More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2621 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_2621  type II secretion system protein G  100 
 
 
184 aa  366  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2301  putative GSPG-related protein  61.06 
 
 
130 aa  142  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.152629  normal  0.0321295 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4704  Type II secretion system protein G  61.76 
 
 
145 aa  133  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0140964  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1302  type II secretion system protein  57.41 
 
 
124 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0879623  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1989  hypothetical protein  55.24 
 
 
124 aa  125  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0788365  normal  0.18788 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1441  type II secretion system protein G  58.25 
 
 
129 aa  123  1e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000189967  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3886  type II secretion system protein G  53.33 
 
 
122 aa  120  8e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2581  N-terminal methylation site  56.86 
 
 
138 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2470  type II secretion system protein G  46.72 
 
 
124 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.335351  normal  0.427711 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3476  type II secretion system protein G  45.08 
 
 
128 aa  118  6e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0390478  normal  0.854758 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2295  type II secretion system protein G  45.08 
 
 
124 aa  117  7e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.478951  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2461  type II secretion system protein G  44.26 
 
 
124 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.508549  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3218  general secretion pathway protein G  50.44 
 
 
126 aa  115  5e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.427151 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1460  type II secretion system protein G  51.89 
 
 
153 aa  114  7.999999999999999e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52288  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3311  fimbrial protein pilin  48.44 
 
 
137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2412  methylation  45.37 
 
 
126 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29080  general secretion pathway protein G  47.5 
 
 
124 aa  111  5e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1857  N-terminal methylation  44.26 
 
 
140 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_003296  RS00348  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  46.34 
 
 
128 aa  108  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1334  methylation  50 
 
 
133 aa  109  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.372792  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02979  putative general secretion pathway GSPG related transmembrane protein  43.8 
 
 
129 aa  107  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.811632  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1931  type II secretion system protein G  47.01 
 
 
138 aa  105  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000053439  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0138  putative pilus assembly protein  44.83 
 
 
149 aa  99.4  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2997  type II secretion system protein G  44.07 
 
 
135 aa  98.6  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000413298 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2413  type II secretion system protein G  47.87 
 
 
149 aa  98.2  5e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330838  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1776  pilin domain-containing protein  45.05 
 
 
121 aa  97.8  9e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1440  type II secretion system protein G  46.02 
 
 
131 aa  92  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0197781  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1999  general secretion pathway protein G  40.18 
 
 
131 aa  91.7  6e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607295  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1286  type II secretion system protein G  46.61 
 
 
135 aa  89.4  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4795  putative general (Type II) secretion pathway protein  37.7 
 
 
223 aa  72.8  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.954024  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1280  general secretion pathway protein G  35.29 
 
 
158 aa  68.2  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4829  HxcT pseudopilin  30.47 
 
 
149 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2582  N-terminal methylation site  34.96 
 
 
170 aa  62  0.000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55490  HxcT pseudopilin  28.15 
 
 
149 aa  62  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.04599 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1351  general secretion pathway protein G  31.75 
 
 
150 aa  61.2  0.000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.346821  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3044  general secretion pathway protein G  30.56 
 
 
159 aa  60.8  0.000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.21279  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1678  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  36.28 
 
 
163 aa  60.5  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1343  general secretion pathway protein G  35.04 
 
 
160 aa  60.5  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.657967  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0739  general secretion pathway protein G  31.69 
 
 
164 aa  60.5  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.430586  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3221  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 
156 aa  59.7  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.287852 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3384  general secretion pathway protein G  30.61 
 
 
154 aa  60.1  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3391  general secretion pathway protein G  30.61 
 
 
156 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0912  general secretion pathway protein G  38.89 
 
 
172 aa  59.7  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.429886 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1584  general secretion pathway protein G  39.13 
 
 
166 aa  59.3  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0906658 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4713  general secretion pathway protein G  40.23 
 
 
166 aa  59.3  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2612  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 
153 aa  59.3  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.688921 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1507  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  35.53 
 
 
121 aa  58.9  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000010883  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0534  hypothetical protein  34.88 
 
 
140 aa  58.9  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2310  putative GSPG-related transmembrane protein  38.61 
 
 
155 aa  58.5  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.164905  normal  0.125662 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1432  type II secretion systen protein G  34.07 
 
