167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0206 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0206  DNA transport machinery (exogenous DNA-binding protein)  100 
 
 		 98 aa  202  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2369  ComG operon protein 3  76.53 
 
 		 98 aa  166  9e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4319  comG operon protein 3  51.61 
 
 		 99 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.516067  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4372  comG operon protein 3  51.61 
 
 		 99 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4262  comG operon protein 3  52.69 
 
 		 99 aa  116  9e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3983  comG operon protein 3  52.69 
 
 		 99 aa  116  9e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0155019  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4095  comG operon protein 3  52.69 
 
 		 99 aa  115  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.663959  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4143  comG operon protein 3  51.61 
 
 		 99 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4464  ComG operon protein 3  51.61 
 
 		 99 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2926  ComG operon protein 3  52.08 
 
 		 99 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.972463  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3993  comG operon protein 3  51.61 
 
 		 99 aa  103  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4353  comG operon protein 3  50.54 
 
 		 99 aa  101  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1107  comG operon protein 3  41.94 
 
 		 105 aa  59.7  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00201822  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1600  competence protein ComGC-like protein  43.01 
 
 		 103 aa  58.5  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.530657  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1634  hypothetical protein  43.01 
 
 		 103 aa  58.5  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.727392  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00348  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  36 
 
 		 128 aa  57  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1999  general secretion pathway protein G  37.36 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0555  competence protein ComGC-like protein  34.74 
 
 		 103 aa  54.7  0.0000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0898  hypothetical protein  34.25 
 
 		 115 aa  53.5  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.725433  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2301  putative GSPG-related protein  28 
 
 		 130 aa  50.8  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.152629  normal  0.0321295 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1273  competence protein ComGC  36.62 
 
 		 129 aa  50.4  0.000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0185017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1722  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  26.04 
 
 		 143 aa  50.4  0.000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1440  type II secretion system protein G  31.94 
 
 		 131 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0197781  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0534  general secretion pathway protein G  28.21 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1081  general secretion pathway protein G  26.92 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464773  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1321  general secretion pathway protein G  26.92 
 
 		 158 aa  48.5  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5689  general secretion pathway protein G  25.64 
 
 		 158 aa  48.1  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128164  normal  0.128064 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3419  general secretion pathway protein G  26.92 
 
 		 150 aa  48.1  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000422428 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2612  general secretion pathway protein G  30.56 
 
 		 153 aa  47.4  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.688921 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0449  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.23 
 
 		 167 aa  47.4  0.00007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000146857  hitchhiker  0.0000000193676 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0345  general secretion pathway protein H  32.89 
 
 		 176 aa  47.4  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177644  normal  0.0749297 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.31 
 
 		 157 aa  47.4  0.00007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3312  general secretion pathway protein G  26.96 
 
 		 138 aa  47.4  0.00007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0006  general secretion pathway protein G  26.47 
 
 		 144 aa  47  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0815216 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0764  general secretion pathway protein G  27.63 
 
 		 139 aa  46.2  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.546085  normal  0.0744092 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0675  general secretion pathway protein G  27.63 
 
 		 159 aa  46.2  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.186648  normal  0.343045 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0654  general secretion pathway protein G  27.63 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0121173  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2587  general secretion pathway protein G  28.05 
 
 		 161 aa  46.6  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  48.89 
 
 		 152 aa  46.2  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1302  general secretion pathway protein G  23.46 
 
 		 153 aa  45.4  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2425  competence protein ComGC  42.86 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.402709  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1415  general secretion pathway protein G  23.17 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3128  general secretion pathway protein G  27.27 
 
 		 165 aa  46.2  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0729977 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2857  general secretion pathway protein G  23.46 
 
 		 157 aa  45.4  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3218  general secretion pathway protein G  30.56 
 
 		 126 aa  45.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.427151 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1473  general secretion pathway protein G  23.46 
 
 		 150 aa  45.4  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.660645  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0257  general secretion pathway protein G  28.36 
 
