More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1722 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_1722  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  100 
 
 
143 aa  289  7e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0345  general secretion pathway protein H  34.23 
 
 
176 aa  61.6  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177644  normal  0.0749297 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1280  general secretion pathway protein G  34.75 
 
 
158 aa  60.5  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0449  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  31.07 
 
 
167 aa  59.7  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000146857  hitchhiker  0.0000000193676 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2613  putative general secretion pathway protein G precursor (PilD-dependent protein pddA)  33.33 
 
 
163 aa  60.1  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60320  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  30.68 
 
 
141 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000362369 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16150  General secretion pathway protein G  32.46 
 
 
145 aa  58.9  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.853983  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2778  general secretion pathway protein G  33.04 
 
 
149 aa  58.5  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1351  general secretion pathway protein G  32.14 
 
 
150 aa  58.2  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.346821  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02835  hypothetical type II secretion protein GspG  32.56 
 
 
151 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000370073  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3424  general secretion pathway protein G  32.56 
 
 
151 aa  57.8  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3409  general secretion pathway protein GspG  32.81 
 
 
151 aa  58.2  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02785  hypothetical protein  32.56 
 
 
151 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000404727  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3135  general secretion pathway protein G  32.56 
 
 
151 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0253  general secretion pathway protein G  29.41 
 
 
150 aa  57.4  0.00000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0739  general secretion pathway protein G  35.58 
 
 
164 aa  57.4  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.430586  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2391  general secretion pathway protein G  31.53 
 
 
144 aa  57.4  0.00000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000271033 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3244  general secretion pathway protein GspG  32.56 
 
 
151 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.948956  normal  0.749494 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0376  hypothetical protein  48.28 
 
 
174 aa  57.4  0.00000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000272235  hitchhiker  0.0000000000782624 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0318  general secretion pathway protein G  32.62 
 
 
163 aa  57.4  0.00000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1415  general secretion pathway protein G  31.86 
 
 
146 aa  57  0.00000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1584  general secretion pathway protein G  30.3 
 
 
166 aa  56.6  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0906658 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5196  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  39.66 
 
 
141 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3737  type II secretion pathway protein XcpT  35.44 
 
 
212 aa  56.6  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5689  general secretion pathway protein G  33.02 
 
 
158 aa  56.6  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128164  normal  0.128064 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1432  type II secretion systen protein G  32.71 
 
 
209 aa  55.8  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.412586  normal  0.909605 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1158  Tfp pilus assembly protein PilE  36.97 
 
 
135 aa  55.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0683  general secretion pathway protein G  28.43 
 
 
137 aa  55.5  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2310  putative GSPG-related transmembrane protein  34.06 
 
 
155 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.164905  normal  0.125662 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1413  general secretion pathway protein G  31.93 
 
 
144 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0288958  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1316  type II secretory pathway protein LspG  31.25 
 
 
140 aa  54.7  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1313  type II secretory pathway protein LspG  31.25 
 
 
140 aa  54.7  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3179  general secretion pathway protein G  27.41 
 
 
152 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.223664  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1609  general secretion pathway protein G  29.93 
 
 
150 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.784305  normal  0.423382 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3419  general secretion pathway protein G  29.57 
 
 
150 aa  54.7  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000422428 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0723  type-4 fimbrial pilin-like transmembrane protein  27.96 
 
 
161 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0718  general secretion pathway protein G  28.43 
 
 
137 aa  54.3  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3886  type II secretion system protein G  35.14 
 
 
122 aa  54.3  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4829  HxcT pseudopilin  32.11 
 
 
149 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0717  general secretion pathway protein G  28.43 
 
 
137 aa  54.3  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1081  general secretion pathway protein G  30.77 
 
 
146 aa  53.9  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464773  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0257  general secretion pathway protein G  37.1 
 
 
193 aa  53.9  0.0000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24020  general secretion pathway protein G  32.06 
 
 
148 aa  53.5  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0605  general secretion pathway protein G  33.62 
 
 
147 aa  53.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000021872 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1989  hypothetical protein  32.95 
 
 
124 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0788365  normal  0.18788 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2303  general secretion pathway protein G  32.8 
 
 
146 aa  53.1  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001889  general secretion pathway protein G  33.06 
 
 
147 aa  52.8  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0592  general secretion pathway protein G  32.33 
 
 
147 aa  53.1  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02979  putative general secretion pathway GSPG related transmembrane protein  28.57 
 
