More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0345 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_0345  general secretion pathway protein H  100 
 
 		 176 aa  354  3.9999999999999996e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177644  normal  0.0749297 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3584  fimbrial protein PilA  56.18 
 
 		 176 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.194411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2522  pilin  56.18 
 
 		 176 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0960  hypothetical protein  43.71 
 
 		 186 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0933  hypothetical protein  43.71 
 
 		 186 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0260  pilin polypeptide  41.61 
 
 		 187 aa  100  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2388  PHA accumulation regulator DNA-binding-like  48.78 
 
 		 180 aa  100  9e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.252746  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4066  general secretion pathway protein H  46.55 
 
 		 179 aa  96.3  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0938  type 4 prepilin-like protein  55.37 
 
 		 153 aa  94  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.141756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0936  general secretion pathway protein  33.9 
 
 		 155 aa  89.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.898049 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0263  pilin polypeptide  34.29 
 
 		 178 aa  89  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4063  general secretion pathway protein H  60.29 
 
 		 75 aa  88.2  5e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0937  type 4 prepilin-like protein  61.11 
 
 		 153 aa  87  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.880072 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4969  general secretion pathway protein H  36.72 
 
 		 144 aa  85.9  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0048  pilin polypeptide PilA-like  39.1 
 
 		 144 aa  84.3  7e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.335089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0049  pilin polypeptide PilA-like  39.1 
 
 		 144 aa  84.3  8e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0965276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1442  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  42.71 
 
 		 155 aa  74.3  0.0000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.102563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0617  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.35 
 
 		 158 aa  73.2  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.217435 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07011  hypothetical protein  34.43 
 
 		 208 aa  71.6  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.212398  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0802  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.86 
 
 		 152 aa  71.2  0.000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.964553  normal  0.826959 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0567  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.46 
 
 		 147 aa  70.9  0.000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0093  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  46.05 
 
 		 169 aa  69.7  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0563183 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3128  methylation site containing protein  32.85 
 
 		 132 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.932633 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1199  hypothetical protein  43.06 
 
 		 221 aa  67.8  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.789092  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4630  hypothetical protein  33.61 
 
 		 143 aa  67.4  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0571  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.67 
 
 		 163 aa  67  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0392  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45.95 
 
 		 175 aa  66.2  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000336485  hitchhiker  0.0000000727713 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0059  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.87 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.230525 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.27 
 
 		 169 aa  65.9  0.0000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0651  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.38 
 
 		 165 aa  65.5  0.0000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1067  methylation site containing protein  38.95 
 
 		 130 aa  64.7  0.0000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45.57 
 
 		 157 aa  64.3  0.0000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2680  type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  31.91 
 
 		 146 aa  63.9  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0580057 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1201  Tfp pilus assembly protein PilE-like  44 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45.83 
 
 		 168 aa  63.5  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0765  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  49.3 
 
 		 170 aa  63.5  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000473938  hitchhiker  1.49827e-16 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1107  methylation site containing protein  38.78 
 
 		 130 aa  63.5  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.963603 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4155  fimbiral protein PilA  48.48 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.614605  normal  0.158719 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0274  general secretion pathway protein H  49.35 
 
 		 174 aa  62.8  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.560285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1524  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.61 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000584644  unclonable  2.6975300000000003e-19 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0807  hypothetical protein  42.5 
 
 		 182 aa  62.8  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000505152 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1436  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45.33 
 
 		 171 aa  62.4  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0482  general secretion pathway protein G  43.9 
 
 		 171 aa  62  0.000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00144077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3128  general secretion pathway protein G  41.89 
 
 		 165 aa  62  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0729977 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1722  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  34.23 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  43.94 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0210  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.78 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103934  normal  0.61486 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0096  hypothetical protein  34.26 
 
 		 163 aa  61.6  0.000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.062594 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0675  general secretion pathway protein G  41.1 
 
 		 159 aa  61.2  0.000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.186648  normal  0.343045 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1202  type IV pilus biogenesis protein PilE  35.96 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  42.42 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20881  pilin  38.71 
 
 		 159 aa  60.8  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0204  type IV pilus assembly protein PilE  43.42 
 
 		 155 aa  60.8  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0340  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.5 
 
 		 165 aa  60.5  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3549  type 4 prepilin-like protein  29.66 
 
 		 177 aa  60.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2564  hypothetical protein  31.19 
 
 		 177 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.569226 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1018  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.66 
 
 		 161 aa  60.5  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0654  general secretion pathway protein G  37.97 
 
 		 159 aa  60.8  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0121173  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1548  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.74 
 
 		 167 aa  60.5  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  hitchhiker  0.00000000000000294624 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20891  pilin  38.03 
 
 		 170 aa  60.1  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1387  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  35.24 
 
 		 175 aa  60.5  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0231  general secretion pathway protein G  39.39 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0800  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.22 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.346386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3419  general secretion pathway protein G  35.96 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000422428 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0331  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.05 
 
 		 172 aa  60.1  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3031  methylation site containing protein  39.71 
 
 		 133 aa  60.1  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1261  hypothetical protein  42.25 
 
 		 168 aa  58.9  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2916  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  28.12 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1096  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  50 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.292656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1097  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  29.01 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.282151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17770  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain-containing protein  52.46 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.775526 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5689  general secretion pathway protein G  40.32 
 
 		 158 aa  58.9  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128164  normal  0.128064 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0345  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.97 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0613  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  52.73 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0934015 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  34.38 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0015  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  30.91 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.170754  normal  0.192574 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.93 
 
 		 163 aa  58.2  0.00000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.253002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2949  methylation site containing protein  41.67 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0811797  normal  0.399462 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2449  Fimbrial protein pilin  32.61 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000426279  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0668  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.93 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000136734 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0612  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.06 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1321  general secretion pathway protein G  38.89 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0124  general secretion pathway protein G  34.33 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0376  hypothetical protein  36.62 
 
 		 174 aa  57.8  0.00000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000272235  hitchhiker  0.0000000000782624 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0548  hypothetical protein  41.33 
 
 		 169 aa  57.8  0.00000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0558  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  33.11 
 
 		 168 aa  57.8  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3221  general secretion pathway protein G  34.72 
 
 		 163 aa  57.4  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2904  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  33.33 
 
 		 168 aa  57.4  0.00000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.3004 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0534  general secretion pathway protein G  39.39 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1161  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.66 
 
 		 157 aa  57.4  0.00000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1421  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  39.24 
 
 		 172 aa  57.4  0.00000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1049  general secretion pathway protein G  36.62 
 
 		 151 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0449  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.38 
 
 		 167 aa  57.4  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000146857  hitchhiker  0.0000000193676 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3179  general secretion pathway protein G  32.89 
 
 		 152 aa  57  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.223664  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3940  general secretion pathway protein G  31.43 
 
 		 154 aa  57  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.18178 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4497  general secretion pathway protein G  30.38 
 
 		 154 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.13255 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0606  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.58 
 
 		 156 aa  57  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000101189  hitchhiker  0.000000768083 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0475  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.25 
 
 		 171 aa  57.4  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0059  general secretion pathway protein G  35.71 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3240  general secretion pathway protein G  35.71 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42403 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>