 
209 aa  58.5  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.412586  normal  0.909605 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0675  general secretion pathway protein G  29.79 
 
 
159 aa  58.2  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.186648  normal  0.343045 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0654  general secretion pathway protein G  29.79 
 
 
159 aa  58.5  0.00000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0121173  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4248  general secretion pathway protein G  28.47 
 
 
148 aa  58.2  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0347967 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3312  general secretion pathway protein G  28.42 
 
 
138 aa  58.2  0.00000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0802  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.14 
 
 
152 aa  57  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.964553  normal  0.826959 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0720  fimbrial protein pilin  33.85 
 
 
133 aa  57  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3419  general secretion pathway protein G  32.54 
 
 
150 aa  57.4  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000422428 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5689  general secretion pathway protein G  29.33 
 
 
158 aa  57  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128164  normal  0.128064 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29090  general secretion pathway protein G  41.51 
 
 
160 aa  57.8  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.260708  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1777  hypothetical protein  31.72 
 
 
177 aa  56.6  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00171207  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1049  general secretion pathway protein G  34.31 
 
 
151 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16150  General secretion pathway protein G  37.33 
 
 
145 aa  57  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.853983  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0816  type IV pilus biogenesis protein  33.85 
 
 
133 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3940  general secretion pathway protein G  28.78 
 
 
154 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.18178 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1073  general secretion pathway protein G  28.57 
 
 
155 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.56277  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1858  N-terminal methylation  35.58 
 
 
161 aa  56.6  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.450176 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2109  general secretion pathway protein G  42.42 
 
 
159 aa  56.2  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.117776  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0617  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.91 
 
 
158 aa  56.6  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.217435 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1046  general secretion pathway protein G  31.82 
 
 
144 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  35.62 
 
 
142 aa  56.2  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3179  general secretion pathway protein G  26.09 
 
 
152 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.223664  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2613  putative general secretion pathway protein G precursor (PilD-dependent protein pddA)  36.25 
 
 
163 aa  56.2  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1090  general secretion pathway protein G  34.31 
 
 
144 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319049  normal  0.327028 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1170  xcmT3  27.27 
 
 
129 aa  55.8  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2590  general secretion pathway protein G  35.87 
 
 
154 aa  55.5  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3128  general secretion pathway protein G  31.93 
 
 
165 aa  55.5  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0729977 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2916  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  30.89 
 
 
145 aa  55.5  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00346  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  33.71 
 
 
144 aa  55.5  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.887338  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0567  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.36 
 
 
147 aa  55.1  0.0000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  35.62 
 
 
142 aa  55.5  0.0000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02970  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  38.16 
 
 
144 aa  55.1  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0455058  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0058  general secretion pathway protein G  29.1 
 
 
150 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663302  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0058  general secretion pathway protein G  29.1 
 
 
150 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109015  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0012  general secretion pathway protein G  29.1 
 
 
150 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0077  general secretion pathway protein G  29.1 
 
 
150 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0048  general secretion pathway protein G  29.1 
 
 
150 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.503149  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2532  general secretion pathway protein G  28.91 
 
 
156 aa  54.7  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.211317  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.67 
 
 
157 aa  54.7  0.0000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3240  general secretion pathway protein G  29.1 
 
 
150 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0534  general secretion pathway protein G  30.08 
 
 
147 aa  54.3  0.0000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3221  general secretion pathway protein G  29.58 
 
 
163 aa  53.9  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2372  general secretion pathway protein G  28.46 
 
 
144 aa  53.9  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.411005  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3007  general secretion pathway protein G  36.92 
 
 
155 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.303532 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1081  general secretion pathway protein G  28.79 
 
 
146 aa  53.9  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464773  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4497  general secretion pathway protein G  28.06 
 
 
154 aa  53.9  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.13255 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02835  hypothetical type II secretion protein GspG  28.8 
 
 
151 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000370073  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1097  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.88 
 
 
151 aa  53.1  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.282151  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3074  general secretion pathway protein G  28.03 
 
 
158 aa  53.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000016497 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1301  type II secretion system protein  36.45 
 
 
168 aa  53.5  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.12689  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3885  hypothetical protein  33.55 
 
 
161 aa  53.1  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>