 
129 aa  52.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.811632  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0144  general secretion pathway protein G  31.36 
 
 
166 aa  52.8  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3221  general secretion pathway protein G  29.41 
 
 
163 aa  52.4  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2587  general secretion pathway protein G  28.68 
 
 
161 aa  52.4  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2857  general secretion pathway protein G  31.78 
 
 
157 aa  52.4  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3007  general secretion pathway protein G  31.07 
 
 
155 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.303532 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3044  general secretion pathway protein G  31.36 
 
 
159 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.21279  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3384  general secretion pathway protein G  31.3 
 
 
154 aa  52.4  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3391  general secretion pathway protein G  31.36 
 
 
156 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2612  general secretion pathway protein G  31.93 
 
 
153 aa  52.8  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.688921 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55490  HxcT pseudopilin  30.77 
 
 
149 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.04599 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2372  general secretion pathway protein G  28.93 
 
 
144 aa  52.4  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.411005  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00604  general secretion pathway protein G  33.06 
 
 
146 aa  52.8  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3312  general secretion pathway protein G  26.92 
 
 
138 aa  52  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2522  pilin  37.5 
 
 
176 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1199  hypothetical protein  28.77 
 
 
221 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.789092  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3584  fimbrial protein PilA  37.5 
 
 
176 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.194411  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1999  general secretion pathway protein G  31.71 
 
 
131 aa  51.6  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607295  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3221  general secretion pathway protein G  29.91 
 
 
156 aa  51.6  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.287852 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1177  methylation  33 
 
 
178 aa  51.2  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0126  Tfp pilus assembly protein PilE-like  24.24 
 
 
151 aa  51.2  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0148502  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0925  general secretion pathway protein G  33.01 
 
 
162 aa  51.6  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0172546  normal  0.856291 
 
 
-
 
NC_003296  RS00348  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  29.73 
 
 
128 aa  50.8  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2470  type II secretion system protein G  30.61 
 
 
124 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.335351  normal  0.427711 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1828  fimbrial protein pilin  31.51 
 
 
170 aa  51.2  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.10224  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3549  type 4 prepilin-like protein  25.19 
 
 
177 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0912  general secretion pathway protein G  32.04 
 
 
172 aa  50.8  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.429886 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0006  general secretion pathway protein G  30.63 
 
 
144 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0815216 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4713  general secretion pathway protein G  31.37 
 
 
166 aa  50.8  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  39.06 
 
 
142 aa  50.8  0.000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.23 
 
 
168 aa  50.4  0.000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2590  general secretion pathway protein G  31.03 
 
 
154 aa  50.4  0.000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0206  DNA transport machinery (exogenous DNA-binding protein)  26.04 
 
 
98 aa  50.4  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  30.26 
 
 
157 aa  50.1  0.000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0032  protein of unknown function DUF1559  41.94 
 
 
323 aa  49.7  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.98147  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0303  type IV pilin  36.07 
 
 
175 aa  50.1  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29080  general secretion pathway protein G  37.88 
 
 
124 aa  50.1  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3218  general secretion pathway protein G  32.93 
 
 
126 aa  50.1  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.427151 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1441  type II secretion system protein G  33.78 
 
 
129 aa  50.1  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000189967  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2275  general secretion pathway protein H  34.92 
 
 
164 aa  50.1  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1343  general secretion pathway protein G  30.28 
 
 
160 aa  50.1  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.657967  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1548  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  35.29 
 
 
167 aa  50.1  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  hitchhiker  0.00000000000000294624 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1473  general secretion pathway protein G  32.11 
 
 
150 aa  50.1  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.660645  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0668  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  33.85 
 
 
155 aa  50.1  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000136734 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2564  hypothetical protein  26.23 
 
 
177 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.569226 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0675  general secretion pathway protein G  32.69 
 
 
159 aa  49.7  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.186648  normal  0.343045 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2032  general secretion pathway protein G  30.89 
 
 
142 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  37.5 
 
 
142 aa  49.7  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0392  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  34.43 
 
 
175 aa  49.3  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000336485  hitchhiker  0.0000000727713 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2923  general secretion pathway protein G  28.68 
 
 
141 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.370501  normal  0.274003 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2650  general secretion pathway protein G  29.29 
 
 
155 aa  49.3  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0093  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.24 
 
 
169 aa  48.9  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0563183 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>