More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4704 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4704  Type II secretion system protein G  100 
 
 		 145 aa  292  9e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0140964  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2301  putative GSPG-related protein  67.21 
 
 		 130 aa  170  5e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.152629  normal  0.0321295 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2621  type II secretion system protein G  51.82 
 
 		 184 aa  138  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00348  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  57.55 
 
 		 128 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3886  type II secretion system protein G  50 
 
 		 122 aa  124  5e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2581  N-terminal methylation site  54.55 
 
 		 138 aa  122  1e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1441  type II secretion system protein G  56.25 
 
 		 129 aa  122  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000189967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1302  type II secretion system protein  58.18 
 
 		 124 aa  121  3e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0879623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1989  hypothetical protein  48.65 
 
 		 124 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0788365  normal  0.18788 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2412  methylation  54.37 
 
 		 126 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2470  type II secretion system protein G  51.46 
 
 		 124 aa  118  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.335351  normal  0.427711 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3218  general secretion pathway protein G  57 
 
 		 126 aa  117  7e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.427151 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3476  type II secretion system protein G  50.49 
 
 		 128 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0390478  normal  0.854758 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2295  type II secretion system protein G  50.49 
 
 		 124 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.478951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2461  type II secretion system protein G  49.51 
 
 		 124 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.508549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1334  methylation  50.47 
 
 		 133 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.372792  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02979  putative general secretion pathway GSPG related transmembrane protein  55.67 
 
 		 129 aa  113  8.999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.811632  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29080  general secretion pathway protein G  51.92 
 
 		 124 aa  113  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1460  type II secretion system protein G  45.1 
 
 		 153 aa  102  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52288  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1931  type II secretion system protein G  43.36 
 
 		 138 aa  100  5e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000053439  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2997  type II secretion system protein G  43.48 
 
 		 135 aa  99  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000413298 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2413  type II secretion system protein G  46.15 
 
 		 149 aa  95.1  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330838  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1999  general secretion pathway protein G  38.79 
 
 		 131 aa  94.7  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1857  N-terminal methylation  42.27 
 
 		 140 aa  94.7  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1440  type II secretion system protein G  45.95 
 
 		 131 aa  94.7  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0197781  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1286  type II secretion system protein G  46.96 
 
 		 135 aa  91.7  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3311  fimbrial protein pilin  45 
 
 		 137 aa  91.3  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1776  pilin domain-containing protein  45.56 
 
 		 121 aa  90.1  8e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0138  putative pilus assembly protein  42.34 
 
 		 149 aa  88.6  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4795  putative general (Type II) secretion pathway protein  36.79 
 
 		 223 aa  72  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.954024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1351  general secretion pathway protein G  37.29 
 
 		 150 aa  65.1  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.346821  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0617  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.28 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.217435 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1170  xcmT3  42.62 
 
 		 129 aa  62  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2613  putative general secretion pathway protein G precursor (PilD-dependent protein pddA)  35.42 
 
 		 163 aa  61.2  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1507  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  33.33 
 
 		 121 aa  60.5  0.000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000010883  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1316  type II secretory pathway protein LspG  31.91 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1313  type II secretory pathway protein LspG  31.91 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  31.13 
 
 		 169 aa  59.7  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1678  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  32.65 
 
 		 163 aa  60.1  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1442  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  32.63 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.102563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1261  hypothetical protein  38.24 
 
 		 168 aa  58.9  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1303  hypothetical protein  34.48 
 
 		 173 aa  58.9  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.529272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1024  hypothetical protein  35.82 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0102  general secretion pathway protein G  35.87 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.573705  normal  0.0126574 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1280  general secretion pathway protein G  42.42 
 
 		 158 aa  58.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2612  general secretion pathway protein G  31.82 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.688921 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3384  general secretion pathway protein G  39.51 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0926  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  33.33 
 
 		 171 aa  57.8  0.00000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000619994  hitchhiker  8.71814e-18 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2372  general secretion pathway protein G  37.63 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.411005  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3940  general secretion pathway protein G  34.38 
 
 		 154 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.18178 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0169  general secretion pathway protein G  26.4 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4829  HxcT pseudopilin  34.41 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55490  HxcT pseudopilin  34.41 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.04599 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.81 
 
 		 168 aa  57.4  0.00000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1432  type II secretion systen protein G  33.33 
 
 		 209 aa  57  0.00000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.412586  normal  0.909605 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0668  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.81 
 
 		 155 aa  57  0.00000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000136734 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2582  N-terminal methylation site  35.58 
 
 		 170 aa  57  0.00000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3044  general secretion pathway protein G  37.04 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.21279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0058  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0567  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  35.82 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3391  general secretion pathway protein G  35.79 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0956  general secretion pathway protein G  32.32 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.194745  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1007  general secretion pathway protein G  32.32 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3312  general secretion pathway protein G  28.57 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  31.82 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3240  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1073  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.56277  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3266  general secretion pathway protein G  32.32 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000062887  hitchhiker  0.00000000000000294917 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1415  general secretion pathway protein G  29.6 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0059  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0739  general secretion pathway protein G  34.19 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.430586  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0077  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0012  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0108  general secretion pathway protein G  27.2 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0048  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.503149  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4248  general secretion pathway protein G  32.71 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0347967 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0058  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109015  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02835  hypothetical type II secretion protein GspG  31.93 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000370073  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3135  general secretion pathway protein G  31.93 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3409  general secretion pathway protein GspG  31.93 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4203  general secretion pathway protein G  29.46 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2532  general secretion pathway protein G  36.56 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.211317  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0156  general secretion pathway protein G  29.46 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02785  hypothetical protein  31.93 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000404727  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2857  general secretion pathway protein G  31.2 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3244  general secretion pathway protein GspG  31.93 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.948956  normal  0.749494 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4713  general secretion pathway protein G  42.25 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3424  general secretion pathway protein G  31.93 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3564  general secretion pathway protein G  25.6 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0156  general secretion pathway protein G  29.46 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.051245 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0152  general secretion pathway protein G  29.46 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0154  general secretion pathway protein G  25.6 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3106  putative general secretion pathway G transmembrane protein  38.75 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.590033  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0096  hypothetical protein  35.71 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.062594 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0006  general secretion pathway protein G  33 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0815216 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  40 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0159  general secretion pathway protein G  25.6 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0154  general secretion pathway protein G  25.6 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0534  hypothetical protein  27.72 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  31.82 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>