More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0260 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0260  pilin polypeptide  100 
 
 		 187 aa  380  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0263  pilin polypeptide  41.72 
 
 		 178 aa  122  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2522  pilin  52.8 
 
 		 176 aa  107  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3584  fimbrial protein PilA  52.8 
 
 		 176 aa  107  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.194411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0345  general secretion pathway protein H  41.61 
 
 		 176 aa  100  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177644  normal  0.0749297 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0960  hypothetical protein  60.87 
 
 		 186 aa  97.4  9e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0933  hypothetical protein  60.87 
 
 		 186 aa  97.4  9e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0936  general secretion pathway protein  33.55 
 
 		 155 aa  84.3  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.898049 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0926  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  42.11 
 
 		 171 aa  68.6  0.00000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000619994  hitchhiker  8.71814e-18 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.52 
 
 		 168 aa  68.2  0.00000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0938  type 4 prepilin-like protein  57.69 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.141756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0937  type 4 prepilin-like protein  57.69 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.880072 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  63.16 
 
 		 152 aa  68.2  0.00000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0093  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.52 
 
 		 169 aa  67.4  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0563183 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1488  hypothetical protein  56.9 
 
 		 158 aa  65.9  0.0000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.109192  normal  0.403243 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1487  fimbrial protein EcpC precursor  44.44 
 
 		 164 aa  65.5  0.0000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0651614  normal  0.606044 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0048  pilin polypeptide PilA-like  37.63 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.335089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0567  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  47.37 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0049  pilin polypeptide PilA-like  37.63 
 
 		 144 aa  63.9  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0965276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0392  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  53.23 
 
 		 175 aa  64.3  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000336485  hitchhiker  0.0000000727713 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1097  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  33.13 
 
 		 151 aa  64.3  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.282151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0349  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  50.68 
 
 		 179 aa  63.5  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0449  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  58.93 
 
 		 167 aa  63.5  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000146857  hitchhiker  0.0000000193676 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1442  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  49.33 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.102563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0376  hypothetical protein  30.28 
 
 		 174 aa  62  0.000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000272235  hitchhiker  0.0000000000782624 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4066  general secretion pathway protein H  33.33 
 
 		 179 aa  62  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0613  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  61.11 
 
 		 165 aa  62  0.000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0934015 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0802  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  53.33 
 
 		 152 aa  61.6  0.000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.964553  normal  0.826959 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  47.27 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0345  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.23 
 
 		 156 aa  61.2  0.000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0651  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  49.3 
 
 		 165 aa  61.2  0.000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1436  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  47.95 
 
 		 171 aa  60.8  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1096  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.37 
 
 		 157 aa  60.8  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.292656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0682  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  47.06 
 
 		 165 aa  60.5  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0723462  hitchhiker  0.000000000174273 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2532  general secretion pathway protein G  28.79 
 
 		 156 aa  60.8  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.211317  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0331  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  55.56 
 
 		 172 aa  60.5  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0265  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  57.14 
 
 		 166 aa  60.5  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.319115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3221  general secretion pathway protein G  40.98 
 
 		 163 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1387  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.25 
 
 		 175 aa  60.1  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0779  hypothetical protein  54.39 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0059  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  55 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.230525 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  43.64 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3044  general secretion pathway protein G  35.14 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.21279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20881  pilin  37.33 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0558  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  31.87 
 
 		 168 aa  58.9  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3168  prepilin-type cleavage/methylation  39.47 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5689  general secretion pathway protein G  41.89 
 
 		 158 aa  58.9  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128164  normal  0.128064 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0482  general secretion pathway protein G  48.61 
 
 		 171 aa  58.9  0.00000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00144077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07011  hypothetical protein  40.28 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.212398  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3549  type 4 prepilin-like protein  43.06 
 
 		 177 aa  58.9  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5198  fimbrial protein pilin  37.84 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1018  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  49.3 
 
 		 161 aa  58.5  0.00000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2564  hypothetical protein  43.06 
 
 		 177 aa  58.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.569226 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3550  Tfp pilus assembly protein PilE  41.07 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.844187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0675  general secretion pathway protein G  40.91 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.186648  normal  0.343045 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0617  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  57.41 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.217435 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1495  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  52.31 
 
 		 167 aa  58.2  0.00000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.70798  normal  0.112729 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1548  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  52.63 
 
 		 167 aa  58.2  0.00000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  hitchhiker  0.00000000000000294624 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0654  general secretion pathway protein G  40.91 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0121173  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  50 
 
 		 157 aa  57.8  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1081  general secretion pathway protein G  38.81 
 
 		 146 aa  57.4  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464773  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17770  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain-containing protein  55.77 
 
 		 135 aa  57.4  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.775526 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0100  general secretion pathway protein G  38.71 
 
 		 144 aa  57.4  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1302  general secretion pathway protein G  29.84 
 
 		 153 aa  57.4  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1524  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  55.56 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000584644  unclonable  2.6975300000000003e-19 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1201  Tfp pilus assembly protein PilE-like  44.62 
 
 		 189 aa  57  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0216  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  53.7 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0379234 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0274  general secretion pathway protein H  50.79 
 
 		 174 aa  56.2  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.560285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1383  type IV pilin PilE  35.64 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.140998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1024  hypothetical protein  35 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0096  hypothetical protein  40.59 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.062594 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0807  hypothetical protein  68.18 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000505152 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0340  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  50.85 
 
 		 165 aa  57  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2372  general secretion pathway protein G  29.55 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.411005  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02835  hypothetical type II secretion protein GspG  30.6 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000370073  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  49.3 
 
 		 169 aa  56.2  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0204  type IV pilus assembly protein PilE  49.3 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3424  general secretion pathway protein G  30.6 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0606  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  51.67 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000101189  hitchhiker  0.000000768083 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3128  general secretion pathway protein G  39.34 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0729977 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  52.73 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0571  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  73.68 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0612  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  51.72 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02785  hypothetical protein  30.6 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000404727  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0231  general secretion pathway protein G  41.82 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1058  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  57.41 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.110537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3135  general secretion pathway protein G  30.6 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3409  general secretion pathway protein GspG  30.6 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1161  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.82 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0253  general secretion pathway protein G  38.81 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3384  general secretion pathway protein G  36.67 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0108  general secretion pathway protein G  36.36 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4829  HxcT pseudopilin  37.29 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0169  general secretion pathway protein G  38.1 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0668  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  32.28 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000136734 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0159  general secretion pathway protein G  38.1 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0154  general secretion pathway protein G  38.1 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2391  general secretion pathway protein G  34.18 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000271033 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1473  general secretion pathway protein G  29.84 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.660645  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3179  general secretion pathway protein G  37.93 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.223664  normal  0.0220476 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>