133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2369 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2369  ComG operon protein 3  100 
 
 
98 aa  198  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0206  DNA transport machinery (exogenous DNA-binding protein)  76.53 
 
 
98 aa  166  9e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4319  comG operon protein 3  48.39 
 
 
99 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.516067  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4372  comG operon protein 3  48.39 
 
 
99 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3983  comG operon protein 3  48.39 
 
 
99 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0155019  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4262  comG operon protein 3  48.39 
 
 
99 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4143  comG operon protein 3  47.31 
 
 
99 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4464  ComG operon protein 3  47.31 
 
 
99 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4095  comG operon protein 3  48.39 
 
 
99 aa  108  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.663959  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2926  ComG operon protein 3  48.35 
 
 
99 aa  106  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.972463  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3993  comG operon protein 3  49.46 
 
 
99 aa  97.8  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4353  comG operon protein 3  48.39 
 
 
99 aa  97.1  7e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0898  hypothetical protein  32.93 
 
 
115 aa  57.4  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.725433  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1809  hypothetical protein  29.55 
 
 
122 aa  55.1  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1107  comG operon protein 3  43.01 
 
 
105 aa  54.3  0.0000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00201822  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1600  competence protein ComGC-like protein  45.16 
 
 
103 aa  53.5  0.0000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.530657  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1634  hypothetical protein  45.16 
 
 
103 aa  53.5  0.0000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.727392  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0555  competence protein ComGC-like protein  42.86 
 
 
103 aa  52.4  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0534  general secretion pathway protein G  26.92 
 
 
147 aa  49.7  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1321  general secretion pathway protein G  25.64 
 
 
158 aa  49.7  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1273  competence protein ComGC  29.27 
 
 
129 aa  49.7  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0185017  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3419  general secretion pathway protein G  26.92 
 
 
150 aa  50.1  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000422428 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1081  general secretion pathway protein G  24.36 
 
 
146 aa  48.9  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464773  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00348  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  26.53 
 
 
128 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3128  general secretion pathway protein G  27.27 
 
 
165 aa  48.9  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0729977 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1024  hypothetical protein  32.69 
 
 
162 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5689  general secretion pathway protein G  25 
 
 
158 aa  48.5  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128164  normal  0.128064 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0257  general secretion pathway protein G  26.04 
 
 
193 aa  48.1  0.00004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0764  general secretion pathway protein G  27.63 
 
 
139 aa  48.1  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.546085  normal  0.0744092 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0675  general secretion pathway protein G  28.57 
 
 
159 aa  48.1  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.186648  normal  0.343045 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0654  general secretion pathway protein G  28.57 
 
 
159 aa  48.1  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0121173  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4713  general secretion pathway protein G  28.57 
 
 
166 aa  47.8  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  30.86 
 
 
142 aa  47.4  0.00007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3577  ATPase  32.05 
 
 
146 aa  47  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.44565 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1440  type II secretion system protein G  29.17 
 
 
131 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0197781  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  29.63 
 
 
142 aa  46.2  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1360  general secretion family protein  34.38 
 
 
114 aa  45.4  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000388019  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1432  type II secretion systen protein G  24.77 
 
 
209 aa  45.8  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.412586  normal  0.909605 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1999  general secretion pathway protein G  31.87 
 
 
131 aa  45.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607295  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2587  general secretion pathway protein G  28.79 
 
 
161 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0345  general secretion pathway protein H  38.46 
 
 
176 aa  45.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177644  normal  0.0749297 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1199  hypothetical protein  33.33 
 
 
221 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.789092  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4497  general secretion pathway protein G  25.88 
 
 
154 aa  45.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.13255 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2612  general secretion pathway protein G  27.78 
 
 
153 aa  45.4  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.688921 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0048  general secretion pathway protein G  25 
 
 
150 aa  45.1  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.503149  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1301  general secretion pathway protein G  28.99 
 
 
146 aa  44.7  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.010915 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0059  general secretion pathway protein G  25 
 
 
150 aa  44.7  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0058  general secretion pathway protein G  25 
 
 
150 aa  45.1  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663302  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0925  general secretion pathway protein G  34.38 
 
