More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_3128 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_3128  methylation site containing protein  100 
 
 		 132 aa  271  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.932633 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1067  methylation site containing protein  83.33 
 
 		 130 aa  224  3e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1107  methylation site containing protein  76.74 
 
 		 130 aa  215  2e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.963603 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0932  type IV pilus biogenesis protein PilE  81.82 
 
 		 132 aa  213  8e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0340511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3031  methylation site containing protein  76.69 
 
 		 133 aa  210  4.9999999999999996e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1202  type IV pilus biogenesis protein PilE  76.56 
 
 		 130 aa  207  3e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2949  methylation site containing protein  72.11 
 
 		 147 aa  204  2e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0811797  normal  0.399462 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1164  type IV pilus biogenesis protein PilE  68.46 
 
 		 130 aa  177  4e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.536283 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3227  type IV pilus biogenesis protein PilE  68.46 
 
 		 130 aa  176  7e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1062  type IV pilus biogenesis protein PilE  68.46 
 
 		 130 aa  176  7e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1129  type IV pilus biogenesis protein PilE  67.69 
 
 		 130 aa  175  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3524  type IV pilus biogenesis protein PilE  66.15 
 
 		 130 aa  161  2.0000000000000002e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1299  Type IV pilus biogenesis protein PilE  53.6 
 
 		 128 aa  153  8e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.799661 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1217  type IV pilus biogenesis protein PilE  50.77 
 
 		 141 aa  141  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1091  methylation site containing protein  51.97 
 
 		 130 aa  138  3e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2882  methylation site containing protein  53.49 
 
 		 138 aa  136  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2715  methylation  53.79 
 
 		 129 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0720544  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2916  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  46.97 
 
 		 145 aa  116  9e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2680  type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  42.86 
 
 		 146 aa  110  6e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0580057 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0086  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  40.6 
 
 		 150 aa  101  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0399  general secretion pathway protein H  46.21 
 
 		 146 aa  95.1  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60320  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  39.86 
 
 		 141 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000362369 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1865  pilus assembly protein  37.96 
 
 		 134 aa  92  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5684  pilus assembly protein PilE  43.18 
 
 		 167 aa  89.7  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.148368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2886  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.86 
 
 		 170 aa  89.7  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.308484  normal  0.94282 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0957  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.57 
 
 		 141 aa  87  8e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.296711 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004288  putative fimbrial assembly protein PilE  36.57 
 
 		 163 aa  83.6  8e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5196  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  36.5 
 
 		 141 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1383  type IV pilin PilE  41.22 
 
 		 135 aa  82.8  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.140998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1764  type IV pilin  33.33 
 
 		 151 aa  82.4  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.940075  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1702  type IV pilin  33.33 
 
 		 151 aa  82  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.135824  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0220  pilus assembly protein  40.71 
 
 		 140 aa  81.6  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.168362 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2882  methylation  40.15 
 
 		 132 aa  81.6  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.938712  normal  0.364905 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01325  type IV pilin  41.27 
 
 		 122 aa  80.5  0.000000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.113469  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0384  putative pilin  38.06 
 
 		 147 aa  78.2  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2540  fimbrial protein pilin  36.11 
 
 		 140 aa  78.2  0.00000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0681  type-IV pilin  37.76 
 
 		 149 aa  77.4  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0664  type-IV pilin  37.76 
 
 		 149 aa  77.8  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11830  type IV PilE-like pilus assembly protein  42.22 
 
 		 131 aa  77.4  0.00000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0852  methylation site containing protein  36.03 
 
 		 131 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3170  methylation site containing protein  36.03 
 
 		 131 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0208  putative prepilin like protein  36.43 
 
 		 139 aa  75.9  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0480818 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5198  fimbrial protein pilin  35.71 
 
 		 148 aa  74.3  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2839  protein involved in methylation  43.75 
 
