More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2997 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2997  type II secretion system protein G  100 
 
 		 135 aa  278  2e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000413298 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1286  type II secretion system protein G  92.59 
 
 		 135 aa  246  1e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1931  type II secretion system protein G  67.19 
 
 		 138 aa  184  5e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000053439  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1460  type II secretion system protein G  60.56 
 
 		 153 aa  173  6e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52288  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1857  N-terminal methylation  56.83 
 
 		 140 aa  171  3.9999999999999995e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2413  type II secretion system protein G  58.62 
 
 		 149 aa  166  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330838  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3311  fimbrial protein pilin  62.7 
 
 		 137 aa  159  9e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1776  pilin domain-containing protein  60.98 
 
 		 121 aa  148  3e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0138  putative pilus assembly protein  54.01 
 
 		 149 aa  147  4e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1999  general secretion pathway protein G  50 
 
 		 131 aa  127  6e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2581  N-terminal methylation site  49.6 
 
 		 138 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1441  type II secretion system protein G  44.19 
 
 		 129 aa  121  3e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000189967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1334  methylation  47.62 
 
 		 133 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.372792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3886  type II secretion system protein G  44.09 
 
 		 122 aa  119  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3218  general secretion pathway protein G  45.8 
 
 		 126 aa  117  4.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.427151 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2470  type II secretion system protein G  42.64 
 
 		 124 aa  114  6e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.335351  normal  0.427711 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2412  methylation  43.65 
 
 		 126 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3476  type II secretion system protein G  42.64 
 
 		 128 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0390478  normal  0.854758 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2461  type II secretion system protein G  42.64 
 
 		 124 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.508549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2295  type II secretion system protein G  42.64 
 
 		 124 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.478951  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00348  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  43.31 
 
 		 128 aa  110  5e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29080  general secretion pathway protein G  42.64 
 
 		 124 aa  108  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02979  putative general secretion pathway GSPG related transmembrane protein  44.26 
 
 		 129 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.811632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1302  type II secretion system protein  47.58 
 
 		 124 aa  105  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0879623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1989  hypothetical protein  37.98 
 
 		 124 aa  105  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0788365  normal  0.18788 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1440  type II secretion system protein G  43.94 
 
 		 131 aa  103  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0197781  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2621  type II secretion system protein G  44.07 
 
 		 184 aa  98.6  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4704  Type II secretion system protein G  43.48 
 
 		 145 aa  98.2  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0140964  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2301  putative GSPG-related protein  43.64 
 
 		 130 aa  96.3  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.152629  normal  0.0321295 
 
 
-
 
NC_003296  RS02978  putative general secretion pathway GSPG related transmembrane protein  40.76 
 
 		 172 aa  92.8  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.671308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3217  N-terminal methylation site  36.88 
 
 		 159 aa  90.5  7e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.280155 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2413  methylation  38.46 
 
 		 157 aa  90.1  8e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29090  general secretion pathway protein G  35.48 
 
 		 160 aa  82.4  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.260708  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1440  type II secretion system transmembrane protein  33.54 
 
 		 158 aa  82.8  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00799419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1301  type II secretion system protein  36.18 
 
 		 168 aa  80.9  0.000000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.12689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2582  N-terminal methylation site  30.77 
 
 		 170 aa  78.6  0.00000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3885  hypothetical protein  33.55 
 
 		 161 aa  78.2  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1930  hypothetical protein  32.93 
 
 		 164 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000900532  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4705  putative secretion type II protein  36.31 
 
 		 176 aa  77.4  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0420147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1678  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  33.12 
 
 		 163 aa  77.4  0.00000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4795  putative general (Type II) secretion pathway protein  32.61 
 
 		 223 aa  77  0.00000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.954024  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00349  putative general secretion pathway GSPG-related transmembrane protein  34.44 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1858  N-terminal methylation  33.12 
 
 		 161 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.450176 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1777  hypothetical protein  32.53 
 
 		 177 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00171207  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1988  hypothetical protein  33.12 
 
