76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0555 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0555  competence protein ComGC-like protein  100 
 
 
103 aa  207  3e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0463  competence protein ComGC  54.46 
 
 
103 aa  73.2  0.000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1255  competence protein ComGC  53.33 
 
 
109 aa  68.2  0.00000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1273  competence protein ComGC  41.57 
 
 
129 aa  63.2  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0185017  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2926  ComG operon protein 3  35.05 
 
 
99 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.972463  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0206  DNA transport machinery (exogenous DNA-binding protein)  34.74 
 
 
98 aa  54.7  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2369  ComG operon protein 3  42.86 
 
 
98 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4095  comG operon protein 3  37.18 
 
 
99 aa  50.1  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.663959  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4372  comG operon protein 3  36.49 
 
 
99 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2038  fimbrial protein pilin  29.73 
 
 
129 aa  48.5  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4319  comG operon protein 3  36.49 
 
 
99 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.516067  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4262  comG operon protein 3  33.78 
 
 
99 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1600  competence protein ComGC-like protein  36.63 
 
 
103 aa  47.8  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.530657  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3983  comG operon protein 3  33.78 
 
 
99 aa  47.8  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0155019  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1634  hypothetical protein  36.63 
 
 
103 aa  47.8  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.727392  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4464  ComG operon protein 3  32.43 
 
 
99 aa  46.2  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4143  comG operon protein 3  32.43 
 
 
99 aa  46.2  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0318  general secretion pathway protein G  29.55 
 
 
163 aa  44.3  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0898  hypothetical protein  39.66 
 
 
115 aa  44.3  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.725433  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2629  type IV pilus subunit PilA  33.33 
 
 
138 aa  44.3  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03468  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  37.7 
 
 
141 aa  43.9  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20881  pilin  40.68 
 
 
159 aa  43.9  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_002936  DET1360  general secretion family protein  37.14 
 
 
114 aa  43.9  0.0007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000388019  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3344  prepilin-type cleavage/methylation  41.54 
 
 
148 aa  43.9  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.62769  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1302  type II secretion system protein  29.49 
 
 
124 aa  43.5  0.0009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0879623  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0897  tfp pilus assembly protein, major pilin  38.98 
 
 
118 aa  42.7  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.768254  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  28.75 
 
 
142 aa  43.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4819  general secretion pathway protein H  35.53 
 
 
138 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80083  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3218  general secretion pathway protein G  30.67 
 
 
126 aa  43.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.427151 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00604  general secretion pathway protein G  34.85 
 
 
146 aa  43.5  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2301  putative GSPG-related protein  33.75 
 
 
130 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.152629  normal  0.0321295 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1507  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  27.18 
 
 
121 aa  42.7  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000010883  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  27.5 
 
 
142 aa  42.7  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2522  pilin  36.67 
 
 
176 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3556  hypothetical protein  24.32 
 
 
153 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000792896  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3312  general secretion pathway protein G  35.09 
 
 
138 aa  42.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3584  fimbrial protein PilA  36.67 
 
 
176 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.194411  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5196  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  36.07 
 
 
141 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3918  methylation site containing protein  26.47 
 
 
143 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000265425  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1107  comG operon protein 3  33.01 
 
 
105 aa  42.7  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00201822  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0406  hypothetical protein  32.76 
 
 
352 aa  42.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0172  general secretion pathway protein G  35 
 
 
143 aa  42.4  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2425  competence protein ComGC  39.29 
 
 
125 aa  42.7  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.402709  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1441  type II secretion system protein G  29.33 
 
 
129 aa  42.4  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000189967  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1989  hypothetical protein  30.23 
 
 
124 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0788365  normal  0.18788 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3525  hypothetical protein  36.21 
 
 
162 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00449865  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001889  general secretion pathway protein G  34.85 
 
 
147 aa  42  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0263  pilin polypeptide  38.03 
 
 
178 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2470  type II secretion system protein G  28.75 
 
 
124 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.335351  normal  0.427711 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0956  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 
145 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.194745  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2997  type II secretion system protein G  34.15 
 
 
135 aa  41.2  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000413298 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29080  general secretion pathway protein G  29.33 
 
 
124 aa  41.2  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3896  Fimbrial protein pilin  37.7 
 
 
133 aa  41.2  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1007  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 
145 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3266  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 
145 aa  41.2  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000062887  hitchhiker  0.00000000000000294917 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4248  general secretion pathway protein G  34.43 
 
 
148 aa  41.2  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0347967 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1440  type II secretion system protein G  28 
 
 
131 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0197781  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0049  pilin polypeptide PilA-like  32.39 
 
 
144 aa  40.8  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0965276  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0048  pilin polypeptide PilA-like  32.39 
 
 
144 aa  40.8  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.335089  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2921  general secretion pathway protein G  33.87 
 
 
149 aa  40.8  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2840  protein of unknown function DUF1559  29.03 
 
 
348 aa  40.8  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0933  hypothetical protein  38.33 
 
 
186 aa  40.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4177  general secretion pathway protein G  32.81 
 
 
144 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.250819  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2461  type II secretion system protein G  28.75 
 
 
124 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.508549  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0960  hypothetical protein  38.33 
 
 
186 aa  40.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3030  general secretion pathway protein G  29.33 
 
 
139 aa  40.8  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.187173  hitchhiker  0.00937307 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3476  type II secretion system protein G  28.75 
 
 
128 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0390478  normal  0.854758 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0513  methylation site containing protein  27.45 
 
 
162 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00478235  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2295  type II secretion system protein G  28.75 
 
 
124 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.478951  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2303  general secretion pathway protein G  34.43 
 
 
146 aa  40.4  0.008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60320  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  34.43 
 
 
141 aa  40.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000362369 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1999  general secretion pathway protein G  34.12 
 
 
131 aa  40.4  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607295  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0866  hypothetical protein  47.22 
 
 
701 aa  40.4  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3450  protein of unknown function DUF1559  44.44 
 
 
330 aa  40.4  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.517501  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1313  type II secretory pathway protein LspG  30 
 
 
140 aa  40  0.01  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1316  type II secretory pathway protein LspG  30 
 
 
140 aa  40  0.01  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>