More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2581 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2581  N-terminal methylation site  100 
 
 
138 aa  283  8e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1441  type II secretion system protein G  67.23 
 
 
129 aa  165  2e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000189967  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29080  general secretion pathway protein G  64.17 
 
 
124 aa  162  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2412  methylation  64.71 
 
 
126 aa  159  1e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2470  type II secretion system protein G  61.34 
 
 
124 aa  157  7e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.335351  normal  0.427711 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3476  type II secretion system protein G  60.5 
 
 
128 aa  154  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0390478  normal  0.854758 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2295  type II secretion system protein G  60.5 
 
 
124 aa  154  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.478951  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2461  type II secretion system protein G  59.66 
 
 
124 aa  153  8e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.508549  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1302  type II secretion system protein  62.5 
 
 
124 aa  149  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0879623  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1334  methylation  58.33 
 
 
133 aa  149  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.372792  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1989  hypothetical protein  56.67 
 
 
124 aa  148  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0788365  normal  0.18788 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3218  general secretion pathway protein G  55.37 
 
 
126 aa  147  5e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.427151 
 
 
-
 
NC_003296  RS00348  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  56.78 
 
 
128 aa  144  5e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3886  type II secretion system protein G  56.3 
 
 
122 aa  140  5e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02979  putative general secretion pathway GSPG related transmembrane protein  55.46 
 
 
129 aa  137  3.9999999999999997e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.811632  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2301  putative GSPG-related protein  58.82 
 
 
130 aa  127  4.0000000000000003e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.152629  normal  0.0321295 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2997  type II secretion system protein G  49.6 
 
 
135 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000413298 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1931  type II secretion system protein G  47.2 
 
 
138 aa  122  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000053439  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4704  Type II secretion system protein G  52.63 
 
 
145 aa  121  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0140964  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2621  type II secretion system protein G  56.86 
 
 
184 aa  119  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1440  type II secretion system protein G  47.24 
 
 
131 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0197781  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1460  type II secretion system protein G  39.86 
 
 
153 aa  117  7e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52288  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3311  fimbrial protein pilin  46.4 
 
 
137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1857  N-terminal methylation  42.97 
 
 
140 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0138  putative pilus assembly protein  44 
 
 
149 aa  110  6e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1286  type II secretion system protein G  50.4 
 
 
135 aa  110  6e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2413  type II secretion system protein G  39.86 
 
 
149 aa  103  6e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330838  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1999  general secretion pathway protein G  43.55 
 
 
131 aa  103  8e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607295  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1776  pilin domain-containing protein  41.32 
 
 
121 aa  99.4  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4795  putative general (Type II) secretion pathway protein  38.58 
 
 
223 aa  90.1  9e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.954024  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1998  general secretion pathway protein G  36.88 
 
 
140 aa  73.2  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484444  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1678  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  31.68 
 
 
163 aa  72  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00349  putative general secretion pathway GSPG-related transmembrane protein  35.53 
 
 
158 aa  70.1  0.000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2582  N-terminal methylation site  34.64 
 
 
170 aa  66.6  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2612  general secretion pathway protein G  36.3 
 
 
153 aa  65.1  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.688921 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3885  hypothetical protein  30.43 
 
 
161 aa  62.8  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3217  N-terminal methylation site  32.89 
 
 
159 aa  62.4  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.280155 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1930  hypothetical protein  32.05 
 
 
164 aa  62.4  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000900532  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2590  general secretion pathway protein G  33.08 
 
 
154 aa  61.6  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02978  putative general secretion pathway GSPG related transmembrane protein  31.36 
 
 
172 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.671308  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.26 
 
 
157 aa  61.6  0.000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1442  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  47.69 
 
 
155 aa  61.2  0.000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.102563  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  33.65 
 
 
142 aa  60.5  0.000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1777  hypothetical protein  32.26 
 
 
177 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00171207  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1301  type II secretion system protein  31.37 
 
 
168 aa  59.7  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.12689  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2620  putative general secretion pathway GspG related transmembrane protein  33.12 
 
 
159 aa  60.1  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1280  general secretion pathway protein G  33.59 
 
 
158 aa  59.7  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0802  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.94 
 
 
152 aa  59.7  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.964553  normal  0.826959 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4713  general secretion pathway protein G  44.26 
 
