More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0728 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0728  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  355  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0727  hypothetical protein  84.8 
 
 		 173 aa  303  9.000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0692  hypothetical protein  84.8 
 
 		 173 aa  301  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.51807  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4155  fimbiral protein PilA  47.54 
 
 		 188 aa  59.7  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.614605  normal  0.158719 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2680  fimbrial protein pilin  49.23 
 
 		 169 aa  59.7  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0726827  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03468  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  41.03 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  38.89 
 
 		 152 aa  57.8  0.00000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1857  N-terminal methylation  33.04 
 
 		 140 aa  57.4  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0472  fimbrial protein pilin  51.56 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.877435  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0463  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  47.54 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2540  general secretion pathway protein H  54.55 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.13206  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2475  N-terminal methylation site  36.89 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.28 
 
 		 168 aa  54.3  0.0000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1548  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  34.78 
 
 		 167 aa  53.9  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  hitchhiker  0.00000000000000294624 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0617  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.47 
 
 		 158 aa  53.9  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.217435 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  70.73 
 
 		 141 aa  53.5  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0376  hypothetical protein  30.47 
 
 		 174 aa  52.8  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000272235  hitchhiker  0.0000000000782624 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0567  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.16 
 
 		 147 aa  53.5  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0345  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  34.88 
 
 		 156 aa  53.1  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0802  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.5 
 
 		 152 aa  52.8  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.964553  normal  0.826959 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0651  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  48.28 
 
 		 165 aa  52.4  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0449  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  28.23 
 
 		 167 aa  52.4  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000146857  hitchhiker  0.0000000193676 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1931  type II secretion system protein G  32.46 
 
 		 138 aa  52.4  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000053439  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0668  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.36 
 
 		 155 aa  52.8  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000136734 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0557  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  52.73 
 
 		 173 aa  52  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2680  type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  34.15 
 
 		 146 aa  52  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0580057 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1889  hypothetical protein  36.99 
 
 		 137 aa  52.4  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4536  fimbrial protein pilin  71.05 
 
 		 136 aa  52  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1042  hypothetical protein  51.85 
 
 		 120 aa  52  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.85 
 
 		 169 aa  52  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2522  pilin  38.67 
 
 		 176 aa  52  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3584  fimbrial protein PilA  38.67 
 
 		 176 aa  52  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.194411  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0634  fimbrial protein pilin  68.42 
 
 		 136 aa  52  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0480  pilin subfamily protein  49.15 
 
 		 174 aa  51.6  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0680  fimbrial protein pilin  66.67 
 
 		 136 aa  52  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0675  fimbrial protein pilin  68.42 
 
 		 136 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357739 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3885  hypothetical protein  42.47 
 
 		 161 aa  51.6  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4040  fimbrial protein pilin  42.47 
 
 		 178 aa  50.8  0.000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0204  type IV pilus assembly protein PilE  41.56 
 
 		 155 aa  50.8  0.000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1088  hypothetical protein  49.06 
 
 		 338 aa  50.8  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2916  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  34.94 
 
 		 145 aa  50.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2663  type IV pilus biogenesis protein PilE  49.25 
 
 		 142 aa  50.8  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0485  fimbrial protein pilin  67.57 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0349  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  64.86 
 
 		 179 aa  50.8  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1265  methylation  60.98 
 
 		 160 aa  50.4  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00964428  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3248  hypothetical protein  42.62 
 
 		 132 aa  50.4  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.33 
 
 		 157 aa  50.8  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1067  methylation site containing protein  43.33 
 
 		 130 aa  50.4  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0548  hypothetical protein  45.61 
 
 		 169 aa  49.7  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0558  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  47.27 
 
 		 168 aa  49.7  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1387  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  31.82 
 
 		 175 aa  49.7  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1217  type IV pilus biogenesis protein PilE  34.15 
 
 		 141 aa  49.7  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0927  type IV pilus biogenesis protein  37.8 
 
 		 142 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0495  fimbrial protein EcpC precursor  43.55 
 
 		 172 aa  49.7  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.014346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0720  fimbrial protein pilin  39.53 
 
