More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2388 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_2388  PHA accumulation regulator DNA-binding-like  100 
 
 		 180 aa  358  3e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.252746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0345  general secretion pathway protein H  48.78 
 
 		 176 aa  131  5e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177644  normal  0.0749297 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4066  general secretion pathway protein H  51.93 
 
 		 179 aa  113  2.0000000000000002e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0960  hypothetical protein  38.55 
 
 		 186 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0933  hypothetical protein  38.55 
 
 		 186 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2522  pilin  50.59 
 
 		 176 aa  101  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3584  fimbrial protein PilA  50.59 
 
 		 176 aa  101  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.194411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4969  general secretion pathway protein H  41.09 
 
 		 144 aa  98.6  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0260  pilin polypeptide  54.05 
 
 		 187 aa  81.3  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0938  type 4 prepilin-like protein  56.98 
 
 		 153 aa  78.6  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.141756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1199  hypothetical protein  41.84 
 
 		 221 aa  79  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.789092  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0937  type 4 prepilin-like protein  55.43 
 
 		 153 aa  78.6  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.880072 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0263  pilin polypeptide  46.25 
 
 		 178 aa  78.6  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20881  pilin  51.52 
 
 		 159 aa  76.3  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0936  general secretion pathway protein  36 
 
 		 155 aa  74.7  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.898049 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07011  hypothetical protein  46.25 
 
 		 208 aa  74.7  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.212398  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4063  general secretion pathway protein H  55.07 
 
 		 75 aa  72.4  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0049  pilin polypeptide PilA-like  38.1 
 
 		 144 aa  70.9  0.000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0965276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0617  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.78 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.217435 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60320  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  36.27 
 
 		 141 aa  68.6  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000362369 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17770  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain-containing protein  48.72 
 
 		 135 aa  68.6  0.00000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.775526 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0048  pilin polypeptide PilA-like  46.97 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.335089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0567  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  35.92 
 
 		 147 aa  67  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4155  fimbiral protein PilA  49.12 
 
 		 188 aa  67.4  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.614605  normal  0.158719 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1201  Tfp pilus assembly protein PilE-like  43.06 
 
 		 189 aa  67  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  34.78 
 
 		 157 aa  65.9  0.0000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0802  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.78 
 
 		 152 aa  65.5  0.0000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.964553  normal  0.826959 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3391  general secretion pathway protein G  35 
 
 		 156 aa  65.1  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0571  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  35.34 
 
 		 163 aa  64.7  0.0000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20891  pilin  43.06 
 
 		 170 aa  64.7  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0253  general secretion pathway protein G  41.25 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.34 
 
 		 168 aa  63.5  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0093  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.78 
 
 		 169 aa  64.3  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0563183 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1548  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.46 
 
 		 167 aa  64.3  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  hitchhiker  0.00000000000000294624 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5196  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  35.37 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2904  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  33.33 
 
 		 168 aa  63.2  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.3004 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3044  general secretion pathway protein G  34.94 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.21279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0376  hypothetical protein  44.12 
 
 		 174 aa  62.4  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000272235  hitchhiker  0.0000000000782624 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3128  methylation site containing protein  38.16 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.932633 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0675  general secretion pathway protein G  37.5 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.186648  normal  0.343045 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  44.62 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1107  methylation site containing protein  32.98 
 
 		 130 aa  61.6  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.963603 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0392  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45.9 
 
 		 175 aa  61.6  0.000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000336485  hitchhiker  0.0000000727713 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1442  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  33.33 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.102563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0842  hypothetical protein  46.55 
 
 		 193 aa  60.8  0.000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1097  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.79 
 
 		 151 aa  60.5  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.282151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3384  general secretion pathway protein G  34.33 
 
 		 154 aa  60.5  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3031  methylation site containing protein  38.36 
 
 		 133 aa  60.8  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2886  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  31.96 
 
 		 170 aa  60.5  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.308484  normal  0.94282 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0613  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  52.83 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0934015 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1383  type IV pilin PilE  37.88 
 
 		 135 aa  60.5  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.140998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3179  general secretion pathway protein G  38.1 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.223664  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1387  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  33.33 
 
 		 175 aa  60.1  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0449  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  35.14 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000146857  hitchhiker  0.0000000193676 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  41.54 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0612  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45.33 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2664  methylation  34.78 
 
 		 160 aa  59.3  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3940  general secretion pathway protein G  35.82 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.18178 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1096  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  51.72 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.292656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1018  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  33.98 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0682  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.03 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0723462  hitchhiker  0.000000000174273 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0654  general secretion pathway protein G  36.11 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0121173  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4497  general secretion pathway protein G  35.82 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.13255 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3074  general secretion pathway protein G  37.5 
 
 		 158 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016497 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1722  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  36 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1024  hypothetical protein  38.89 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5180  fimbrial protein pilin  36.99 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0088813  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1202  type IV pilus biogenesis protein PilE  37.5 
 
 		 130 aa  58.5  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4829  HxcT pseudopilin  34.92 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0210  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  31.25 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103934  normal  0.61486 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1857  N-terminal methylation  32.04 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0448  hypothetical protein  44.26 
 
 		 191 aa  58.2  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2949  methylation site containing protein  35.53 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0811797  normal  0.399462 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1067  methylation site containing protein  40.85 
 
 		 130 aa  58.2  0.00000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0204  type IV pilus assembly protein PilE  43.28 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3106  putative general secretion pathway G transmembrane protein  35 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.590033  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1217  type IV pilus biogenesis protein PilE  34.38 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03468  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  36.49 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3240  general secretion pathway protein G  37.5 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0651  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.3 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2038  fimbrial protein pilin  39.13 
 
 		 129 aa  58.2  0.00000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0012  general secretion pathway protein G  37.5 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0077  general secretion pathway protein G  37.5 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0059  general secretion pathway protein G  37.5 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0058  general secretion pathway protein G  37.5 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109015  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0058  general secretion pathway protein G  37.5 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0274  general secretion pathway protein H  43.94 
 
 		 174 aa  57.8  0.00000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.560285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0048  general secretion pathway protein G  37.5 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.503149  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1436  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45.76 
 
 		 171 aa  57.8  0.00000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0765  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  49.21 
 
 		 170 aa  57.8  0.00000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000473938  hitchhiker  1.49827e-16 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3221  general secretion pathway protein G  36.92 
 
 		 163 aa  57  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0534  general secretion pathway protein G  33.78 
 
 		 147 aa  57  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1562  transformation system protein  28.57 
 
 		 187 aa  57  0.0000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.586126  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  41.94 
 
 		 152 aa  57.4  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0505  fimbrial protein pilin  40.62 
 
 		 159 aa  57  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55490  HxcT pseudopilin  35.48 
 
 		 149 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.04599 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3821  hypothetical protein  39.77 
 
 		 173 aa  57  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2532  general secretion pathway protein G  39.29 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.211317  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0927  type IV pilus biogenesis protein  38.75 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2275  general secretion pathway protein H  33.33 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>