 
166 aa  60.1  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29090  general secretion pathway protein G  31.79 
 
 
160 aa  58.9  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.260708  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3030  general secretion pathway protein G  36.78 
 
 
139 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.187173  hitchhiker  0.00937307 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  33.65 
 
 
142 aa  59.3  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1432  type II secretion systen protein G  39.56 
 
 
209 aa  58.9  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.412586  normal  0.909605 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0567  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.54 
 
 
147 aa  58.2  0.00000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0687  hypothetical protein  32.04 
 
 
138 aa  58.2  0.00000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.753224  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1507  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36 
 
 
121 aa  58.2  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000010883  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00346  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  44.07 
 
 
144 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.887338  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0137  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  33.54 
 
 
161 aa  57.8  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1097  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.62 
 
 
151 aa  57.8  0.00000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.282151  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2310  putative GSPG-related transmembrane protein  33.33 
 
 
155 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.164905  normal  0.125662 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1316  type II secretory pathway protein LspG  31.18 
 
 
140 aa  57.4  0.00000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1313  type II secretory pathway protein LspG  31.18 
 
 
140 aa  57.4  0.00000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1988  hypothetical protein  30.46 
 
 
157 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0923651  normal  0.190547 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1858  N-terminal methylation  29.81 
 
 
161 aa  57.4  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.450176 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2302  GSPG-like signal peptide protein  31.37 
 
 
172 aa  57  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.186261  normal  0.0333639 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2613  putative general secretion pathway protein G precursor (PilD-dependent protein pddA)  33.59 
 
 
163 aa  57  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0668  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.62 
 
 
155 aa  57  0.00000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000136734 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3221  general secretion pathway protein G  35.79 
 
 
156 aa  56.6  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.287852 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1440  type II secretion system transmembrane protein  28.57 
 
 
158 aa  56.2  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00799419  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1018  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.62 
 
 
161 aa  56.2  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1343  general secretion pathway protein G  36.26 
 
 
160 aa  56.2  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.657967  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2413  methylation  30.72 
 
 
157 aa  56.6  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2663  type IV pilus biogenesis protein PilE  42.42 
 
 
142 aa  56.6  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2109  general secretion pathway protein G  31.06 
 
 
159 aa  56.2  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.117776  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02970  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  36.26 
 
 
144 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0455058  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0682  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.94 
 
 
165 aa  56.2  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0723462  hitchhiker  0.000000000174273 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0216  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.98 
 
 
163 aa  55.8  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0379234 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18680  type II secretion system protein G  28.03 
 
 
143 aa  55.8  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0739  general secretion pathway protein G  31.3 
 
 
164 aa  55.1  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.430586  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.08 
 
 
169 aa  54.7  0.0000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3007  general secretion pathway protein G  29.55 
 
 
155 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.303532 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2778  general secretion pathway protein G  43.66 
 
 
149 aa  54.7  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2680  type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  33.01 
 
 
146 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0580057 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1261  hypothetical protein  43.08 
 
 
168 aa  54.7  0.0000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16150  General secretion pathway protein G  38.98 
 
 
145 aa  54.3  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.853983  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1439  general secretion pathway GspG related transmembrane protein  34.21 
 
 
160 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0119159  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  44.83 
 
 
152 aa  53.9  0.0000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1024  hypothetical protein  31.34 
 
 
162 aa  53.5  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0571  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.65 
 
 
163 aa  53.5  0.0000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1999  fimbrial protein  38.1 
 
 
153 aa  52.8  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0349  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.08 
 
 
179 aa  53.5  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875622  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0926  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  41.07 
 
 
171 aa  52.8  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000619994  hitchhiker  8.71814e-18 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03468  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  33.73 
 
 
141 aa  53.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.68 
 
 
168 aa  52.4  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0331  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.08 
 
 
172 aa  52.4  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0265  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.62 
 
 
166 aa  52.4  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.319115  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0617  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.78 
 
 
158 aa  52.4  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.217435 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1383  type IV pilin PilE  38.98 
 
 
135 aa  52  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.140998  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0816  type IV pilus biogenesis protein  28.32 
 
 
133 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0720  fimbrial protein pilin  37.93 
 
 
133 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>