 		 133 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2200  pilus assembly protein PilA  32.31 
 
 		 111 aa  49.7  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.360457  hitchhiker  0.000654211 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2997  type II secretion system protein G  38.33 
 
 		 135 aa  50.1  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000413298 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0148  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  56.52 
 
 		 174 aa  49.3  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0015  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.08 
 
 		 193 aa  49.7  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.170754  normal  0.192574 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1078  pilin  45 
 
 		 162 aa  49.3  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.18456 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0274  general secretion pathway protein H  64.86 
 
 		 174 aa  50.1  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.560285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1828  fimbrial protein pilin  42.19 
 
 		 170 aa  50.1  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.10224  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2629  type IV pilus subunit PilA  45.9 
 
 		 138 aa  49.7  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0571  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.03 
 
 		 163 aa  50.1  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0093  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.33 
 
 		 169 aa  50.1  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0563183 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17770  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain-containing protein  35.29 
 
 		 135 aa  49.7  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.775526 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1442  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  47.62 
 
 		 155 aa  49.7  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.102563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2413  type II secretion system protein G  40.68 
 
 		 149 aa  50.1  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330838  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0059  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  64.86 
 
 		 151 aa  50.1  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.230525 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2914  type IV pilin PilE  46.15 
 
 		 144 aa  49.7  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0462503 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4782  Tfp pilus assembly protein  53.33 
 
 		 179 aa  49.3  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0265  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  62.16 
 
 		 166 aa  49.3  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.319115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1018  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.37 
 
 		 161 aa  49.3  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1487  fimbrial protein EcpC precursor  36.26 
 
 		 164 aa  48.9  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0651614  normal  0.606044 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1524  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.33 
 
 		 159 aa  49.3  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000584644  unclonable  2.6975300000000003e-19 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0475  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  32.35 
 
 		 171 aa  49.3  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58730  type IV pilin structural subunit  53.19 
 
 		 179 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.279942  normal  0.457351 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0065  pilin  39.02 
 
 		 170 aa  49.3  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.154072 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3945  fimbrial protein pilin  60.98 
 
 		 166 aa  49.3  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.373423  hitchhiker  0.00130999 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2449  Fimbrial protein pilin  32.56 
 
 		 162 aa  48.5  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000426279  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4444  type IV pilin  39.33 
 
 		 160 aa  48.9  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1460  type II secretion system protein G  40 
 
 		 153 aa  48.9  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52288  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0478  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  52.17 
 
 		 169 aa  48.9  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.322644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1199  hypothetical protein  44.07 
 
 		 221 aa  48.5  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.789092  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0331  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.07 
 
 		 172 aa  48.9  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3946  fimbrial protein pilin  54.35 
 
 		 169 aa  48.5  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129399 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0799  fimbrial protein pilin  42.65 
 
 		 139 aa  48.1  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0744296  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1510  fimbrial protein  59.46 
 
 		 138 aa  47.8  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.0000000690325  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1261  hypothetical protein  36.62 
 
 		 168 aa  47.8  0.00007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2096  pilin domain protein  40.98 
 
 		 70 aa  47.8  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000511675  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1865  pilus assembly protein  47.92 
 
 		 134 aa  48.1  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1091  methylation site containing protein  37.7 
 
 		 130 aa  47.8  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3391  general secretion pathway protein G  43.28 
 
 		 156 aa  48.1  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1421  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  31.39 
 
 		 172 aa  47.8  0.00007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2038  fimbrial protein pilin  38.1 
 
 		 129 aa  48.1  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3344  prepilin-type cleavage/methylation  47.76 
 
 		 148 aa  47.8  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.62769  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0606  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.26 
 
 		 156 aa  47.8  0.00007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000101189  hitchhiker  0.000000768083 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5185  protein involved in methylation  53.66 
 
 		 174 aa  47.8  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101493  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2645  type II secretion system protein  32.12 
 
 		 144 aa  48.1  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.498872  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0461  fimbrial protein precursor PilE (MS11 antigen)  36.59 
 
 		 167 aa  47.8  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653734  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>