 		 193 aa  45.4  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  27.38 
 
 		 142 aa  45.4  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1360  general secretion family protein  43.86 
 
 		 114 aa  44.7  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000388019  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1441  type II secretion system protein G  26.32 
 
 		 129 aa  44.7  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000189967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  26.19 
 
 		 142 aa  44.7  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1442  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  37.68 
 
 		 155 aa  44.7  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.102563  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2997  type II secretion system protein G  29.25 
 
 		 135 aa  44.7  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000413298 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4497  general secretion pathway protein G  27.16 
 
 		 154 aa  44.3  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.13255 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.23 
 
 		 169 aa  44.3  0.0006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0486  pilin assembly protein  25.81 
 
 		 167 aa  44.3  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00295768  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1199  hypothetical protein  31.75 
 
 		 221 aa  43.9  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.789092  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2475  N-terminal methylation site  32.94 
 
 		 172 aa  43.9  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4713  general secretion pathway protein G  28.57 
 
 		 166 aa  43.9  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2153  competence protein  26.23 
 
 		 148 aa  43.9  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0605499  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1097  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45.45 
 
 		 151 aa  43.9  0.0008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.282151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3248  hypothetical protein  33.33 
 
 		 132 aa  43.9  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1090  general secretion pathway protein G  25.88 
 
 		 144 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319049  normal  0.327028 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2621  type II secretion system protein G  29.73 
 
 		 184 aa  43.5  0.0009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3221  general secretion pathway protein G  25 
 
 		 163 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3311  fimbrial protein pilin  29.76 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0253  general secretion pathway protein G  23.81 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1078  pilin  33.33 
 
 		 162 aa  43.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.18456 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3577  ATPase  30.86 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.44565 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3384  general secretion pathway protein G  26.87 
 
 		 154 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1487  fimbrial protein EcpC precursor  32.43 
 
 		 164 aa  43.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0651614  normal  0.606044 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2522  pilin  35.71 
 
 		 176 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0925  general secretion pathway protein G  27.69 
 
 		 162 aa  42.7  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0172546  normal  0.856291 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3549  Tfp pilus assembly protein FimT  30.67 
 
 		 201 aa  42.7  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.631889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1024  hypothetical protein  27.88 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1280  general secretion pathway protein G  25 
 
 		 158 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0779  hypothetical protein  34.92 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3584  fimbrial protein PilA  35.71 
 
 		 176 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.194411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1046  general secretion pathway protein G  25.88 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2470  type II secretion system protein G  32 
 
 		 124 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.335351  normal  0.427711 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1809  hypothetical protein  25.42 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1488  hypothetical protein  45.45 
 
 		 158 aa  43.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.109192  normal  0.403243 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1049  general secretion pathway protein G  25.88 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0260  pilin polypeptide  60.71 
 
 		 187 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0392  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  54.84 
 
 		 175 aa  42.7  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000336485  hitchhiker  0.0000000727713 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1432  type II secretion systen protein G  24.77 
 
 		 209 aa  42.4  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.412586  normal  0.909605 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2200  pilus assembly protein PilA  30.77 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.360457  hitchhiker  0.000654211 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1989  hypothetical protein  31.17 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0788365  normal  0.18788 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1857  N-terminal methylation  31.58 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0012  general secretion pathway protein G  25.37 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0048  general secretion pathway protein G  25.93 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.503149  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0058  general secretion pathway protein G  25.37 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109015  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3940  general secretion pathway protein G  25 
 
 		 154 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.18178 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0866  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  32.65 
 
 		 194 aa  42.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.197322  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0668  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  32.1 
 
 		 155 aa  42.4  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000136734 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  34.33 
 
 		 163 aa  42.7  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.253002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0059  general secretion pathway protein G  25.93 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0077  general secretion pathway protein G  25.37 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0058  general secretion pathway protein G  25.93 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3074  general secretion pathway protein G  24.69 
 
 		 158 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016497 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>