249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2475 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2475  N-terminal methylation site  100 
 
 		 172 aa  355  1.9999999999999998e-97  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5161  type IV pilin structural subunit  37.36 
 
 		 179 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0472  fimbrial protein pilin  35.37 
 
 		 182 aa  74.3  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.877435  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2449  Fimbrial protein pilin  35.21 
 
 		 162 aa  73.6  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000426279  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0473  fimbrial protein pilin  34.53 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58730  type IV pilin structural subunit  29.67 
 
 		 179 aa  61.6  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.279942  normal  0.457351 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0557  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  27.72 
 
 		 173 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0463  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  29.38 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2540  general secretion pathway protein H  50.85 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.13206  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2680  fimbrial protein pilin  44.12 
 
 		 169 aa  58.2  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0726827  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0558  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  53.45 
 
 		 168 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2629  type IV pilus subunit PilA  30.34 
 
 		 138 aa  57  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  43.06 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3946  fimbrial protein pilin  51.72 
 
 		 169 aa  55.5  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129399 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0728  hypothetical protein  36.89 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1524  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  33.33 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000584644  unclonable  2.6975300000000003e-19 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0485  fimbrial protein pilin  30.25 
 
 		 136 aa  53.9  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1857  N-terminal methylation  36.96 
 
 		 140 aa  53.5  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0478  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  58.33 
 
 		 169 aa  53.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.322644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0480  pilin subfamily protein  49.12 
 
 		 174 aa  53.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0065  pilin  51.72 
 
 		 170 aa  53.1  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.154072 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0727  hypothetical protein  36.78 
 
 		 173 aa  52.4  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0797  pilin  32.74 
 
 		 148 aa  52  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12104  fimbrial protein  56.52 
 
 		 165 aa  51.6  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.246946  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0927  type IV pilus biogenesis protein  43.55 
 
 		 142 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3896  Fimbrial protein pilin  54.17 
 
 		 133 aa  51.6  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2663  type IV pilus biogenesis protein PilE  43.33 
 
 		 142 aa  51.6  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0864  pilin  54.9 
 
 		 163 aa  51.6  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484071 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0692  hypothetical protein  39.51 
 
 		 173 aa  51.2  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.51807  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3945  fimbrial protein pilin  37.5 
 
 		 166 aa  51.2  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.373423  hitchhiker  0.00130999 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1828  fimbrial protein pilin  33.33 
 
 		 170 aa  51.2  0.000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.10224  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1510  fimbrial protein  54.35 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.0000000690325  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3386  hypothetical protein  53.19 
 
 		 438 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00409988 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0765  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.74 
 
 		 170 aa  50.1  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000473938  hitchhiker  1.49827e-16 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1866  hypothetical protein  53.19 
 
 		 446 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.287595  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4155  fimbiral protein PilA  37.36 
 
 		 188 aa  49.7  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.614605  normal  0.158719 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3387  fgenesh4_pg.C_scaffold_2883000002  50.91 
 
 		 196 aa  49.3  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.437334  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1442  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  34.88 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.102563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2413  type II secretion system protein G  38.03 
 
 		 149 aa  50.1  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330838  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4782  Tfp pilus assembly protein  48 
 
 		 179 aa  50.1  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0720  fimbrial protein pilin  39.71 
 
 		 133 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0799  fimbrial protein pilin  30.91 
 
 		 139 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0744296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4674  methylation  29.44 
 
 		 169 aa  48.9  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3344  prepilin-type cleavage/methylation  31.03 
 
 		 148 aa  48.9  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.62769  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0461  fimbrial protein precursor PilE (MS11 antigen)  34.86 
 
 		 167 aa  49.3  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0449  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  35.62 
 
 		 167 aa  48.9  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000146857  hitchhiker  0.0000000193676 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0680  fimbrial protein pilin  52.17 
 
 		 136 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0816  type IV pilus biogenesis protein  39.13 
 
 		 133 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0634  fimbrial protein pilin  52.17 
 
 		 136 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2301  putative GSPG-related protein  36.36 
 
 		 130 aa  48.1  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.152629  normal  0.0321295 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4819  general secretion pathway protein H  54.35 
 