 		 157 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0923651  normal  0.190547 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0137  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  35.44 
 
 		 161 aa  73.6  0.0000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2302  GSPG-like signal peptide protein  33.33 
 
 		 172 aa  72  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.186261  normal  0.0333639 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1998  general secretion pathway protein G  34.27 
 
 		 140 aa  71.2  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  40.66 
 
 		 142 aa  68.2  0.00000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1316  type II secretory pathway protein LspG  38.14 
 
 		 140 aa  67  0.00000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1313  type II secretory pathway protein LspG  38.14 
 
 		 140 aa  67  0.00000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55490  HxcT pseudopilin  38.78 
 
 		 149 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.04599 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4829  HxcT pseudopilin  38.78 
 
 		 149 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3312  general secretion pathway protein G  31.31 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0006  general secretion pathway protein G  36.36 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0815216 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1073  general secretion pathway protein G  38.61 
 
 		 155 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.56277  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1999  fimbrial protein  43.08 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1439  general secretion pathway GspG related transmembrane protein  34.59 
 
 		 160 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0119159  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1865  pilus assembly protein  34.86 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  38.46 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2620  putative general secretion pathway GspG related transmembrane protein  30.43 
 
 		 159 aa  64.3  0.0000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3940  general secretion pathway protein G  33.98 
 
 		 154 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.18178 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3074  general secretion pathway protein G  35.35 
 
 		 158 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016497 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4497  general secretion pathway protein G  33.98 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.13255 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0100  general secretion pathway protein G  35.58 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2857  general secretion pathway protein G  36.08 
 
 		 157 aa  62  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3128  general secretion pathway protein G  38 
 
 		 165 aa  62.8  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0729977 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3419  general secretion pathway protein G  37.25 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000422428 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1415  general secretion pathway protein G  35 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1302  general secretion pathway protein G  34.65 
 
 		 153 aa  62  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5689  general secretion pathway protein G  37.76 
 
 		 158 aa  62  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128164  normal  0.128064 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3179  general secretion pathway protein G  36.63 
 
 		 152 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.223664  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0253  general secretion pathway protein G  38.61 
 
 		 150 aa  62  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1473  general secretion pathway protein G  34.65 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.660645  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24020  general secretion pathway protein G  36.36 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2923  general secretion pathway protein G  31.54 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.370501  normal  0.274003 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.11 
 
 		 168 aa  61.2  0.000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2032  general secretion pathway protein G  36.36 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2612  general secretion pathway protein G  35.42 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.688921 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0682  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  33.64 
 
 		 165 aa  61.2  0.000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0723462  hitchhiker  0.000000000174273 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2414  general secretion pathway protein G  32.74 
 
 		 164 aa  60.8  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02835  hypothetical type II secretion protein GspG  32.69 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000370073  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3135  general secretion pathway protein G  32.69 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02785  hypothetical protein  32.69 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000404727  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3564  general secretion pathway protein G  32.38 
 
 		 144 aa  60.5  0.000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3221  general secretion pathway protein G  36.27 
 
 		 163 aa  60.5  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3424  general secretion pathway protein G  32.69 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3384  general secretion pathway protein G  37.37 
 
 		 154 aa  60.5  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0058  general secretion pathway protein G  34.34 
 
 		 150 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109015  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0077  general secretion pathway protein G  34.34 
 
 		 150 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3409  general secretion pathway protein GspG  32.69 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0012  general secretion pathway protein G  34.34 
 
 		 150 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0048  general secretion pathway protein G  34.34 
 
 		 150 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.503149  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0058  general secretion pathway protein G  34.34 
 
 		 150 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.26 
 
 		 157 aa  60.1  0.000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0169  general secretion pathway protein G  32.35 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3244  general secretion pathway protein GspG  32.69 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.948956  normal  0.749494 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3240  general secretion pathway protein G  34.34 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0156  general secretion pathway protein G  32.35 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.051245 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1081  general secretion pathway protein G  38.54 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464773  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>