25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1163 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1163  hypothetical protein  100 
 
 
151 aa  314  3e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1201  Tfp pilus assembly protein PilE-like  42.28 
 
 
189 aa  127  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1199  hypothetical protein  32.93 
 
 
221 aa  90.9  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.789092  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07011  hypothetical protein  32 
 
 
208 aa  80.9  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.212398  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07091  hypothetical protein  26.85 
 
 
263 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4969  general secretion pathway protein H  38.81 
 
 
144 aa  50.8  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07041  hypothetical protein  24.51 
 
 
189 aa  50.4  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.540134  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0345  general secretion pathway protein H  37.04 
 
 
176 aa  45.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177644  normal  0.0749297 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2388  PHA accumulation regulator DNA-binding-like  38.71 
 
 
180 aa  45.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.252746  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0571  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.58 
 
 
163 aa  44.7  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0449  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  29.59 
 
 
167 aa  44.3  0.0006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000146857  hitchhiker  0.0000000193676 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0933  hypothetical protein  38.89 
 
 
186 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0960  hypothetical protein  38.89 
 
 
186 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0617  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  35.82 
 
 
158 aa  43.9  0.0007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.217435 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0274  general secretion pathway protein H  40 
 
 
174 aa  43.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.560285  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.59 
 
 
168 aa  42.7  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0567  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  33.77 
 
 
147 aa  42.4  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0093  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  31.82 
 
 
169 aa  42  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0563183 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1548  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.89 
 
 
167 aa  41.2  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  hitchhiker  0.00000000000000294624 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2522  pilin  39.53 
 
 
176 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3584  fimbrial protein PilA  39.53 
 
 
176 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.194411  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0376  hypothetical protein  32.73 
 
 
174 aa  40.8  0.006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000272235  hitchhiker  0.0000000000782624 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20891  pilin  31.67 
 
 
170 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0926  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  36.17 
 
 
171 aa  40.4  0.009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000619994  hitchhiker  8.71814e-18 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0392  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38 
 
 
175 aa  40  0.01  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000336485  hitchhiker  0.0000000727713 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>