 		 138 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80083  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1078  pilin  36.62 
 
 		 162 aa  48.1  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.18456 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0675  fimbrial protein pilin  52.17 
 
 		 136 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357739 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4040  fimbrial protein pilin  32.59 
 
 		 178 aa  48.5  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.99 
 
 		 157 aa  48.5  0.00005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2904  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  27.62 
 
 		 168 aa  47.8  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.3004 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4536  fimbrial protein pilin  52.17 
 
 		 136 aa  48.1  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1265  methylation  29.94 
 
 		 160 aa  47.8  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00964428  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2200  pilus assembly protein PilA  50 
 
 		 111 aa  47.8  0.00008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.360457  hitchhiker  0.000654211 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2997  type II secretion system protein G  33.33 
 
 		 135 aa  47.8  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000413298 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3944  fimbrial protein pilin  47.37 
 
 		 166 aa  47.4  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.736158  hitchhiker  0.00123211 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0477  putative type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  42.86 
 
 		 173 aa  47.4  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0748911  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4444  type IV pilin  50 
 
 		 160 aa  47.4  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0668  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.23 
 
 		 155 aa  47.4  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000136734 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0864  peptidase S49, protease IV  31.9 
 
 		 139 aa  47  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2913  hypothetical protein  38.1 
 
 		 182 aa  47.4  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3356  fimbrial protein pilin: general secretion pathway protein H  42.86 
 
 		 137 aa  46.2  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.669833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1321  general secretion pathway protein G  30.86 
 
 		 158 aa  46.2  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1042  hypothetical protein  46.3 
 
 		 120 aa  46.6  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1722  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  26.25 
 
 		 143 aa  46.6  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4679  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  32.18 
 
 		 168 aa  46.2  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0340  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  34.95 
 
 		 165 aa  46.6  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00348  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  34.33 
 
 		 128 aa  45.8  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5196  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  41.54 
 
 		 141 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0571  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.36 
 
 		 163 aa  45.8  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2126  methylation  53.49 
 
 		 146 aa  45.8  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.196428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4704  Type II secretion system protein G  31.63 
 
 		 145 aa  45.8  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0140964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5198  fimbrial protein pilin  33.64 
 
 		 148 aa  45.8  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1999  fimbrial protein  34.78 
 
 		 153 aa  45.8  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3782  methylation site containing protein  41.11 
 
 		 148 aa  45.8  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60320  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  28.83 
 
 		 141 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000362369 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0617  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.59 
 
 		 158 aa  45.8  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.217435 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3363  methylation  51.28 
 
 		 139 aa  45.4  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.57133  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5180  fimbrial protein pilin  32.47 
 
 		 169 aa  45.1  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0088813  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2540  fimbrial protein pilin  31.78 
 
 		 140 aa  45.4  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2522  pilin  32.58 
 
 		 176 aa  45.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3584  fimbrial protein PilA  32.58 
 
 		 176 aa  45.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.194411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1999  general secretion pathway protein G  35.35 
 
 		 131 aa  45.1  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2613  putative general secretion pathway protein G precursor (PilD-dependent protein pddA)  34.62 
 
 		 163 aa  45.1  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0476  methylation site containing protein  41.38 
 
 		 141 aa  45.1  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.991113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0477  prepilin-type cleavage/methylation  39.66 
 
 		 148 aa  45.1  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.695821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0230  Fimbrial protein pilin  35.14 
 
 		 161 aa  44.7  0.0006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0077  general secretion pathway protein G  27.4 
 
 		 150 aa  45.1  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0012  general secretion pathway protein G  27.4 
 
 		 150 aa  45.1  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0058  general secretion pathway protein G  27.4 
 
 		 150 aa  45.1  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109015  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0613  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  45.1 
 
 		 165 aa  44.7  0.0006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0934015 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1989  hypothetical protein  38.67 
 
 		 124 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0788365  normal  0.18788 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0314  general secretion pathway protein  50 
 
 		 147 aa  44.7  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0250  fimbrial subunit  50 
 
 		 152 aa  44.7  0.0007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0333044  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03468  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  31.58 
 
 		 141 aa  44.7  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>