More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0937 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_0937  type 4 prepilin-like protein  100 
 
 		 153 aa  307  2.9999999999999997e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.880072 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0938  type 4 prepilin-like protein  96.73 
 
 		 153 aa  238  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.141756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0936  general secretion pathway protein  44.08 
 
 		 155 aa  115  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.898049 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0345  general secretion pathway protein H  61.11 
 
 		 176 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177644  normal  0.0749297 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3584  fimbrial protein PilA  50.94 
 
 		 176 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.194411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2522  pilin  50.94 
 
 		 176 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0960  hypothetical protein  52.25 
 
 		 186 aa  103  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0933  hypothetical protein  52.25 
 
 		 186 aa  103  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0260  pilin polypeptide  57.69 
 
 		 187 aa  92.8  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4066  general secretion pathway protein H  60.67 
 
 		 179 aa  89  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0263  pilin polypeptide  50 
 
 		 178 aa  85.5  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2388  PHA accumulation regulator DNA-binding-like  43.68 
 
 		 180 aa  76.3  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.252746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0049  pilin polypeptide PilA-like  39.39 
 
 		 144 aa  70.5  0.000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0965276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0567  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  46.75 
 
 		 147 aa  69.3  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0800  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.44 
 
 		 167 aa  69.3  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.346386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0048  pilin polypeptide PilA-like  40.21 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.335089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0802  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  46.34 
 
 		 152 aa  68.2  0.00000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.964553  normal  0.826959 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3168  prepilin-type cleavage/methylation  37.29 
 
 		 130 aa  68.2  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0617  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  47.73 
 
 		 158 aa  67.4  0.00000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.217435 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0210  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  47.37 
 
 		 154 aa  65.9  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103934  normal  0.61486 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0449  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.68 
 
 		 167 aa  65.5  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000146857  hitchhiker  0.0000000193676 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0331  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  53.52 
 
 		 172 aa  66.2  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0340  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  46.67 
 
 		 165 aa  65.5  0.0000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1387  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  46.43 
 
 		 175 aa  65.1  0.0000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0682  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.89 
 
 		 165 aa  64.7  0.0000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0723462  hitchhiker  0.000000000174273 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1371  hypothetical protein  46.48 
 
 		 174 aa  64.7  0.0000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1161  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.43 
 
 		 157 aa  63.5  0.0000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  47.22 
 
 		 163 aa  63.5  0.0000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.253002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3391  general secretion pathway protein G  35.44 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0612  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45.21 
 
 		 161 aa  63.2  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1199  hypothetical protein  36.59 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.789092  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0392  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  46.97 
 
 		 175 aa  62.8  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000336485  hitchhiker  0.0000000727713 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3044  general secretion pathway protein G  34.57 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.21279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1018  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  48.53 
 
 		 161 aa  62.8  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0651  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  53.52 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4969  general secretion pathway protein H  28.68 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0015  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  50 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.170754  normal  0.192574 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0265  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  50 
 
 		 166 aa  62.4  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.319115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0204  type IV pilus assembly protein PilE  42.31 
 
 		 155 aa  62  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3031  methylation site containing protein  44.44 
 
 		 133 aa  62  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3549  type 4 prepilin-like protein  37.36 
 
 		 177 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0571  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.8 
 
 		 163 aa  61.6  0.000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0231  general secretion pathway protein G  43.08 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2564  hypothetical protein  37.36 
 
 		 177 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.569226 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3384  general secretion pathway protein G  35.53 
 
 		 154 aa  60.8  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0613  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  53.57 
 
 		 165 aa  60.8  0.000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0934015 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3221  general secretion pathway protein G  35.29 
 
 		 163 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1548  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.46 
 
 		 167 aa  60.5  0.000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  hitchhiker  0.00000000000000294624 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0765  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  34.13 
 
 		 170 aa  60.5  0.000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000473938  hitchhiker  1.49827e-16 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0376  hypothetical protein  44.44 
 
 		 174 aa  60.5  0.000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000272235  hitchhiker  0.0000000000782624 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2916  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  42.25 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2680  type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  39.44 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0580057 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0253  general secretion pathway protein G  42.62 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1107  methylation site containing protein  37.72 
 
 		 130 aa  60.1  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.963603 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3128  methylation site containing protein  40.54 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.932633 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1436  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.71 
 
 		 171 aa  60.1  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1421  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  49.32 
 
 		 172 aa  59.3  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0534  general secretion pathway protein G  40.62 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1321  general secretion pathway protein G  39.06 
 
 		 158 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0093  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  46.27 
 
 		 169 aa  59.7  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0563183 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2923  general secretion pathway protein G  41.94 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.370501  normal  0.274003 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2949  methylation site containing protein  41.89 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0811797  normal  0.399462 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2882  methylation site containing protein  33.58 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0345  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.11 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2372  general secretion pathway protein G  39.06 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.411005  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3128  general secretion pathway protein G  40.3 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0729977 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0059  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45.45 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.230525 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0606  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.59 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000101189  hitchhiker  0.000000768083 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17770  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain-containing protein  58.7 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.775526 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20881  pilin  33.75 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45.45 
 
 		 168 aa  58.2  0.00000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3419  general secretion pathway protein G  32.97 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000422428 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5689  general secretion pathway protein G  44.07 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128164  normal  0.128064 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  47.83 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2391  general secretion pathway protein G  39.68 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000271033 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0668  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.63 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000136734 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3106  putative general secretion pathway G transmembrane protein  41.38 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.590033  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3179  general secretion pathway protein G  36.62 
 
 		 152 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.223664  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0349  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  48.57 
 
 		 179 aa  58.2  0.00000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1096  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  47.62 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.292656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0675  general secretion pathway protein G  40 
 
 		 159 aa  57.4  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.186648  normal  0.343045 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0654  general secretion pathway protein G  40 
 
 		 159 aa  57.4  0.00000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0121173  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1067  methylation site containing protein  43.48 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0558  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  40.96 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0096  hypothetical protein  44.44 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.062594 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0144  general secretion pathway protein G  42.37 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0898  hypothetical protein  34.62 
 
 		 115 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.725433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4497  general secretion pathway protein G  38.03 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.13255 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45.21 
 
 		 169 aa  56.6  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0788  putative pilus assembly protein major pilin PilA  45.33 
 
 		 79 aa  56.6  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0173637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1261  hypothetical protein  43.66 
 
 		 168 aa  57  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1442  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  48.53 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.102563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07011  hypothetical protein  40 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.212398  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1202  type IV pilus biogenesis protein PilE  38.57 
 
 		 130 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1413  general secretion pathway protein G  30.09 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0288958  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3240  general secretion pathway protein G  36.49 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0058  general secretion pathway protein G  36.49 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0012  general secretion pathway protein G  36.49 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.11 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0925  general secretion pathway protein G  43.1 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0172546  normal  0.856291 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>