29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4969 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_4969  general secretion pathway protein H  100 
 
 		 144 aa  294  2e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2388  PHA accumulation regulator DNA-binding-like  43.97 
 
 		 180 aa  89  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.252746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0345  general secretion pathway protein H  36.72 
 
 		 176 aa  85.9  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177644  normal  0.0749297 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4066  general secretion pathway protein H  38.03 
 
 		 179 aa  83.6  9e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4063  general secretion pathway protein H  52.17 
 
 		 75 aa  75.1  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4630  hypothetical protein  42.72 
 
 		 143 aa  73.9  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0936  general secretion pathway protein  31.48 
 
 		 155 aa  70.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.898049 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0960  hypothetical protein  28.57 
 
 		 186 aa  63.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0933  hypothetical protein  28.57 
 
 		 186 aa  63.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3584  fimbrial protein PilA  35.59 
 
 		 176 aa  60.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.194411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2522  pilin  35.59 
 
 		 176 aa  60.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1163  hypothetical protein  38.81 
 
 		 151 aa  50.8  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0263  pilin polypeptide  31.82 
 
 		 178 aa  50.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0567  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  22.77 
 
 		 147 aa  48.1  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1217  type IV pilus biogenesis protein PilE  26.53 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0260  pilin polypeptide  34.04 
 
 		 187 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2471  hypothetical protein  27.48 
 
 		 172 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1201  Tfp pilus assembly protein PilE-like  40.74 
 
 		 189 aa  45.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0617  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  25 
 
 		 158 aa  44.7  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.217435 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0802  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  26.37 
 
 		 152 aa  43.5  0.0009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.964553  normal  0.826959 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20881  pilin  38.3 
 
 		 159 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1199  hypothetical protein  31.15 
 
 		 221 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.789092  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20891  pilin  40 
 
 		 170 aa  41.6  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1067  methylation site containing protein  27.08 
 
 		 130 aa  41.2  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3031  methylation site containing protein  28.87 
 
 		 133 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4155  fimbiral protein PilA  28.57 
 
 		 188 aa  41.6  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.614605  normal  0.158719 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07011  hypothetical protein  32 
 
 		 208 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.212398  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0938  type 4 prepilin-like protein  39.53 
 
 		 153 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.141756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3128  methylation site containing protein  25 
 
 		 132 aa  40  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.932633 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>