 
162 aa  44.3  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0172546  normal  0.856291 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3312  general secretion pathway protein G  26.23 
 
 
138 aa  44.3  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3240  general secretion pathway protein G  25 
 
 
150 aa  44.3  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0012  general secretion pathway protein G  26.19 
 
 
150 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0058  general secretion pathway protein G  26.19 
 
 
150 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109015  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2522  pilin  35.71 
 
 
176 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1351  general secretion pathway protein G  27.27 
 
 
150 aa  44.3  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.346821  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07011  hypothetical protein  29.49 
 
 
208 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.212398  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0077  general secretion pathway protein G  26.19 
 
 
150 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3584  fimbrial protein PilA  35.71 
 
 
176 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.194411  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0592  general secretion pathway protein G  25.29 
 
 
147 aa  43.9  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3074  general secretion pathway protein G  24.71 
 
 
158 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000016497 
 
 
-
 
NC_002936  DET0134  hypothetical protein  34.57 
 
 
139 aa  43.5  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1116  general secretion pathway protein G  28.79 
 
 
143 aa  43.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1302  general secretion pathway protein G  21.52 
 
 
153 aa  43.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4588  general secretion pathway protein G  23.17 
 
 
143 aa  43.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0100  general secretion pathway protein G  24.36 
 
 
144 aa  42.7  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1931  type II secretion system protein G  35.53 
 
 
138 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000053439  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1473  general secretion pathway protein G  21.79 
 
 
150 aa  43.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.660645  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0486  pilin assembly protein  26.51 
 
 
167 aa  43.5  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00295768  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0449  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  30.43 
 
 
167 aa  42.7  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000146857  hitchhiker  0.0000000193676 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.1 
 
 
157 aa  42.7  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2997  type II secretion system protein G  28.3 
 
 
135 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000413298 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3940  general secretion pathway protein G  25.76 
 
 
154 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.18178 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3221  general secretion pathway protein G  25 
 
 
163 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3384  general secretion pathway protein G  26.56 
 
 
154 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3044  general secretion pathway protein G  26.51 
 
 
159 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.21279  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0108  general secretion pathway protein G  23.08 
 
 
144 aa  42.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0102  general secretion pathway protein G  24.07 
 
 
149 aa  42.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.573705  normal  0.0126574 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2372  general secretion pathway protein G  25 
 
 
144 aa  42.4  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.411005  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1507  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  29.7 
 
 
121 aa  42.7  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000010883  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0668  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  28.26 
 
 
155 aa  42.7  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000136734 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3391  general secretion pathway protein G  26.51 
 
 
156 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2781  general secretion pathway protein G  26.83 
 
 
150 aa  42  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0224  general secretion pathway protein G  26.83 
 
 
150 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0011  general secretion pathway protein G  26.83 
 
 
150 aa  42  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0234  general secretion pathway protein G  24.77 
 
 
146 aa  42  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3514  general secretion pathway protein G  26.83 
 
 
150 aa  42  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.957184  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1886  general secretion pathway protein G  26.83 
 
 
150 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.354233  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0012  general secretion pathway protein G  26.83 
 
 
150 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0012  general secretion pathway protein G  26.83 
 
 
150 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127302  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2666  general secretion pathway protein G  26.83 
 
 
150 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0897  tfp pilus assembly protein, major pilin  31.67 
 
 
118 aa  41.6  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.768254  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1413  general secretion pathway protein G  21.25 
 
 
144 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0288958  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0006  general secretion pathway protein G  21.54 
 
 
144 aa  42  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0815216 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0605  general secretion pathway protein G  25.76 
 
 
147 aa  42  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000021872 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0779  hypothetical protein  31.71 
 
 
136 aa  41.6  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3311  fimbrial protein pilin  29.33 
 
 
137 aa  41.2  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1857  N-terminal methylation  32.89 
 
 
140 aa  41.6  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2857  general secretion pathway protein G  20 
 
 
157 aa  41.6  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1278  general secretion pathway protein G  25.76 
 
 
147 aa  41.6  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2532  general secretion pathway protein G  22.73 
 
 
156 aa  41.2  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.211317  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>