 		 136 aa  74.3  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0273449  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3168  prepilin-type cleavage/methylation  33.33 
 
 		 130 aa  72.8  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  34.59 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0723  type-4 fimbrial pilin-like transmembrane protein  36.15 
 
 		 161 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2663  type IV pilus biogenesis protein PilE  35.71 
 
 		 142 aa  70.9  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5180  fimbrial protein pilin  32.89 
 
 		 169 aa  70.9  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0088813  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2904  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  37.96 
 
 		 168 aa  69.7  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.3004 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0345  general secretion pathway protein H  32.85 
 
 		 176 aa  69.3  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177644  normal  0.0749297 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1822  type IV pilin  31.62 
 
 		 138 aa  68.2  0.00000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0523524  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2914  type IV pilin PilE  36.3 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0462503 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1287  type 4 fimbrial biogenesis signal peptide protein  36.17 
 
 		 155 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.54364 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4551  type IV pili biogenesis protein PilE  34.09 
 
 		 129 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.402137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0872  general secretion pathway protein H  54.24 
 
 		 152 aa  66.2  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.854476  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0719  type IV pilin  35.71 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.464442  normal  0.176419 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2154  Tfp pilus assembly protein PilE  29.5 
 
 		 138 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0676  type IV pilin  35 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256255  normal  0.685259 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2664  methylation  50 
 
 		 160 aa  65.5  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3189  fimbrial protein pilin  29.63 
 
 		 162 aa  65.5  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.208  normal  0.535395 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0505  fimbrial protein pilin  31.21 
 
 		 159 aa  65.1  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01136  Tfp pilus assembly protein PilE  34.81 
 
 		 128 aa  64.7  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0657  type IV pili biogenesis protein PilE  33.33 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.96879 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0020  PilE protein  33.11 
 
 		 164 aa  62.8  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0816  type IV pilus biogenesis protein  32.33 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3550  Tfp pilus assembly protein PilE  33.56 
 
 		 164 aa  62  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.844187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3224  type IV pilin  37.23 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2826  Tfp pilus assembly protein  30.07 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0621265 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03468  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  33.61 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0802  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.82 
 
 		 152 aa  60.8  0.000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.964553  normal  0.826959 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3170  prepilin-type cleavage/methylation  35.87 
 
 		 155 aa  60.8  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.647515  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2557  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  38.36 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0530742 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3255  hypothetical protein  30.94 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0933  hypothetical protein  34.58 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0960  hypothetical protein  34.58 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1018  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.46 
 
 		 161 aa  60.1  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1661  type 4 pili biogenesis protein (prepilin-like protein)  29.2 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.507585  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5192  fimbrial protein pilin  33.33 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.373526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0059  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.8 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.230525 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0124  general secretion pathway protein G  31.78 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0617  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.65 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.217435 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0567  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  31.43 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0520  type IV pilin  29.2 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20881  pilin  32.8 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0204  type IV pilus assembly protein PilE  28.76 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3356  fimbrial protein pilin: general secretion pathway protein H  39.44 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.669833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3824  fimbrial protein pilin  40.91 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0456668 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00604  general secretion pathway protein G  39.47 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0147  general secretion pathway protein G  36.05 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0788  fimbrial protein pilin  29.08 
 
 		 163 aa  57.8  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.684386  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3564  general secretion pathway protein G  41.1 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2629  type IV pilus subunit PilA  37.33 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  33.33 
 
 		 152 aa  57.8  0.00000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3102  fimbrial protein pilin  34.96 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.193045  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0210  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.18 
 
 		 154 aa  57.4  0.00000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103934  normal  0.61486 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0720  fimbrial protein pilin  30.6 
 
 		 133 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0108  general secretion pathway protein G  30.16 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0065  pilin  50 
 
 		 170 aa  57.4  0.00000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.154072 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0015  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.85 
 
 		 193 aa  57  0.00000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.170754  normal  0.192574 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>