37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_07041 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_07041  hypothetical protein  100 
 
 
189 aa  375  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.540134  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1199  hypothetical protein  42.54 
 
 
221 aa  156  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.789092  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07091  hypothetical protein  47.24 
 
 
263 aa  155  3e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07011  hypothetical protein  37.95 
 
 
208 aa  140  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.212398  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1201  Tfp pilus assembly protein PilE-like  22.22 
 
 
189 aa  61.6  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0617  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  31.88 
 
 
158 aa  51.6  0.000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.217435 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0345  general secretion pathway protein H  32.95 
 
 
176 aa  51.2  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177644  normal  0.0749297 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1163  hypothetical protein  24.51 
 
 
151 aa  50.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1548  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  28.17 
 
 
167 aa  46.6  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  hitchhiker  0.00000000000000294624 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0960  hypothetical protein  33.33 
 
 
186 aa  45.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0933  hypothetical protein  33.33 
 
 
186 aa  45.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0802  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  27.54 
 
 
152 aa  45.4  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.964553  normal  0.826959 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0800  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  29.41 
 
 
167 aa  45.4  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.346386  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0376  hypothetical protein  27.54 
 
 
174 aa  44.7  0.0007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000272235  hitchhiker  0.0000000000782624 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3584  fimbrial protein PilA  33.96 
 
 
176 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.194411  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2522  pilin  33.96 
 
 
176 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1524  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  28.57 
 
 
159 aa  43.9  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000584644  unclonable  2.6975300000000003e-19 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4155  fimbiral protein PilA  33.33 
 
 
188 aa  43.5  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.614605  normal  0.158719 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0571  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  28.99 
 
 
163 aa  43.5  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1507  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.23 
 
 
121 aa  43.9  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000010883  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02978  putative general secretion pathway GSPG related transmembrane protein  25.33 
 
 
172 aa  43.1  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.671308  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0613  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  31.48 
 
 
165 aa  43.1  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0934015 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1073  general secretion pathway protein G  33.96 
 
 
155 aa  42.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.56277  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3940  general secretion pathway protein G  29.82 
 
 
154 aa  42.7  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.18178 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  27.94 
 
 
169 aa  42.7  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0612  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  22.61 
 
 
161 aa  42.4  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1442  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  30.88 
 
 
155 aa  42.7  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.102563  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0096  hypothetical protein  28.99 
 
 
163 aa  42  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.062594 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0093  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  29.41 
 
 
169 aa  42.4  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0563183 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0682  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  30.67 
 
 
165 aa  42.4  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0723462  hitchhiker  0.000000000174273 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2857  general secretion pathway protein G  36.36 
 
 
157 aa  42  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0475  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  27.54 
 
 
171 aa  42  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0124  general secretion pathway protein G  40 
 
 
144 aa  41.6  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2613  putative general secretion pathway protein G precursor (PilD-dependent protein pddA)  21.74 
 
 
163 aa  41.6  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  30.3 
 
 
168 aa  41.6  0.008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3074  general secretion pathway protein G  28.07 
 
 
158 aa  41.2  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000016497 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0567  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  34.55 
 
 
147 aa  41.2  0.009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>