.186648  normal  0.343045 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0534  general secretion pathway protein G  35.71 
 
 
147 aa  84  7e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1278  general secretion pathway protein G  35.92 
 
 
147 aa  83.6  9e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0925  general secretion pathway protein G  34.33 
 
 
162 aa  83.6  9e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0172546  normal  0.856291 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3030  general secretion pathway protein G  36.15 
 
 
139 aa  82  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.187173  hitchhiker  0.00937307 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0012  general secretion pathway protein G  34.07 
 
 
150 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127302  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2781  general secretion pathway protein G  34.07 
 
 
150 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3514  general secretion pathway protein G  34.07 
 
 
150 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.957184  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0224  general secretion pathway protein G  34.07 
 
 
150 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28620  General secretion pathway protein G  38.97 
 
 
142 aa  82.4  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2666  general secretion pathway protein G  34.07 
 
 
150 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1528  general secretion pathway protein G  40.46 
 
 
142 aa  82.8  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.951257  normal  0.430889 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0011  general secretion pathway protein G  34.07 
 
 
150 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1886  general secretion pathway protein G  34.07 
 
 
150 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.354233  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0012  general secretion pathway protein G  34.07 
 
 
150 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>